山羊mef2c基因選擇性剪接鑒定及其單核苷酸多態(tài)性與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析

山羊mef2c基因選擇性剪接鑒定及其單核苷酸多態(tài)性與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析

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1、分類號(hào)7/636.3;S20125627:S82學(xué)號(hào)四川農(nóng)化大學(xué)專業(yè)堿db學(xué)位論文山羊基因選揮性剪接鑒定及其單核巧酸多巧性與生長性狀的關(guān)聯(lián)分祈,就并兵指導(dǎo)教師;李巧教巧;襲華巧巧級(jí)寬巧師瓦狡外導(dǎo)師?.一*-四]1省巧陽大邦大化業(yè)存巧公司1Z學(xué)化類則;發(fā)業(yè)推廣滿:ir.'一','-V.學(xué)位領(lǐng)域;養(yǎng)道研究方向;羊業(yè)生產(chǎn).-.’"■*.*?丄.,’.V.—.^20巧年6月,-.心V-._'_''-',三.、‘'乃;V'部心

2、品.一抑叫皆:謝打-.SichuanAgriculturalUniversityMas1;erDegreeDissertation^IdentificationofM£72CeneahernativeslicinandtheassociationofgpgitssinglenucleotideolymorphismswithrowthtraitsinoatspggShenBinbinggDirectedbyProf.LiLiGonHuabingAnimalProductionGoa

3、tBreedingChenduSichuanChinag,,June2015,論文指導(dǎo)小組成員張紅平(教授)李利(教授)王林杰(副研究員)仲濤(副研究員)2011NZ0099-36本論文由四川省科技支撐計(jì)劃()和國家星火計(jì)劃重點(diǎn)項(xiàng)目(2012GA810001)資助""本論文在四川農(nóng)業(yè)大學(xué)畜禽遺傳資源發(fā)掘與創(chuàng)新利用、四川省商校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室完成論文獨(dú)創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明:所呈交的學(xué)位論文是我個(gè)人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行研究工作所取得的成果。盡我所知,除了文中特別加W標(biāo)注和致謝的地方外,學(xué)位論文中不包含其他個(gè)人或集體己經(jīng)發(fā)表或

4、撰寫過的研究成果,也不包含為獲得四川農(nóng)業(yè)大學(xué)或其它教育機(jī)一構(gòu)的學(xué)位或證書所使用過的材料。與我同工作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示了謝意。研究生簽名;卻口知/之曰化或關(guān)于論文使用授巧的聲明、目本人完全了解四川農(nóng)業(yè)大學(xué)有關(guān)保留使用學(xué)位論文的規(guī)定,P:學(xué)校有權(quán)保留并向國家有關(guān)部口或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版,允許論文被查閱和借閱,可^!采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。同意四川農(nóng)業(yè)大學(xué)可W用不同方式在不同媒體上發(fā)表、傳播學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容。eT本論文不保密。□本論文保密,在_年解密后適用本授

5、權(quán)。""(請(qǐng)?jiān)冢咨稀鮾?nèi)劃V)研究生簽名;年夸、妊月/I日/衣,導(dǎo)師簽名:韋W心r年《月曰摘要肌細(xì)胞增強(qiáng)因子2C(MyocyteEnhancerFactor2C,MEF2C)屬于轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子-BoxMADS家族下屬的基因家族、骨骼肌和平滑化中,通,廣泛存在于也肌過控制肌細(xì)胞分化過程中的基因轉(zhuǎn)錄參與肌肉形成,但家畜尤其是山羊M巧口C基因。的可變剪接體有待研究本研究W南江黃羊?yàn)樵囼?yàn)材料,克隆了山羊ME巧C基因的選擇性剪接體,并采用實(shí)時(shí)巧光定量PCR方法檢測M份口C基因的選擇性剪接體的時(shí)空表達(dá)情況。同時(shí),我們測序檢測MEF2C外顯子

6、的單核巧酸多態(tài)性,并進(jìn)行了部分位點(diǎn)基因型與南江黃羊生長性狀的關(guān)聯(lián)分析。主要結(jié)果如下:-AW-(1)克隆獲得山羊M£/UC基因的S個(gè)選擇性剪接體:M貨口C、MEF2CAS2-^W433-AS7和M£P2C,分別編碼、431和385個(gè)氨基酸。其中M£F2C缺失第7外顯子;缺失第6外顯子;而M拉口同時(shí)缺失第6和第7外顯子。'(2-AS2和MEF2C-)如做2C乂WmRNA在半膜肌和背最長肌中表達(dá)量較高,而在也肌中表達(dá)量較低。隨著黨羊的生長,ME仍在必肌中的表達(dá)-量呈升高的趨勢,MEi口擬和如做興:乂巧在也肌中的表達(dá)量呈下降的趨勢。(3)山羊ME巧C

7、基因的第4個(gè)外顯子、第8個(gè)外顯子中分別發(fā)現(xiàn)1個(gè)突變位點(diǎn)(C61T和C71巧),在第14外顯子發(fā)現(xiàn)6個(gè)突變位點(diǎn)(C4114T,A44%G,A4728C,C4%9T,C5044T和A66%G)。對(duì)A4486G,A4728C,C4%9T,C5044T四個(gè)位點(diǎn)在=南江黃羊群體(n215)中的多態(tài)性分析,發(fā)現(xiàn)A44WG位點(diǎn)處于低度多態(tài)(PIC<0.25),<P<0-We其余H個(gè)位點(diǎn)均處于中度多態(tài)(0.25IC.5),但都處于Hardyinbe巧平衡狀態(tài)。(4)對(duì)南

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