甘薯種質(zhì)資源的srap鑒定及遺傳多樣性分析

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1、核農(nóng)學(xué)報(bào)2013，27(5):0568～0575568JournalofNuclearAgriculturalSciences文章編號(hào):1000-8551(2013)05-0568-08甘薯種質(zhì)資源的SRAP鑒定及遺傳多樣性分析1，231，21，21，21，2張凱羅小敏蔣玉春吳正丹王季春唐道彬12(西南大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物科技學(xué)院，重慶400716;重慶市甘薯工程3技術(shù)研究中心，重慶400716;重慶市農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣總站，重慶401121)摘要:為了拓寬甘薯育成品種的遺傳背景，篩選優(yōu)良親本，提高育種效率，本研究利用SRAP標(biāo)記對(duì)48份主要甘薯種質(zhì)資源進(jìn)行了遺傳多樣性分析。結(jié)果表明，

2、隨機(jī)選用的37對(duì)SRAP引物中29對(duì)引物具有多態(tài)性，引物多態(tài)性比率為78.4%，共獲得126條多態(tài)性譜帶，平均每對(duì)引物產(chǎn)生4.3條多態(tài)性譜帶，表現(xiàn)出較高的多態(tài)性。48份種質(zhì)材料的SRAP遺傳距離為0.037～0.601，當(dāng)遺傳距離L1=0.46時(shí)，48份材料被聚為6個(gè)類群，包括1個(gè)復(fù)合大類群和5個(gè)獨(dú)立類群，其中第Ⅰ復(fù)合大類群又包括7個(gè)亞類群，聚類結(jié)果與系譜吻合性較好。采用5個(gè)重要農(nóng)藝性狀對(duì)供試材料進(jìn)行了聚類分析，L1=3.20時(shí)，48份材料也可被聚為6個(gè)類群，聚類結(jié)果與依據(jù)SRAP標(biāo)記聚類分析的結(jié)果差異較大。甘薯種質(zhì)資源間的遺傳差異與地理來源無必然聯(lián)系。關(guān)鍵詞:甘薯;遺傳多

3、樣性;聚類分析;SRAP;農(nóng)藝性狀［23－26］甘薯(IpomoeabatatasL．)是世界上重要的糧食、析等研究，具有經(jīng)濟(jì)、簡(jiǎn)便、穩(wěn)定性好、重復(fù)性高、［1］［4，20］飼料、工業(yè)原料及新型能源用塊根作物。近年來中便于克隆測(cè)序目標(biāo)片段的特點(diǎn)。將農(nóng)藝性狀為主國(guó)甘薯品種改良取得了顯著進(jìn)展，育成了大量品種，打的表型分析和分子水平的檢測(cè)相結(jié)合，已經(jīng)成為目前［2］［27］破了以國(guó)外引進(jìn)甘薯品種為主的格局，但是目前的檢測(cè)遺傳多樣性的有效手段，但在甘薯中應(yīng)用較［2－4］［17］推廣品種中存在遺傳基礎(chǔ)狹窄的問題，不利于甘少。本研究采用分子標(biāo)記和農(nóng)藝性狀相結(jié)合的方薯品種的遺傳改良。為了拓寬

4、甘薯育種的遺傳背景，法，利用SRAP標(biāo)記和5個(gè)甘薯重要農(nóng)藝性狀對(duì)國(guó)內(nèi)篩選優(yōu)良親本，提高育種效率，近年來不少學(xué)者利用同48份主要甘薯種質(zhì)資源進(jìn)行遺傳多樣性分析，旨在從［5］［6－17］［14，18－19］［3］工酶、分子標(biāo)記、農(nóng)藝性狀、主成分分子水平探討分析甘薯種質(zhì)資源之間的親緣關(guān)系和遺等對(duì)甘薯種質(zhì)資源的遺傳多樣性進(jìn)行了研究。甘薯遺傳差異，為甘薯遺傳改良及親本組配提供重要依據(jù)。傳背景復(fù)雜，農(nóng)藝性狀的觀察和分析難以真實(shí)反映其同時(shí)對(duì)利用兩種方法進(jìn)行遺傳多樣性分析進(jìn)行了比親緣關(guān)系，DNA分子標(biāo)記穩(wěn)定性好，不受環(huán)境影響，已較，尋找較為準(zhǔn)確的甘薯親本聚類方法。經(jīng)成為植物種質(zhì)資源研究的重

5、要手段。在分子標(biāo)記方面，國(guó)內(nèi)外應(yīng)用較多的分子標(biāo)記方法有RAPD、AFLP、1材料與方法［6－17］ISSR等，而應(yīng)用SRAP標(biāo)記研究甘薯遺傳多樣性［4］［20］的報(bào)道較少。SRAP標(biāo)記通過獨(dú)特的引物設(shè)計(jì)對(duì)1.1試驗(yàn)材料ORFs(Openreadingframes)進(jìn)行擴(kuò)增，目前在馬鈴薯、供試甘薯品種(系)由西南大學(xué)薯類作物研究所水稻、柑橘、蘋果、萵苣、大蒜、玉米、丹參等多種植物中和中國(guó)南方甘薯研究中心提供，共計(jì)48份(表1)。［21］［22］應(yīng)用于圖譜構(gòu)建、比較基因組學(xué)、遺傳多樣性分1.2材料種植收稿日期:2012-05-10接受日期:2013-01-21基金項(xiàng)目:國(guó)家自然

6、科學(xué)基金(31101192)，中央高校基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)(XDJK2011C004)，重慶市科技攻關(guān)項(xiàng)目(cstc2010AB1053)，西南大學(xué)博士基金(SWU110031)作者簡(jiǎn)介:張凱(1981-)，女，山東濰坊人，博士，講師，研究方向?yàn)槭眍惙肿佑N。Tel:023-68250469;E-mail:zhangkai2010s@163．com通訊作者:王季春(1964-)，男，四川南充人，教授，碩士生導(dǎo)師，研究方向?yàn)槭眍愖魑锔髋c栽培。Tel:023-68250469;E-mail:wangjichun_mail@163．com唐道彬(1974-)，男，重慶榮昌人，實(shí)驗(yàn)

7、師，研究方向?yàn)槭眍愖魑锔髟耘嗯c育種。E-mail:tdbin741023@163．com5期甘薯種質(zhì)資源的SRAP鑒定及遺傳多樣性分析569田間試驗(yàn)于2009－2010年在西南大學(xué)薯類作物研究所歇馬試驗(yàn)基地進(jìn)行。試驗(yàn)采用隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)，2結(jié)果與分析重復(fù)3次，2壟區(qū)，壟距0.76m，株距0.22m，每壟22－22株，4000株·667m試驗(yàn)中施肥以每667m純氮(尿2.1SRAP分子標(biāo)記的系統(tǒng)聚類分析素，含N46%):有效磷(過磷酸鈣，含P2O516%):有效選用37對(duì)SRAP引物，對(duì)48份種質(zhì)材料的基因鉀(硫酸鉀，