水稻粒型和粒重性狀主效qtl定位地研究

水稻粒型和粒重性狀主效qtl定位地研究

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資源描述:

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1、廈門大學(xué)碩士論文摘要水稻特殊種質(zhì)資源是解析水稻基因組功能的重要途徑。水稻粒型(粒長、粒寬和長寬比)和千粒重性狀與稻米外觀、產(chǎn)量及市場價值密切相關(guān),發(fā)掘控制水稻粒型和千粒重的主效基因是當(dāng)前遺傳學(xué)家和育種家們共同關(guān)注的焦點。本研究采用大粒種(JFl71和JFl78)和小粒種(JF222和Samba)做親本,構(gòu)建兩個F。群體——JFl7l/Samba群體和JF222/JFl78群體;應(yīng)用微衛(wèi)星標(biāo)記(simplesequencerepeats,SSR),通過基于目標(biāo)性狀表現(xiàn)型的分離群體分組分析法(bulk

2、sergeantanalysis,BSA)構(gòu)建遺傳框架圖;采用混合線形模型復(fù)合區(qū)間定位法(mixed—modeIbasedcompositeintervalmapping,MICM)對控制水稻谷粒粒型(粒長、粒寬和長寬比)和千粒重的主效基因進(jìn)行QTL定位分析,并估算其效應(yīng)值。本研究主要結(jié)果如下:(1)JFl71/Samba和JF222/JFl78兩個群體谷粒粒型和千粒重性狀間的相關(guān)性分析結(jié)果表明:粒長與粒寬、長寬比、千粒重均呈極顯著正相關(guān);粒寬與長寬比呈極顯著負(fù)相關(guān);長寬比與千粒重呈極顯著正相關(guān)。

3、(2)應(yīng)用SSR標(biāo)記和BSA法構(gòu)建兩個群體的局部遺傳連鎖圖,JFl71/Samba群體構(gòu)建了4個連鎖群,分布于1、2、6和8號染色體;JF222/JFl78群體構(gòu)建了5個連鎖群,分布于2、5、6、8和10號染色體。(3)兩群體均在2號染色體長臂中下部一個相對較小的區(qū)間RM263一RM318檢測到控制谷粒粒型(粒長、粒寬和長寬比)和千粒重性狀的主效QTL,以加性效應(yīng)為主,加性效應(yīng)貢獻(xiàn)率在18%-'-'60%,圖譜距離約為18cM,它們的位置部分極為相近或在同一位點。JFl7l/Samba群體在2號染

4、色體定位到的主效QTL:口化名一』(粒長QTL)位于標(biāo)記區(qū)間RM221-RM573,加性效應(yīng)貢獻(xiàn)率22.47%;9舭J(粒寬QTL)和口昭肛乒』(千粒重QTL)位于標(biāo)記區(qū)間RM318一RM525,加性效應(yīng)貢獻(xiàn)率分別為40.02%和23.62%。JF222/JFl78群體在2號染色體定位到的主效QTL:q6L誓玖粒長QTL)和qGS-2-2(長寬比QTL)位于標(biāo)記區(qū)間RMl3838一RMl3840,加性效應(yīng)貢獻(xiàn)率分別為60.46%和17.94%;口鐘誓誓(粒寬QTL)和酈腳誓(千粒重QTL)位于標(biāo)記

5、區(qū)間RM263-RMl3838,加性效應(yīng)貢獻(xiàn)率分別為31.49%和59.66%。同時兩個群體都檢測到微效QTL,分布于5、8和lO號染色體。(4)分析表明:本研究在2號染色體長臂P瑚263一RM318區(qū)間定位到控制水稻廈門人學(xué)碩十論文谷粒粒型和千粒重性狀的QTL,是一個尚未被精細(xì)定位和克隆的粒型和千粒重性狀的主效QTL。這為今后應(yīng)用分子標(biāo)記輔助選擇大粒優(yōu)質(zhì)新品種和圖位克隆提供了科學(xué)理論依據(jù)。關(guān)鍵詞:水稻:粒型;粒重:數(shù)量性狀基因座;基因定位II廈門大學(xué)碩士論文AbstractStudyingspe

6、cialgermplasmresourceisartimportantwaytorevealricegenomiefunction.Grainshapetraitsincludinggrainlength(GL),grainwidth(GW)aswellaslength/widthratio(GS)and1000一grainweight(KGW)arecloselyassociatedwithriceappearancequality,yieldandmarketvalue.Inthisstudy

7、,weselectedlargegrainparent(JFl71andJFl78)andsmallgrainparent(JF222andSamba)toestablishtwoF2populations(JF17l/SambapopulationandJF222/JF178population),andgeneticlinkagemapswereconstructedbasedonSSR(simplesequencerepeats)markerandBSA(bulksergeantanalys

8、is)method.TheQTLmappinganalysisofrelatedtraitswasconductedbyMICM(mixed—modelbasedcompositeintervalmapping)methodinthetwoF2populations.Mainresultsshowedasfollows:(1)CorrelationanalysisinbothF2populationsindicatedthatGLwasahighlysignificantlypos

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