水稻粒型性狀的遺傳研究及主效qtl的精細(xì)定位

水稻粒型性狀的遺傳研究及主效qtl的精細(xì)定位

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1、萬方數(shù)據(jù)浙江師范大學(xué)化學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院CollegeofChemistry&LifeSeience,ZhejiangNormalUniversity水稻粒型性狀的遺傳研究及主效QTL的精細(xì)定位碩士研究生:江靜學(xué)科專業(yè):植物學(xué)指導(dǎo)教師:錢前研究員申請學(xué)位類別和級別:理學(xué)碩士學(xué)位RESEARCHoNGENETICSoFRICEGRAINSHAPEANDFINEM隊PPINGoFITSM隊JoRQTLMs.Candidate:JingJiangSpecialtyIBotanyAdvisor:Prof.QianQianDegree:MasterofScience提交日期:2014年4月(April

2、,2014)萬方數(shù)據(jù)水稻粒型性狀的遺傳研究及主效QTL的精細(xì)定位摘要水稻(OryzasativaL)是人類主要的糧食作物,也是單子葉模式植物。全球50%以上的人口以大米為主食。估計到2030年水稻產(chǎn)量將增加40%A’能滿足世界人口日益增長的需要。因此,在水稻種植面積不變或下降的前提下,如何增加水稻的產(chǎn)量已經(jīng)成為了水稻育種家們必須面對的一個嚴(yán)峻問題。水稻產(chǎn)量作為一個復(fù)雜的農(nóng)藝性狀,主要是由有效穗數(shù)、每穗粒數(shù)、粒重三個因素決定的。這些復(fù)雜的重要農(nóng)藝性狀大多是由多基因控制的,稱為數(shù)量性狀位點(diǎn)(quantitativetraitloci;QTLs)。它并不像單基因那樣出現(xiàn)雙峰或三峰,而是表現(xiàn)出連續(xù)

3、變異現(xiàn)象。粒型不僅與水稻產(chǎn)量三要素中的粒重密切相關(guān),而且還決定了稻米產(chǎn)品的市場價值。因此,闡明水稻粒型的遺傳機(jī)制顯得十分重要。本實(shí)驗在前人對粒型和粒重QTL定位與克隆的研究基礎(chǔ)上,利用秈秈交(培矮64s和93-11)獲得的超級雜交稻兩優(yōu)培九衍生而來的132個重組自交系(RIL)群體,結(jié)合本實(shí)驗室構(gòu)建的高密度SNP連鎖圖譜,通過MultiQTL分析軟件在2011年杭州富陽和2012年海南陵水兩地共檢測到了32個LOD>2.5的控制稻谷粒長、粒寬、長寬比和千粒重的QTL。包括7個粒長QTL,11個粒寬QTL,10個長寬比QTL,4個千粒重QTL。這些QTL分布于水稻1、2、3、4、5、6、7、

4、8、9、11號染色體上。其中qGLl.-、qGL3、qGW2和牡W14個QTL在兩地均被檢測到。并且檢測到的qGL3經(jīng)過進(jìn)一步的精細(xì)定位和測序分析,發(fā)現(xiàn)與已經(jīng)報導(dǎo)的GS3等位。利用SPSS軟件對以上4個性狀進(jìn)行相關(guān)性分析(雙尾t測驗),發(fā)現(xiàn)粒長與千粒重、長寬比均呈顯著正相關(guān);粒寬與千粒重呈正相關(guān),而與長寬比呈負(fù)相關(guān)。檢測到的32個QTL的正向加性效應(yīng)來自親本93-11,負(fù)向加性效應(yīng)來自親本培矮64s(PA64s)。萬方數(shù)據(jù)從檢測到的QTL中挑選了一個LOD值為8.2、貢獻(xiàn)率高達(dá)16.2%(2012年海南的數(shù)據(jù)),并且在富陽和海南均被檢測到的一個粒長QTI叫GLl..,,它己初定位在SNP標(biāo)

5、記卜8至卜35之間。根據(jù)93-11和PA64s的測序結(jié)果,發(fā)展了新的分子標(biāo)記,結(jié)合2,401個RILF9代群體的株系和構(gòu)建的BC2F2群體(2,887個單株),最終將qGLl.,定位在Indel標(biāo)記JLK7與JLKl7之間的540kb物理距離內(nèi)。關(guān)鍵詞:.水稻(OryzasativaL);粒型;QTL;初定位;精細(xì)定位II萬方數(shù)據(jù)RESEARCH0NGENETICSOFIUCEGRAINSHAPEANDFINEMAPPINGOFITSMAJORQTLABSTRACTRice(OryzasativaL.)isoneofthemainfoodcrops,andalsoam6delformono

6、cotplant.Itprovidesmorethan50%ofthefoodfortheworldpopulation.Ithasbeenestimatedthatitrequirea40%increaseinriceproductionby2030tomeetthegrowingworldpopu】ation.Therefore,howtoincreasethericeproductionwithdecreasedcultivatedareahasbecomeaseriousproblemforbreeders.Grainyield,acomplexagronomictraitinri

7、ce,ismainlydeterminedbyitsthreemajorcomponenttraits:numberofeffectivepanicles,numberofgrainsperpanicle,andgrainweight.Mostofthesecomplexagronomictraitsarecontrolledbymultiplegenes,knownasquantRativetraitloci(QTLs

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