茄子遺傳多樣性研究與遺傳連鎖圖譜構(gòu)建

茄子遺傳多樣性研究與遺傳連鎖圖譜構(gòu)建

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1、K^Jf^fAGRICULTURALUNIVERSITYOFHEBEI博士學(xué)位(畢業(yè))論文前子遺傳多樣性研究與遺傳連鎖圖譜構(gòu)建學(xué)位申請(qǐng)人:陳雪平指導(dǎo)教師:申書(shū)興教授學(xué)科專(zhuān)業(yè):蔬菜學(xué)學(xué)位類(lèi)別:農(nóng)學(xué)博士授予單位:河北農(nóng)業(yè)大學(xué)答辯日期:二〇一五年六月六日獨(dú)創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研宄工作及取得的研究成果。據(jù)我所知,除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外,論文中不包含其他人己經(jīng)發(fā)表或撰寫(xiě)過(guò)的研宄成果,也不包含為獲得河北農(nóng)業(yè)大學(xué)或其他教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書(shū)而使用過(guò)的材料。與我一同工作的同志對(duì)本研宄所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說(shuō)明并表示謝意。學(xué)位論文作者

2、簽名:簽字日期:《=>〃/年/月令曰學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書(shū)本學(xué)位論文作者完全了解河北農(nóng)業(yè)大學(xué)有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,有權(quán)保留并向國(guó)家有關(guān)部門(mén)或機(jī)構(gòu)送交論文的復(fù)印件和磁盤(pán),允許論文被查閱和借閱。本人授權(quán)河北農(nóng)業(yè)大學(xué)可以將學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索,可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。(保密的學(xué)位論文在解密后適用本授權(quán)書(shū))學(xué)位論文作者簽名:導(dǎo)師簽名:簽字曰期:y//年士月《日簽字日期々年〈月幺日學(xué)位論文作者畢業(yè)后去向:工作單位:電話:通訊地址:郵編:分類(lèi)號(hào):S641.1單位代碼:10086密級(jí):公開(kāi)學(xué)號(hào):200721茄子遺傳多樣性研究與

3、遺傳連鎖圖譜構(gòu)建StudyonGeneticDiversityandGeneticLinkageMapConstructioninEggplant學(xué)位申請(qǐng)人:陳雪平指導(dǎo)教師:申書(shū)興教授學(xué)科專(zhuān)業(yè):蔬菜學(xué)學(xué)位類(lèi)別:農(nóng)學(xué)博士授予單位:河北農(nóng)業(yè)大學(xué)答辯日期:二○一五年六月六日摘要SolanummelongenaL.作為最重要的茄子栽培種在亞洲、歐洲中南部和地中沿岸等地得到廣泛種植,其年生產(chǎn)量和生產(chǎn)值均已躍居于世界蔬菜生產(chǎn)的前十位。但目前茄子遺傳育種的研究水平與其作為世界性大宗蔬菜的生產(chǎn)地位不相稱,嚴(yán)重制約著茄子生產(chǎn)的發(fā)展與產(chǎn)品的質(zhì)量水平。分析可能造成這種局面的原因,主要有以下幾點(diǎn):一

4、是茄子栽培種內(nèi)遺傳背景狹窄,直接制約著遺傳研究和育種實(shí)踐水平;二是茄子數(shù)量性狀遺傳的研究手段仍局限于傳統(tǒng)方法;三是茄子重要經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)標(biāo)記開(kāi)發(fā)和基因挖掘嚴(yán)重滯后。在目前關(guān)于茄子遺傳育種的研究中,主要體現(xiàn)在遺傳多樣性研究所用資源的地理來(lái)源的豐度不高,用于遺傳多樣性研究的分子標(biāo)記資源有限,已構(gòu)建的遺傳圖譜分子標(biāo)記的飽和度不夠,鑒定的與重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的QTL及與其緊密連鎖的可用于分子標(biāo)記輔助育種(marker-assistedselection,MAS)和基因組選擇育種(genomicselection,GS)的分子標(biāo)記較少。針對(duì)上述問(wèn)題與不足,本研究以來(lái)自5個(gè)洲33個(gè)國(guó)家的茄

5、子種質(zhì)資源為試材,利用SSR和SRAP兩種分子標(biāo)記,結(jié)合形態(tài)學(xué)表型性狀鑒定,采用關(guān)聯(lián)作圖的方法對(duì)其進(jìn)行遺傳多樣性及性狀關(guān)聯(lián)標(biāo)記的研究;同時(shí),以存在多個(gè)性狀差異的高代自交系為親本獲得F1及F2代分離群體,利用高通量簡(jiǎn)化基因組測(cè)序技術(shù)開(kāi)發(fā)高多態(tài)性的新型分子標(biāo)記,構(gòu)建高密度的茄子遺傳圖譜,開(kāi)展目標(biāo)性狀的QTL定位研究。主要研究結(jié)果如下:1.對(duì)133份茄子及其近緣種的27個(gè)形態(tài)學(xué)性狀進(jìn)行遺傳多樣性分析表明,研究群體內(nèi)存在著豐富的形態(tài)變異,Shannon多樣性指數(shù)H'和均一度值J的總體平均值分別為2.110和0.753;與育種密切相關(guān)的性狀中果形指數(shù)、果長(zhǎng)、果色、萼下果色和果形等變異系

6、數(shù)較大;葉刺、果萼刺和果棱的變異系數(shù)最高,可作為植物學(xué)分類(lèi)的重要依據(jù)。依據(jù)因子分析結(jié)果對(duì)供試材料進(jìn)行形態(tài)學(xué)聚類(lèi)分析,可將其清晰劃分為7個(gè)組,命名為GⅠ-GⅦ,GⅠ組進(jìn)而分為4個(gè)亞組,命名為subG1-subG4。2.利用5對(duì)SSR引物和25對(duì)SRAP引物對(duì)133份材料進(jìn)行遺傳多樣性分析表明,引物多態(tài)性條帶率99.24%,各位點(diǎn)PIC值范圍為0.015-0.500,平均值0.312;有效等位基因數(shù)范圍1.2905-1.7459,平均值為1.5114;Nei's多樣性指數(shù)H范圍為0.1701-0.4056,平均值為0.2992;Shannon指數(shù)I范圍為0.02661-0.585

7、5,平均值為0.4550。相似系數(shù)范圍0.024-0.968,平均值0.764,反映出群體內(nèi)分子水平的遺傳多樣性不高,遺傳背景較為狹窄。利用PIC>0.25的位點(diǎn)聚類(lèi),可將材料劃分為M1-M6六個(gè)類(lèi)別。S.melongena和S.dasyphyllum、S.integrifolium、S.aethiopicum、S.macrocarpen、S.viarum及S.anguivi之間的平均相似系數(shù)依次為0.837、0.828、0.822、0.767、0.589和0.541。3.利用Structure2.3.

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