小麥aflp片段序列多態(tài)性分析和aflp-scar標記的研究

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1、萬方數(shù)據(jù)麥類作物學報2007,27(6):943—95111竺墜竺墜!!:!!!!!竺小麥An伊片段序列多態(tài)性分析和An『P-sCAR標記的研究王立新1,常利芳1,黃嵐2’1,王曉維“1,趙昌平11.北京市農(nóng)林科學院/北京雜交小麥工程掛木研究中心,北京100097}2.華中農(nóng)業(yè)大學生命科學技術學院,湖北武漢430070,3.內(nèi)蒙占農(nóng)業(yè)大學生物_亡程學院.內(nèi)蒙古呼和浩特010018)摘要:為了解相同長度的AFLP片段中DNA序列的多態(tài)-雎,對70務小麥AFLP片段進行回收、克隆以廈測序分析,比較了不同品種閫相同長度的AFLP片

2、段.一奪AFLP片段的不同單克隆以廈品種問非多態(tài)性AFLP片段的DNA序列。對70十片段構成的98時同長片段進行DNA序列比對,結果表明:(1)只有3對片段的序列100%相同,其他95時片段之問DNA序列差異為1%~70“;(2)不同小麥品種問同長的AnJ片段中普遍存在DNA序列完奎不同、部分不同和具有sNP的現(xiàn)象;(3)一務回收的AFLP帶紋的不同單克隆之聞也存在DNA序列完奎不同、部分不同和具有sNP的現(xiàn)象}(4)品種問有些非多態(tài)性AFLP片段的ⅡNA序列也存在多態(tài)性。揭示了小麥三套基因組闡AFLP等位基因的多態(tài)性,牲廈

3、不同AFLP位點同長片段的DNA序列多態(tài)性.對AFLP標記的使用提出了一些不同看法,井提出了利用AFLP片段的序列多志性設計scAR引物的方法。關鍵詞:小麥;AFLP標記;多態(tài)性;AFLP—ScAR標記中圈分類號:S512.1:s330文獻標識碼:A文章編號:1009一104112007)06一0943一09SequencePoIymorphismofWheatAFLPFragmentsandConversionofAFLPMarkertoSCARMarkerWANCLi。xiⅡ1,CHANGLi。fhn91,HUANGLa

4、Ⅱ2~。WANGXiaorwer”,ZHAoChan}pin91(1.BeUlngEnginee^”gandTechnlqueResearchCenter。fH巾r耐wheat,BelJlng100097tchin8I2.colIegeofLlfeScI㈣andTechnoIogy,HuazhongAgrlcuIturaIUnlve咧1y.Wuhan,Hubei430070,Chin8;3.B10logyEngiDe曲ng1丁】st工tuteo¨?rMongolIaAgr刪ltureUnI?5ity,Hohhot,1眥rMo

5、ng。lla010018,China)Abstmct:Amplifiedfragmentlengthpolymorphism(AFLP)isaneffIcienttechniquetojdentifyDNAfr89mentlengthp01ymo。phism,whichwaswidelyusedforgeneticdiversityanaIysis,constructionofgeneticmapsandgenesmappi“ginfu“gi,animals,plantsandinsect.Butsomeworkscould

6、notgetexpectantresultwhileamplifiedfragmentle“gthpolymorphismincludedsequencespolym。rphism,singlenucleotIdep01ymorphisms(SNPs)andinsertionsanddeletions(indel).TounderstandDNAsequencep01ymorphismofwheatAFLPfragments,wecompared30pairfragmentsinwhicheverypairfr89ments

7、werethesamesizebutfromdifferentcultivars,andother15pairfragmentsinwhicheverypairfragmentsfr。mthesameband.Thesequencesofeverypairfragmentswerenotallidenti—cal.Thedifferenceofeachpairfragmentswere1%~70%.Evennon—p01ymorphicbandsbetweencu卜tivarscontainedmultiplefragmen

8、tsw“hsequencedifference.Inthisstudywepresentsequencediffer-encesof95pairfragmentswiththesameslzefrom64wheatAFLPbandsandtheyshould10catedif—ferent

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