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《利用外顯子組測(cè)序篩選一個(gè)arca家系的致病基因》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、中圖分類號(hào)脅，碩士學(xué)位論文學(xué)校代碼!Q533密級(jí)公玨利用外顯子組測(cè)序篩選一個(gè)ARCA家系的致病基因ScreeningforthecausativegeneinanAutosomalRecessiveCerebeUarAtaxiapedigreeusingExomeSequencing作者姓名：嚴(yán)偉倩學(xué)科專業(yè)：臨床醫(yī)學(xué)研究方向：神經(jīng)病學(xué)學(xué)院(系、所)：湘雅醫(yī)院指導(dǎo)教師：唐北沙教授論文答辯日期塑!窒!!：蘭鄉(xiāng)答辯委員會(huì)主中南大學(xué)二O一三年五月原創(chuàng)性聲明本人聲明，所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究
2、成果。盡我所知，除了論文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過(guò)的研究成果，也不包含為獲得中南大學(xué)或其他單位的學(xué)位或證書而使用過(guò)的材料。與我共同工作的同志對(duì)本研究所作的貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說(shuō)明。作者簽名：墨使筠日期：旦年』月』日學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本人了解中南大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，即：學(xué)校有權(quán)保留學(xué)位論文并根據(jù)國(guó)家或湖南省有關(guān)部門規(guī)定送交學(xué)位論文，允許學(xué)位論文被查閱和借閱；學(xué)?？梢怨紝W(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容，可以采用復(fù)印、縮印或其它手段保存學(xué)位論文。同時(shí)授權(quán)中國(guó)科學(xué)技術(shù)信
3、息研究所將本學(xué)位論文收錄到《中國(guó)學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù)》，并通過(guò)網(wǎng)絡(luò)向社會(huì)公眾提供信息服務(wù)。日期：型王年—明』日摘要利用外顯子組測(cè)序篩選一個(gè)ARCA家系的致病基因背景：常染色體隱性遺傳小腦性共濟(jì)失調(diào)(Autosomalrecessivecerebellarataxia，ARCA)是一組比較罕見的單基因遺傳性疾病，以小腦性共濟(jì)失調(diào)為主要臨床表現(xiàn)，具有顯著的臨床及遺傳異質(zhì)性，迄今為止，已發(fā)現(xiàn)有20余種亞型。全基因外顯子組測(cè)序是最近興起的尋找疾病致病基因的一種高效、經(jīng)濟(jì)的研究方法，對(duì)常見和罕見變異具有高度敏感性。目的：本研究對(duì)
4、一例常染色體隱性遺傳性小腦性共濟(jì)失調(diào)家系進(jìn)行外顯子組測(cè)序分析結(jié)合純合子定位來(lái)篩選該疾病的候選致病基因。方法和結(jié)果：我們對(duì)家系內(nèi)兩名患者進(jìn)行了外顯子組測(cè)序，在2個(gè)樣本中檢測(cè)到單核苷酸變異位點(diǎn)的數(shù)目分別為10917個(gè)和10354個(gè)，其中有722個(gè)單核苷酸變異位點(diǎn)為兩樣本所共有，插入缺失(Insertion—deletion，Indel)的數(shù)目分別為575個(gè)和560個(gè)，72個(gè)為兩樣本共有。經(jīng)過(guò)已知公共數(shù)據(jù)庫(kù)的過(guò)濾以及純合區(qū)域的定位，最后篩選出8個(gè)新發(fā)的純合單核苷酸變異位點(diǎn)：SSRPJ『基因(Intron8，IVS8—10c
5、>t)、TTYH2基因c．7109>a(p．R237H)、TNKSlBPl基因c．40159>a(p．V1339M)、UBE20基因C．16099>a(p．D537N)、RCOR2基因c．6349>a(p．V212M)、MZT2B基因c．341c>t(p．A114V)、CCDC74A基因c．506t>c(p．M169T、)、OR5J2基因c．831c>g(p．F277L)。利用在線數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)這8個(gè)新發(fā)序列變異位點(diǎn)所在基因進(jìn)行生物功能分析，并利用Sanger測(cè)序方法對(duì)家系內(nèi)成員進(jìn)行共分離驗(yàn)證，發(fā)現(xiàn)SSRPI基因和OR5J
6、2基因的序列變異與表型共分離。這兩個(gè)基因是否為致病基因還有待進(jìn)一步的驗(yàn)證。通過(guò)功能分析，我們猜測(cè)與DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄及修復(fù)有關(guān)的SSRPI基因?yàn)楹蜻x致病基因的可能性大，況且SSRPl基因定位在我們確定的高可信純合區(qū)間內(nèi)。結(jié)論：本研究通過(guò)外顯子組測(cè)序結(jié)合純合子定位的方法將該家系的候選致病基因鎖定在SSRPl基因和OR5J2基因；建立了利用外顯子組測(cè)序結(jié)合純合子定位法克隆ARCA致病基因的技術(shù)平臺(tái)。II關(guān)鍵詞：常染色體隱性遺傳小腦性共濟(jì)失調(diào)；全基因外顯子組測(cè)序；純合子定位；致病基因IIIScreeningforthecau
7、sativegeneinanAutosomalRecessiveCerebellarAtaxiapedigreeusingExomeSequencingABSTRACTBackground：Autosomalrecessivecerebellarataxia，withthecerebellarataxiaasitsmainclinicalmanifestationisararemonogenicgeneticdisease，whichcomprisesalargegroupofclinicallyandgenetic
8、allyheterogeneousneurodegenerativedisorderswithmorethan20differentformscurrentlyrecognized．Whole—exomesequencingisapowerfulandcost—effectivenewresearchtechnologyfordissectin
