三七根際土壤微生物的群落特征

三七根際土壤微生物的群落特征

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1、_...,-...〔‘■、;■丨伽―的丨丨丨:■‘■,丄■■顯■——:;—■■—,、”‘學(xué)院(所、中心)生命科舉舉院專(zhuān)業(yè)名稱(chēng)研究生姓名畝翠蘋(píng)學(xué)號(hào)師姓名徐麗華職稱(chēng)研究員職稱(chēng)研究員‘二:;二二::二二”反巧華巧:’必》二零一五年五月。::;:一:々二、:’、、”?一‘■二’■”“一、—■”;二―——”?一,,々,:‘:”二‘”、,、,,,一、二:、■■:—‘卞、、?!?,、■MicrobialcommunitycharacteristicsinrhizospheresoilofPanaxnotoginsengAdissertationSubmitedtoYu

2、nnanUniversityinfulfillmentoftherequirementfortheawardoftheDoctor'sDegreeByCui-PingMiaoSupervisedbyProf.Li-HuaXuProf.You-WeiChenYunnanUniversity,Kunming,扉頁(yè):論文獨(dú)創(chuàng)性聲明及使用授權(quán)本論文是作者在導(dǎo)師指導(dǎo)下取得的研究成果。除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外,論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫(xiě)過(guò)的研究成果,不存在剽竊或抄襲行為。與作者一同工作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說(shuō)明并表示了謝

3、意?,F(xiàn)就論文的使用對(duì)云南大學(xué)授權(quán)如下:學(xué)校有權(quán)保留本論文(含電子版),也可以釆用影印、縮印或其他復(fù)制手段保存論文,學(xué)校有權(quán)公布論文的全部或部分內(nèi)容,可以將論文用于查閱或借閱服務(wù);學(xué)校有權(quán)向有關(guān)機(jī)構(gòu)送交學(xué)位論文用于學(xué)術(shù)規(guī)范審查、社會(huì)監(jiān)督或評(píng)獎(jiǎng);學(xué)校有權(quán)將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容錄入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)用于檢索服務(wù)。內(nèi)部或保密的論文在解密后應(yīng)遵循此規(guī)定)研究生簽名導(dǎo)師簽名曰摘要摘要三七(為五加科人參屬植物,是我國(guó)特有的名貴中藥材,具有止血散瘀、定痛消腫的功效。三七長(zhǎng)期庇蔭,潮濕,免耕作的生活環(huán)境造成了土壤環(huán)境的微生態(tài)失衡,以根腐病為主的土傳病害日益突出,至今仍未得到

4、有效的緩解。研究三七根際土壤的微生物的群落組成及多樣性將為該類(lèi)土傳病害的發(fā)生、傳播、有效治理及解決三七連作障礙提供重要依據(jù)。本文采用高通量測(cè)序和方法,研究三七栽培過(guò)程中根際真菌、細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)和豐度動(dòng)態(tài),通過(guò)與環(huán)境理化因子進(jìn)行相關(guān)性分析,闡明驅(qū)動(dòng)根際微生物類(lèi)群動(dòng)態(tài)變化的關(guān)鍵因子;比較三七根腐病與健康植株根際土壤真菌、細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的差異,尋找與發(fā)病有關(guān)的微生物因子。通過(guò)純培養(yǎng),分析其可培養(yǎng)真菌、細(xì)菌的多樣性及種群分布,以三七病原菌為靶標(biāo),篩選防治根腐病的活性資源。結(jié)果如下一、樣品信息年月至年月間,每年月和月兩個(gè)生長(zhǎng)高峰期于硯山三七試驗(yàn)田釆集健康三七根際土

5、壤(共份),每一份取小份用于高通量測(cè)序及熒光定量來(lái)研究三七栽培過(guò)程中根際真菌、細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)及豐度動(dòng)態(tài)。一小份甩于傳統(tǒng)的真菌和放線菌的分離,用于研究純培養(yǎng)真菌和放線菌的種群分布及多樣性,所分離到的菌株進(jìn)一步用于三七根腐病生防資源的篩選。剩余部分用于分析土壤理化性質(zhì)。分別于硯山試驗(yàn)田和金川種植大田中采集黃腐型和急性青枯型根腐病三七根際土樣,以及各自作為對(duì)照的健康三七根際土樣,用于分析根腐病發(fā)病植株根際微生物群落結(jié)構(gòu),并與健康組作比較,研究引起根腐病發(fā)生的微生物因子。二、熒光定量分析表明三七根際土壤中真菌和細(xì)菌的數(shù)量均在移栽半年前顯著增加,隨后逐漸減少,一

6、年半后數(shù)量翻倍增加。相關(guān)性分析顯示真菌數(shù)量與土壤含水量顯著正相關(guān)(,。香農(nóng)多樣性指數(shù)表明,真菌多樣性開(kāi)始隨真菌數(shù)量的增多而降低,半年后隨真菌數(shù)量的減少而上升,但是在一年半后隨著數(shù)量的增加明顯升高;細(xì)菌多樣性半年前隨著其數(shù)量的增多而升高,之后隨其數(shù)量減少而降低,仍然在一年半后大幅提高。高通量數(shù)據(jù)分析顯示三七裉際土壤微生物群落呈明顯的動(dòng)態(tài)變化,真菌群落中有大量的被孢霉類(lèi)群存在,其在移栽半年時(shí)豐度顯著提高,之后逐漸降低一年半后趨于平穩(wěn),摘要豐度變化幅度不大。在門(mén)分類(lèi)水平上,和為優(yōu)勢(shì)類(lèi)群,的變化隨的變化而變化,而豐度則在移栽半年前驟減,之后逐步增多。細(xì)菌群落以

7、和■為優(yōu)勢(shì)類(lèi)群,豐度隨時(shí)間增長(zhǎng)逐漸高,而豐度則隨時(shí)間增長(zhǎng)逐漸降低。隨著種植周期的增長(zhǎng),病原菌種類(lèi)增多,有益菌減少,三七生長(zhǎng)環(huán)境日趨惡化。相關(guān)性分析和冗余分析表明主要真菌類(lèi)群受土壤中總氮(的影響,但均未達(dá)到顯著水平;總磷(、有效磷(和水解氮(是影響細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的重要因子。三、對(duì)硯山和馬塘兩地的根腐病三七根際微生物群落結(jié)構(gòu)進(jìn)行了研究。熒光定量顯示根腐病三七根際土壤中真菌和細(xì)菌的數(shù)量均高于健康對(duì)照。與健康植株的相比,病株根際真菌、細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)發(fā)生了明顯的變化,主要表現(xiàn)為根際土壤中豐度大幅下降,多種病原菌大量增殖而成為優(yōu)勢(shì)類(lèi)群。優(yōu)勢(shì)真菌病原有、、、、、、及其有

8、性型優(yōu)勢(shì)細(xì)菌病原有、。三七根腐病的發(fā)生與這些病原菌的積累有密切的關(guān)系,并且呈現(xiàn)多種病原并存的現(xiàn)

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