ssr標(biāo)記與玉米自交系主要性狀的關(guān)聯(lián)分析

ssr標(biāo)記與玉米自交系主要性狀的關(guān)聯(lián)分析

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1、山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文SSR標(biāo)記與玉米自交系主要性狀的關(guān)聯(lián)分析姓名:張倩倩申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專(zhuān)業(yè):作物遺傳育種指導(dǎo)教師:張春慶20120614山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文中文摘要一些重要的分子標(biāo)記對(duì)玉米遺傳性狀的改良非常重要。本研究目的在于發(fā)掘與產(chǎn)量相關(guān)性狀顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn),對(duì)分子標(biāo)記輔助育種有重要的指導(dǎo)意義。以94份玉米自交系為試驗(yàn)材料,對(duì)調(diào)查的26個(gè)表型性狀進(jìn)行表型多樣性分析;在分子水平上,用204對(duì)SSR引物對(duì)其進(jìn)行遺傳多樣性、群體結(jié)構(gòu)和SSR標(biāo)記間的連鎖不平衡(LD)分析:最后,運(yùn)用基于全基

2、因組掃描的關(guān)聯(lián)分析策略尋找與產(chǎn)量相關(guān)性狀顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn),研究結(jié)果主要有以下幾個(gè)方面:1.對(duì)該群體材料調(diào)查的26個(gè)表型性狀進(jìn)行表型多樣性分析。用SPSS軟件對(duì)2010年和2011年兩年性狀做相關(guān)分析。然后對(duì)兩年性狀的均值進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。軸重的變化范圍為7.56-48.379,變幅最大,平均值為23.979,變異系數(shù)為37.88%。成熟期的變化范圍為87.107天,變幅最小,平均值為97天,變異系數(shù)為4.76%。該群體材料26個(gè)性狀均符合正態(tài)分布。這一變化反映出我們的群體材料有廣泛的表型多樣性,并且可

3、以用做關(guān)聯(lián)分析。2.利用均勻分布于玉米lO條染色體的204對(duì)SSR引物對(duì)94份玉米自交系進(jìn)行遺傳多樣性分析。結(jié)果表明,204對(duì)引物共檢測(cè)到1286個(gè)等位變異,平均每個(gè)標(biāo)記6.3個(gè)等位變異,變化范圍為2.16個(gè)。PIC值和基因多樣性值在每條染色體上分布均勻,平均值分別為O.61和O.66。基因多樣性的最大值為O.8849,PIC值的最大值為0.8738,材料特性豐富。這表明本研究群體材料的遺傳多樣性較高。3.群體結(jié)構(gòu)分析表明,當(dāng)Ak=5時(shí),得到最優(yōu)分群結(jié)果,可以將自交系劃分為5大種質(zhì)類(lèi)群,且分別對(duì)

4、應(yīng)于我國(guó)玉米自交系的五大雜種優(yōu)勢(shì)群:旅大紅骨、四平頭、PB、Reid和BSSS群。以遺傳相似性比例Q堂70%為劃分標(biāo)準(zhǔn),有73.40/0的自交系被歸到相應(yīng)的類(lèi)群中,而其他材料遺傳相似比例

5、平下,2010年和2011年分別有138和96個(gè)標(biāo)記與26個(gè)性狀關(guān)聯(lián),兩年性狀均值的關(guān)聯(lián)位點(diǎn)有106個(gè)。2010年和2011年只有6個(gè)重復(fù)的關(guān)聯(lián)位點(diǎn)。而這6個(gè)關(guān)聯(lián)位點(diǎn)與兩年數(shù)據(jù)均值比較得到3個(gè)重復(fù)的關(guān)聯(lián)SSR標(biāo)記與玉米自交系主要性狀的關(guān)聯(lián)分析位點(diǎn)。找到了一些強(qiáng)的關(guān)聯(lián)位點(diǎn),如在P<0.01水平下,umcl917分別和散粉期(AD)和百粒重(I-IKW)相關(guān)聯(lián),umcl397分別和軸粗(CD)和出籽率(KRO)相關(guān)聯(lián),在P<0.001水平下,umc2025和軸粗(CD)關(guān)聯(lián)。發(fā)現(xiàn)了一些新的關(guān)聯(lián)位點(diǎn),

6、如bnl92162,bnlglll8,phi077,umcl161和苞葉長(zhǎng)(BYC)相關(guān)聯(lián),bnlgll18和成熟期綠葉數(shù)(GLN)相關(guān)聯(lián)。5.探討遺傳距離與產(chǎn)量雜種優(yōu)勢(shì)的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)遺傳距離與畝產(chǎn)量存在顯著相關(guān),相關(guān)系數(shù)為r=0.45”,建立數(shù)學(xué)模型.問(wèn).34422.9.96氟2+9.729x-2.089。遺傳成分AQ值與畝產(chǎn)量也存在顯著相關(guān),r--0.50¨,建立數(shù)學(xué)模型尸∞.069x3-0.136x2+0.399。昌7—2是典型的SPT群,而齊319是典型的PB群,其遺傳距離較遠(yuǎn)為1.104

7、9,因而其組配的雜交種的畝產(chǎn)量屬于高產(chǎn)組合。一些遺傳距離比較近的自交系,其組配的雜交種,被歸為了低產(chǎn)組合。Reid和SPT,Reid和LRC,SPT和PB群組配的雜交組合產(chǎn)量較高。本研究結(jié)果對(duì)育種實(shí)踐有一定的指導(dǎo)意義。關(guān)鍵詞:玉米自交系;SSR標(biāo)記;遺傳多樣性;群體結(jié)構(gòu);關(guān)聯(lián)分析2山東農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文AbstractThegeneticmarkersofimportanttraitsareevaluatedinordertoimprovethemaizeinbredlines.Theobje

8、ctivesofourresearchweretofindsomeimportantyieldrelatedtraits而血strongassociationsofloci,whichwouldbeusefulforgeneticimprovementandmolecularmaker-assistedbreedinginmaize.Ninety—fourmaizeinbredlineswereusedtoaSSeSSthegeneticandphenotypicdiversityandmake

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