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《蘭州鲇微衛(wèi)星標(biāo)記篩選及其與生長(zhǎng)相關(guān)性研究》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線(xiàn)閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫(kù)。
1、分類(lèi)號(hào)密級(jí)UDC單位代碼10733甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文蘭州鲇微衛(wèi)星標(biāo)記篩選及其與生長(zhǎng)相關(guān)性研究IsolationofmicrosatellitemolecularmarkersandcorrelationanalysiswithgrowthtraitofSilurusLanzhouensis魏大為指導(dǎo)教師吳旭東研究員（寧夏回族自治區(qū)水產(chǎn)研究所銀川750001）張利平教授（甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)蘭州730070）學(xué)科專(zhuān)業(yè)名稱(chēng)特種經(jīng)濟(jì)動(dòng)物飼養(yǎng)研究方向淡水經(jīng)濟(jì)動(dòng)物生物學(xué)及養(yǎng)殖論文答辯日期2015年5月29日學(xué)位授予日期2015年6月答辯委員會(huì)主席
2、余群力教授評(píng)閱人劉哲教授張大治教授2015年5月甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)2015屆碩士學(xué)位論文MasterDissertationIsolationofmicrosatellitemolecularmarkersandcorrelationanalysisgrowthtraitofSilurusLanzhouensisApplicant：WeiDaweiSupervisor：Prof.WuXudongProf.ZhangLipingCollegeofAnimalScience&TechnologyGansuAgriculturalUniversi
3、ty,Lanzhou,P.RChina730070CommencementinJune,2015II甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)2015屆碩士學(xué)位論文項(xiàng)目資助本論文研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目“蘭州鲇生長(zhǎng)發(fā)育性狀分子遺傳學(xué)基礎(chǔ)研究（No.31360633）”、寧夏對(duì)外科技合作項(xiàng)目“基于分子標(biāo)記黃河鯰良種家系選育技術(shù)研究”資助，在寧夏回族自治區(qū)水產(chǎn)研究所分子遺傳學(xué)試驗(yàn)室完成ThisstudywasfinanciallysupportedbytheNationalNaturalScienceFoundationofChinaandtheExternalC
4、ooperationProjectsofNingxia,whichresearchonthegeneticbasisofgrowthtraitsforLanzhoucatfish(Siluruslanzhouensis)(ProjectNo.31360633)andstudyonthebreedingfamilyofLanzhoucatfishbasedonmolecularmarkerstechniques,respectively.ThisstudywascarriedoutattheMolecularGeneticsLabofN
5、ingxiaFisheriesResearchInstitute.III甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)2015屆碩士學(xué)位論文摘要蘭州鲇（Siluruslanzhouensis）又名黃河鲇，是黃河上游特有的大型經(jīng)濟(jì)魚(yú)類(lèi)。營(yíng)養(yǎng)價(jià)值高，具有十分廣闊的養(yǎng)殖前景。近些年來(lái)，由于水體污染、過(guò)度捕撈、綜合水利工程建設(shè)等因素，蘭州鲇野生種群數(shù)量急劇下降，已成為深受各界關(guān)注的瀕危物種。因此，尋求有效的遺傳標(biāo)記對(duì)蘭州鲇種質(zhì)資源保護(hù)利用、遺傳圖譜構(gòu)建、經(jīng)濟(jì)性狀的QTL定位以及分子標(biāo)記輔助育種是十分必要的。本次實(shí)驗(yàn)分別進(jìn)行了蘭州鲇多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記篩選及與其生長(zhǎng)相關(guān)性分析兩部分
6、，以下是實(shí)驗(yàn)主要內(nèi)容：1．應(yīng)用FIASCO（FastIsolationbyAFLPofSequencesComainingRepeats）方法構(gòu)建了蘭州鲇(AC)n、(AG)n、(ATC)n、(CAG)n、(AAAC)n、(AGAT)n和(GATA)n核心序列G-SSR（基因組微衛(wèi)星）富集文庫(kù)。結(jié)果獲得326條G-SSR，（GenBank登陸號(hào)：KJ008462-KJ008582，KJ545973-KJ545998，KJ598088-KJ598120，KP280324-KP280469）陽(yáng)性序列率為40.75％。其中，完美型微衛(wèi)星17
7、0條，占52.15%；非完美型微衛(wèi)星72條，占22.09%；復(fù)合型84條，占25.76%；重復(fù)次數(shù)主要分布在10~20次，重復(fù)次數(shù)在30次以下的比例為80.16%。結(jié)果表明，經(jīng)優(yōu)化的磁珠富集法可以更高效的構(gòu)建蘭州鲇G-SSR文庫(kù)。2．基于公共數(shù)據(jù)庫(kù)GenBank，以現(xiàn)有鲇形目中與蘭州鲇親緣關(guān)系較近的革胡子鲇科和鲇科ESTs（ExpressedSequenceTag）共2002條序列，篩選蘭州鲇E-SSR（表達(dá)標(biāo)簽序列微衛(wèi)星）分子標(biāo)記。結(jié)果共發(fā)現(xiàn)209個(gè)微衛(wèi)星序列，占ESTs數(shù)據(jù)庫(kù)的10.44%；其中三堿基重復(fù)為主導(dǎo)型，共76個(gè)（36.
8、36%），其次是二堿基重復(fù)序列59個(gè)（28.22%）、四堿基重復(fù)序列52個(gè)（24.88%）、五堿基重復(fù)序列17個(gè)（8.13%）、六堿基重復(fù)序列5個(gè)（2.41%）；而雙堿基重復(fù)中TG/CA形式最為主，三堿基重復(fù)中AAT/A
