廣西豬圓環(huán)病毒2型分子流行病學(xué)調(diào)查及分離鑒定

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1、巧古單位化義廣西豬圓環(huán)病毒2型分子流巧病學(xué)調(diào)查及分離鑒定覃艷然..■'.*'?.’:.d,;7V、'■^..;.爲(wèi)爲(wèi)乂榮二〇—五年六月.,分類號(hào)S855.3密級(jí)公開UDC578碩±學(xué)位論文廣西豬圓環(huán)病毒2型分子流行病學(xué)調(diào)查及分離鑒定覃艷然餅斗專業(yè)預(yù)防獸睽學(xué)指導(dǎo)教師黃偉喀教授論文答辯日期2015.232015.6.30.5學(xué)位授予日期答辯委員會(huì)主席羅廷榮教授廣西大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性和使用授權(quán)盧明本人聲明所呈交的論文

2、,是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下獨(dú)立進(jìn)行研究所取得的研究成果。除已特別加標(biāo)注和致謝的地方外,論文不包含任何其他個(gè)人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫的研究成果,也不包含本人或他人為獲得廣西大一學(xué)或其它單位的學(xué)位而使用過的材料。與我同工作的同事對(duì)本論文的研究工作所做的貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確說明。本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下所完成的學(xué)位論文及相關(guān)的職務(wù)作品,知識(shí)產(chǎn)權(quán)歸屬?gòu)V西大學(xué)。本人授權(quán)廣西大學(xué)擁有學(xué)位論文的部分使用權(quán),目P:學(xué)校有權(quán)保存并向國(guó)家有關(guān)部口或機(jī)構(gòu)送交學(xué)位論文的復(fù)印件和電子版,允許論文被查閱和借閱,可[^將學(xué)位論文的全部或部分

3、內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行、、檢索和傳播,可W采用影印縮印或其它復(fù)制手段保存匯編學(xué)位論文。本學(xué)位論文屬于:□保密。,在年解密后適用授權(quán)口不保密。""(請(qǐng)?jiān)冢咨舷鄳?yīng)方框內(nèi)打V)論文作者簽名:被日期:扣聲j埃指導(dǎo)教師簽名日期:wlK胃/^^作者聯(lián)系電話:電子郵箱:III廣西豬圓環(huán)病毒2型分子流行病學(xué)調(diào)查及分離鑒定摘要豬圓環(huán)病毒2型(Porcinecircovimste2PCV2)于1W8被發(fā)現(xiàn)1^yp,年一一。來,現(xiàn)如今已成為種廣泛流行于世界各地區(qū)的疾病病原之它

4、嚴(yán)重危害豬群,破壞豬的淋己系統(tǒng),使豬的淋己細(xì)胞減少,進(jìn)而造成豬的免疫力下降,處于亞健康狀態(tài),容易受其他病原或者外界環(huán)境因素的影響而導(dǎo)致。PCV2發(fā)病因此,在全球范圍內(nèi)已造成了巨大經(jīng)濟(jì)損失并且還在制約著世界養(yǎng)豬行業(yè)的發(fā)展。為了解廣西PCV2的流行情況,本研究對(duì)2012年8月至2015年1月期間采集的廣西不同地區(qū)的284樣品淋己結(jié)及肺臟組織,采用PC民方法進(jìn)行PCV2檢測(cè),共檢測(cè)出144份陽(yáng)性樣品,陽(yáng)性率達(dá)50.7%;其中春、夏、秋、冬四季的PCV2陽(yáng)性率分別為42.4%(36/85)、91.5%

5、(43/47)、38.7%(43/111)和53.7%(22/41)。說明了廣西豬群中普遍存在PCV2感染現(xiàn)象,并且在夏季流行較為嚴(yán)重。一PCV2為進(jìn)步了解在廣西流行的主要基因型。本研究選取檢測(cè)為陽(yáng)性的部分樣品進(jìn)行PCV2全基因的克隆,成功克隆出45株PCV2全基因序列。遺傳進(jìn)化分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),其中6株屬于PCV2a型,巧株屬于PCV2b4PCV2b--lA/B5PCV2b。型,其中1株屬于亞群,2株屬于lC亞群說明了-廣西部分地區(qū)PCV化流行廣泛,其中又l^PCV2blC亞群流行為主。結(jié)合本實(shí)驗(yàn)所

6、保存的24株PCV2全基因進(jìn)行分析,充分說明了廣西PCV2亞群I--流行發(fā)展的變化規(guī)律,是由PCV2blA/B亞群向PCV2blC亞群轉(zhuǎn)變。本研究得到6株PCV2a與中國(guó)吉林疫苗株HM038034及匈牙利株AY256459共4-同處于PCV2a的分支上。所得1株PCV2blA/B與中國(guó)廣東株EF421971、中國(guó)安徽株GU450327、中國(guó)浙江株AY6911的、中國(guó)河南株FJ440338、中一國(guó)圧寧株HM776448及中國(guó)北京株EF524530處于同分支上,而不處于中國(guó)浙江疫苗株AY686764、中國(guó)山西

7、疫苗株HM641752和荷蘭株AF201897-所在的分支上。本研究所得25株PCV2blC中,有23株與中國(guó)黑龍江株HM038017、中國(guó)湖北疫苗株FJ870971、中國(guó)上海疫苗株AY686763、中國(guó)AY29一湖北株1317及中國(guó)甘肅株FJ948168處于同分支。另外2株PCV2b-lC與中國(guó)湖北株AY035820、印度尼西亞株EU3021巧和越南株一JX506730JX099782-及處于同分支,并且為PCV2a與PCV2blCORF2的重組株。45株PCV2全基因核昔酸的同源94-性

8、達(dá).299.9%,45株PCV2各基因-型之間0RF1核昔酸具有很高的同源性為96.5100%,而0RF2的核昔酸同88-.999.9%??桑遥疲陛^ORF2保守PCV2三個(gè)亞型源性為W看出O,的主要5PCV2F-差異表現(xiàn)在

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