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《東北肉羊lpl基因多態(tài)性與肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學術(shù)論文-天天文庫。
1、分類號UDC密級編號專業(yè)碩士學位論文東北肉羊LPL基因多態(tài)性與肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析AssociationAnalysisofLPLGenePolymorphismandMeatQualityTraitsofNortheastMuttonSheep學位申請人：申正指導教師：趙淑娟教授合作教師：金海國研究員專業(yè)領(lǐng)域：養(yǎng)殖學位類別：農(nóng)業(yè)推廣碩士2015年06月獨創(chuàng)性聲明本人聲明，所呈交的論文是我個人在導師指導下完成的研究工作及取得的研究成果。據(jù)我所知，文中除了特別加以標注和致謝的地方外，不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成
2、果，也不包含為獲得河南科技大學或其它教育機構(gòu)的其他學位或證書而使用過的材料。與我一同工作的同志對本研究所做的任何貢獻均已在論文中作了明確的說明并表示了謝意。研究生簽名：日期：摘要摘要本試驗以脂蛋白脂肪酶(LipoproteinLipase,LPL)作為東北肉羊肉質(zhì)性狀的候選基因，研究其外顯子上的單核甘酸多態(tài)性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)位點及其與肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)，為改善肉羊肉質(zhì)及其遺傳育種提供分子生物學基礎(chǔ)。本試驗以48頭成年健康的東北肉羊肌肉組織樣本為材料，提取總RNA與
3、基因組DNA，采用RT-PCR和TA克隆方法成功克隆了東北肉羊的LPL基因cDNA序列并對其進行生物信息學分析；將LPL基因作為肉質(zhì)性狀的候選基因，應(yīng)用直接測序和PCR-RFLP相結(jié)合的方法對LPL基因部分外顯子進行SNPs篩選，并通過一般線性模型分析研究了LPL基因多態(tài)性與肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)。主要試驗結(jié)果如下：1.提取了總RNA，通過RT-PCR的方法，克隆了東北肉羊LPL基因的完整編碼序列，并對其進行了序列測定。對東北肉羊LPL基因完整編碼序列進行生物信息學分析，結(jié)果表明，東北肉羊LPL基因ORF（開放閱讀框）長1
4、437bp，共編碼了478個氨基酸。2.通過直接測序及PCR-RFLP技術(shù)，對東北肉羊LPL基因第3、4、5和6外顯子進行序列測定與多態(tài)性分析，發(fā)現(xiàn)LPL基因第3和4外顯子上存在SNPs位點，而第5和6外顯子則未發(fā)現(xiàn)SNPs位點。這些SNPs位點分別是：第3外顯子46bp處T/C(T304C)，第3外顯子126bp處A/T(A384T)，第4外顯子24bp處T/C(T462C)。這3個SNP位點都沒有引起氨基酸變異，屬于同義突變。3.對東北肉羊第3外顯子A384T突變位點進行酶切與基因分型，并統(tǒng)計基因頻率、基因型頻
5、率、χ2-Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)、基因純合度(Ho)、基因雜合度(He)、有效等位基因數(shù)(Ne)、多態(tài)信息含量(PIC)等數(shù)據(jù)。結(jié)果表明，東北肉羊群體在該位點的遺傳變異為低度多態(tài)(PIC＜0.25)，并處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P＞0.05)。4.對第3外顯子A384T突變位點各基因型與肉質(zhì)性狀進行關(guān)聯(lián)性分析，結(jié)果表明該位點TT型滴水損失極顯著高于TA型和AA型(P＜0.01)；TT型pH1值顯著高于TA型(P＜0.05)，與AA型則差異不顯著(P＞0.05)；壓榨損失、熟肉率和剪切力
6、性狀在各基因型間差異不顯著(P＞0.05)。TT型肉豆蔻酸含量顯著低于TA型和AA型(P＜0.05)；TT型棕櫚酸含量顯著低于TA型(P＜0.05)，與AA型則差異不顯著(P＞0.05)；其余脂肪酸含量在各基因型間差異不顯著(P＞0.05)。TT型甘氨酸含量顯著高于TA型(P＜0.05)，與AA型差異不顯著(P＞I摘要0.05)；TT型精氨酸含量顯著高于TA型和AA型(P＜0.05)；其余氨基酸含量在各基因型間差異不顯著(P＞0.05)。關(guān)鍵詞：肉羊；脂蛋白脂酶基因；序列分析；SNPs；肉質(zhì)性狀論文類型：研究類選題
7、來源：國家肉羊產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-39)IIABSTRACTABSTRACTIntheexperiment,LPLgeneisconsideredtobecandidategeneaffectingmeatqualitytraitsofnortheastmuttonsheep.MainlystudytheSNPsofexonandtheassociationbetweenSNPsandmeatqualitytraits.Theexperimentresultswouldprovidethemolecularbi
8、ologicalbasistomeatimprovementandgeneticbreedingofmuttonsheep.Muscletissuesfrom48healthyoldernortheastmuttonsheepwerecollectedtoextracttotalRNAandgenomicDNA.ThesequenceofLPLgenecDN
