奶山羊AGPAT6基因多態(tài)性與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析-論文.pdf

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1、《江西畜牧獸醫(yī)毒~)2014年第3期文章編號:1004—2342(2014)03—0009—02中圈分類號:$813.3文獻標(biāo)識碼:B奶山羊AGPAT6基因多態(tài)性與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析常振華,顏偉俊,王韋華。何成:。孟曉靜s(1.渭南職業(yè)技術(shù)學(xué)院,陜西渭南714000;2.渭南市畜牧技術(shù)推廣中心3.蒲城縣地方公路站)摘要:利/flPCR—RFLP技術(shù)對549只西農(nóng)薩能和關(guān)中奶山羊群~AGPAT6基因遺傳多態(tài)性與生長性狀(體高、體長和胸圍)的相關(guān)性進行了研究。結(jié)果表明AGPAT6基因存在4個sNPs多態(tài):P1、P2、P4與P1O位點分別位于5TR(g.152G>C)、內(nèi)含-~-2(g.8124

2、G>A)、外顯子4(g.9263C>G)和3,UTR(g.16436G>A)。經(jīng)關(guān)聯(lián)分析,P2、P4和P10三位點在西農(nóng)薩能奶山羊和關(guān)中奶山羊品種中都屬于中度多態(tài),4個SNPs~;g同基因型對兩個奶山羊品種的生長性狀影響均不顯著(P>0.05)。關(guān)鍵詞:奶山羊;AGPAT6基因;多態(tài)性;生長性狀;關(guān)聯(lián)分析薩能奶山羊和關(guān)中奶山羊是著名的乳用山羊加ACD抗凝劑帶回實驗室,一20℃冷凍存?zhèn)溆茫煌贩N,以體格高大、產(chǎn)奶量高、適應(yīng)性強和遺傳穩(wěn)定時現(xiàn)場測量并記錄了549頭奶山羊的體尺指標(biāo),其而著稱。AGPAT,即磷酸甘油?;D(zhuǎn)移酶,也叫做溶中包括體長(BL)、體高(BH)和胸圍(cc)。血磷脂酸?;D(zhuǎn)

3、移酶(LPAA,I')Ⅲ。AGPAT能催化甘1.2方法油三酯sn一2位置的酯化,而甘油三酯是乳脂和體1.2.1基因組DNA提取與AGPAT6基因引物。本實脂的主要成分,它能催化溶血磷脂酸形成磷脂酸凹。驗參照Chen[71的方法奶提取山羊的血樣基因組目前研究發(fā)現(xiàn),AGPAT可能有8種異構(gòu)體,其中DNA。所用到的引物全部參照GeneBank中提供的AGPAT6基因等多個基因的mRNA表達上調(diào)基因牛的AGPAT6基因序列(NC_007328.3),用Primer網(wǎng)絡(luò)參與乳脂合成和分泌[51。在國內(nèi),昝林森等就premier5.0軟件自行設(shè)計,如表1所示。’AGPAT6基因?qū)Σ煌废档暮伤固鼓膛H?/p>

4、脂率和表1AGPAT6基因所用引物信息和退火溫度bB℃奶產(chǎn)量有過研究[61,但目前尚未有AGPAT6遺傳多!壘!竺2:!樣性對生長性狀(體高、體長、胸圍)影響的相關(guān)報P1篆GACCTGCAGAAG38658::道。為此,本研究采用PCR—RFLP技術(shù)分析了西農(nóng)P1-F:GCGGAACAGAGCCCAGAGCG175632r-~176薩能奶山羊和關(guān)中奶山羊群體AGPAT6基因遺傳KpnI~TrCGCATCCCTCGATGGCCGGTAC(5"UTR)多態(tài)性及其對生長性狀的影響,旨在為奶山羊的選P2372602)育提供理論依據(jù)。P3F:TCTCCCAGCAGACCACCT315608193~8

5、5071材料與方法~CGAACCCGCATGAGTAGG(Exon3)1.1試驗動物P4T曷囂2457本試驗采用頸靜脈法采血分別采集西農(nóng)薩能P5F:GCTrACCGTAGACACTAATAAT63555988910523奶山羊268份來自陜西省千陽縣西農(nóng)薩能奶山羊R:ccAcTcGGcTcAcAGcAcccAG(Exon5~6)種羊場(202只)和西北農(nóng)林科技大學(xué)種羊場(66P6449¨229只);關(guān)中奶山羊血樣281份來自陜西省三原縣關(guān)P7F:TI'CATACCGCACCCAGCATC271611174012010中奶山羊種羊場,共計549份。每個個體采集lOmL,~AGTI'CCAGG

6、ACCAGCCCAAA(ExonS)P8GCTGTCAGAGGGCTITrACTAITC3245512193~12516PcCCGAGCTGCTGGGITrATG(Exon9)基金項目:渭南職業(yè)技術(shù)學(xué)院青年科研基金P9F:CACCCCGCCCTGTCGCCC3716115509~15879(WZYQ201215)。R:AACCGCCTCAGAAATCCC(Exonl0~11)作者簡介:常振華(1984~),女,內(nèi)蒙古鳥蘭察布市人,碩P10F:TACAGGAACGAACCCCAAAC3365916298~16633士,助教,主要從事牛、羊生產(chǎn)及育種工作。堡壘!!壘!墾蘭!!.·9·《江西畜牧

7、獸醫(yī)雜志)2014年第3期·實驗研究·1.2.2AGPAT6基因PCR—RFLP反應(yīng)條件。以奶山檢測到了GG型、GC型和CC型三種基因型。利用羊的混合DNA池(每1O個不同樣本混合成一個限制性內(nèi)切酶EcoRII對發(fā)現(xiàn)的P2位點(g.8124G>DNA池)做模板進行基因的PCR擴增。PCR擴增反A1的PCR產(chǎn)物(372bp)進行分型,結(jié)果在兩個奶山應(yīng)總體系如下:TaqDNA聚合酶0.4、10xPCR羊品種中都檢測到了GG型

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