鯪生長(zhǎng)相關(guān)微衛(wèi)星標(biāo)記篩選及親子鑒定

鯪生長(zhǎng)相關(guān)微衛(wèi)星標(biāo)記篩選及親子鑒定

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1、學(xué)校代碼:10264研究生學(xué)號(hào):M120101042上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文鯪生長(zhǎng)相關(guān)微衛(wèi)星標(biāo)記篩選題目:及親子鑒定TheScreeningofGrowth-related英文題目:MicrosatelliteandParentageAssignmentinCirrhinusMolitorella專業(yè):水產(chǎn)養(yǎng)殖研究方向:種質(zhì)資源與遺傳育種姓名:王亞坤指導(dǎo)教師:朱新平研究員二O一五年四月二十五日上海海洋大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明:我恪守學(xué)術(shù)道德,崇尚嚴(yán)謹(jǐn)學(xué)風(fēng)。所呈交的學(xué)位論文,是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下,獨(dú)立進(jìn)行研究工作所取得的成果。除文中已經(jīng)明確注明和引用的內(nèi)容外,本論文不包含任何其他個(gè)

2、人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的作品及成果的內(nèi)容。論文為本人親自撰寫,我對(duì)所寫的內(nèi)容負(fù)責(zé),并完全意識(shí)到本聲明的法律結(jié)果由本人承擔(dān)。學(xué)位論文作者簽名:日期:年月日上海海洋大學(xué)學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,同意學(xué)校保留并向國(guó)家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版,允許論文被查閱或借閱。本人授權(quán)上海水產(chǎn)大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索,可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存和匯編本學(xué)位論文。保密□,在年解密后適用本版權(quán)書。本學(xué)位論文屬于不保密□學(xué)位論文作者簽名:指導(dǎo)教師簽名:日期:年月日日期:年上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文答辯委員會(huì)

3、成員名單姓名工作單位職稱備注桂建芳中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所研究員主席中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院羅建仁研究員委員珠江水產(chǎn)研究所洪一江南昌大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授委員胡成鈺南昌大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授委員余祥勇廣東海洋大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院教授委員中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院史燕副研究員秘書珠江水產(chǎn)研究所上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文鯪生長(zhǎng)相關(guān)微衛(wèi)星標(biāo)記篩選及親子鑒定摘要鯪(Cirrhinusmolitorella)隸屬于鯉科(Cyprinidae),野鯪亞科(Labeoninae),鯪屬(Cirrhinus),與草魚、鰱和鳙合稱為南方“四大家魚”,是華南地區(qū)重要的養(yǎng)殖魚類之一。為了解鯪野生群體的遺傳結(jié)構(gòu),以期為人工選育提供更多的選育

4、原材料,對(duì)西江肇慶段鯪進(jìn)行了遺傳多樣性評(píng)估;研究分析了微衛(wèi)星位點(diǎn)與生長(zhǎng)相關(guān)性狀的關(guān)聯(lián)性,結(jié)果找到了7個(gè)與生長(zhǎng)性狀顯著或極顯著相關(guān)的位點(diǎn),并由此獲得了具有生長(zhǎng)優(yōu)勢(shì)的基因型;建立了多重PCR體系,對(duì)鯪進(jìn)行了親權(quán)鑒定,為良種選育提供了新的技術(shù)手段。具體研究?jī)?nèi)容如下:1.微衛(wèi)星的開發(fā)及遺傳多樣性研究?;邛N轉(zhuǎn)錄組開發(fā)出12對(duì)微衛(wèi)星引物并對(duì)64尾鯪進(jìn)行擴(kuò)增,研究其遺傳多樣性。共檢測(cè)到51個(gè)等位基因,群體等位基因數(shù)為3-7,平均等位基因數(shù)為4.25;觀測(cè)雜合度為0.375-0.7656,平均為0.6198;期望雜合度為0.3863-0.7714,均值為0.6322;平均多態(tài)性信息含量為0.574。有2

5、個(gè)位點(diǎn)偏離了哈迪溫伯格定律(P<0.05),10個(gè)位點(diǎn)顯示出了較高的多態(tài)性(PIC>0.5)。該體系為鯪的群體遺傳多樣性分析、漁業(yè)可持續(xù)發(fā)展及相關(guān)物種的遺傳資源保護(hù)提供一定應(yīng)用價(jià)值。2.生長(zhǎng)相關(guān)微衛(wèi)星標(biāo)記篩選及應(yīng)用分析。運(yùn)用一般線性模型(Generallinearmodels,GLM)對(duì)15個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)與鯪極大和極小兩個(gè)群體生長(zhǎng)性狀的相關(guān)性進(jìn)行最小二乘法分析,結(jié)果顯示:位點(diǎn)ZJ35108、HLJ6和ZJ33806與體質(zhì)量、體長(zhǎng)和全長(zhǎng)均極顯著相關(guān);位點(diǎn)MFW1與體質(zhì)量極顯著相關(guān),與體長(zhǎng)和全長(zhǎng)顯著相關(guān);位點(diǎn)ZJ15254和ZJ34676與體質(zhì)量、體長(zhǎng)和全長(zhǎng)顯著相關(guān);位點(diǎn)ZJ12551只與體質(zhì)量

6、顯著相關(guān),而與體長(zhǎng)和全長(zhǎng)無(wú)相關(guān)性。對(duì)于相關(guān)性顯著的位點(diǎn),利用Duncan法將同一位點(diǎn)的不同基因型與生長(zhǎng)性狀進(jìn)行多重比較,初步篩選出了7對(duì)生長(zhǎng)有價(jià)值的微衛(wèi)星標(biāo)記和5個(gè)具有生長(zhǎng)優(yōu)勢(shì)的基因型??捎糜邛N的遺傳改良和良種選育研究。I上海海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文3.微衛(wèi)星多重PCR體系的建立與親子鑒定。結(jié)合鯪轉(zhuǎn)錄組及本實(shí)驗(yàn)室前期研究基礎(chǔ),共篩選出13對(duì)多態(tài)性較高的微衛(wèi)星引物,并通過調(diào)節(jié)引物所占比重、循環(huán)次數(shù)和第一次的延伸時(shí)間,構(gòu)建了可穩(wěn)定擴(kuò)增出清晰目的條帶的多重PCR系統(tǒng)。在此基礎(chǔ)上對(duì)鯪2尾雄、5尾雌及其后代146尾仔魚進(jìn)行遺傳分析及親子鑒定,結(jié)果顯示,群體等位基因數(shù)范圍2<K<5,平均3.54;多態(tài)性信

7、息含量范圍0.271<P<0.697,平均0.4953;觀測(cè)雜合度范圍0.183~0.778,平均0.6008;期望雜合度范圍0.324~0.741,平均0.5572;無(wú)效等位基因頻率為1.29%~27.68%;子代模擬和實(shí)際親子鑒定成功率分別為99%和100%。在此基礎(chǔ)上,通過將不同母本的子代分別劃分為4個(gè)不同的群體,運(yùn)用軟件得出群體間的遺傳距離并進(jìn)行聚類分析,為避免近交衰退提供合理路線,該研究為鯪良種選育和種質(zhì)資源研

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