水稻ril群體ssr標(biāo)記遺傳圖譜構(gòu)建和稻米鎘含量qtl的初定位

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1、碩士學(xué)位論文水稻RIL群體SSR標(biāo)記遺傳圖譜構(gòu)建和稻米鎘含量QTL的初定位學(xué)科專業(yè)植物發(fā)育與分子生物學(xué)學(xué)位類型?科學(xué)學(xué)位?專業(yè)學(xué)位研究生姓名劉利導(dǎo)師姓名、職稱陳良碧教授論文編號湖南師范大學(xué)學(xué)位評定委員會辦公室二零一五年五月分類號密級學(xué)校代碼學(xué)號201202141139水稻RIL群體SSR標(biāo)記遺傳圖譜構(gòu)建和稻米鎘含量QTL的初定位ConstructionofGeneticLinkageMapBasedonSSRMarkerandMappingofQTLsRelatedtoRiceCadmiumContentUsingaRILPopulat

2、ioninRice研究生姓名劉利指導(dǎo)教師姓名、職稱陳良碧教授學(xué)科專業(yè)植物學(xué)研究方向植物發(fā)育與分子生物學(xué)湖南師范大學(xué)學(xué)位評定委員會辦公室二零一五年五月湖南師范大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明：所呈交的學(xué)位論文，是本人在導(dǎo)師的指導(dǎo)下，獨(dú)立進(jìn)行研究工作所取得的成果。除文中臣鐘注明副用的巧容外，本論文不含任何其他個人或集體己經(jīng)發(fā)表或撰寫過的作品成果。對本文＾的研究做出重要貢獻(xiàn)的個人和集體，均巴在文中１義明確方式標(biāo)明。本人完全意識到本聲明的法律結(jié)果由本人承擔(dān)。＾學(xué)位論文作者簽名：＾護(hù)年＾月曰＾又１＾湖南師范大學(xué)學(xué)位

3、論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，研究生在校攻讀學(xué)位期間論文工作的知識產(chǎn)權(quán)單位屬湖南師范大學(xué)。同意學(xué)校保留并向國家有關(guān)部口或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和電子版，允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)湖南師范大學(xué)可Ｌ乂將本學(xué)位論文的全部或部分巧容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索Ｌ乂、，可采用影印縮印或掃描等復(fù)制手段保存和匯編本學(xué)位論文。本學(xué)位論文屬于１、保密在年解密后適用本授權(quán)書。２、不保密＂（請?jiān)谏舷鄳?yīng)方框內(nèi)ｆｒｖ）ｊ＾＾作者簽名＂今又０皆名：立１曰期：爹＾月曰＾導(dǎo)卿

4、簽為：曰期：年６巧＾日摘要我國南方水稻種植區(qū)稻米鎘超標(biāo)成為社會關(guān)注的熱點(diǎn)。研究表明不同水稻品種稻米鎘含量差異顯著，因此選育低鎘水稻品種是降低稻米鎘含量的有效途徑。但有關(guān)水稻調(diào)控鎘離子吸收和轉(zhuǎn)運(yùn)分子機(jī)制研究還很不深入，利用分子標(biāo)記輔助育種培育低鎘水稻品種的研究還沒有真正開展，因此探討水稻調(diào)控吸鎘和籽粒鎘積累的分子機(jī)制，建立培育低鎘水稻的分子標(biāo)記，是目前低鎘水稻育種的重要研究方向。本研究利用日本晴與9311雜交重組自交系(Recombinantinbredlines,RIL)為材料，進(jìn)行微衛(wèi)星標(biāo)記(SSR)與水稻稻米鎘含量的連鎖和關(guān)聯(lián)分

5、析，旨在為培育水稻稻米低鎘品種提供分子標(biāo)記。其主要結(jié)果如下:1、選用614對覆蓋水稻12條染色體的SSR標(biāo)記，對日本晴和9311進(jìn)行多態(tài)性檢測，發(fā)現(xiàn)有48.5%（278對）的標(biāo)記在親本日本晴和9311間具有差異。最終篩選出了123個標(biāo)記，構(gòu)建了以日本晴與9311衍生的RIL群體為基礎(chǔ)的分子連鎖遺傳圖譜，覆蓋水稻的12條染色體，圖譜總遺傳距離達(dá)到2424.01cM，標(biāo)記間平均距離為19.71cM。2、檢測到3個與水稻稻米鎘含量有關(guān)的QTLs，分別位于第6號染色體的標(biāo)記RM1370與RM4608之間，第7號染色體的標(biāo)記F14與F21之間，以

6、及第9號染色體的標(biāo)記ST6062處。連鎖分析表明，稻米鎘含量是一個由多基因控制的數(shù)量性狀。3、對7個水稻鎘相關(guān)基因進(jìn)行克隆測序，找到了每個基因在日本晴I和9311間的多個差異性位點(diǎn)，以及對應(yīng)的堿基突變狀態(tài)和氨基酸突變狀態(tài)。并對24個水稻RIL群體材料進(jìn)行了以測序?yàn)榛A(chǔ)的基因分型。4、從生物信息學(xué)角度直接分析了10個水稻鎘相關(guān)的基因在日本晴和9311間的多個差異性位點(diǎn)，據(jù)此設(shè)計(jì)了特異性引物，對96個水稻RIL群體材料進(jìn)行了基因分型。并發(fā)現(xiàn)基因OsHMA3和OsNRAMP5與稻米鎘含量的相關(guān)性較高。5、相關(guān)性分析檢測到13個與水稻稻米鎘含量

7、緊密關(guān)聯(lián)的SSR標(biāo)記，分布在第2、3、5、6、7、8、9、10號染色體上。其中，對水稻稻米鎘含量正效應(yīng)最大的標(biāo)記是RM3805，效應(yīng)值為0.225。負(fù)效應(yīng)最大的標(biāo)記是S7-25049，效應(yīng)值為-0.083。關(guān)鍵詞：水稻;Cd基因;稻米Cd含量;QTL定位IIABSTRACTCadmiumisawidespreadcontaminant.Cadmiummovesintohumanbodybywayoffoodchains,causinggenotoxicity,cytotoxicity,andfinallyinhibitionofcell

8、proliferationandapoptosis.Therefore,it’sofgreatimportancetominimizecadmiuminhumandiet,withtheuseofmolec