黍稷種質(zhì)遺傳資源多樣性及遺傳圖譜構(gòu)建研究

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1、分類號：Q943.2單位代碼：10193密級：公開學(xué)號：2012234碩士學(xué)位論文黍稷種質(zhì)遺傳資源多樣性及遺傳圖譜構(gòu)建研究AssessmentofgeneticdiversityandconstructionofgeneticlinkagemapofBroomcornmillet(PanicummiliaceumL.)作者姓名：王銀月學(xué)位類別：理學(xué)碩士專業(yè)名稱：生物化學(xué)與分子生物學(xué)研究方向：植物基因工程指導(dǎo)教師：崔喜艷副教授陸平研究員所在學(xué)院：生命科學(xué)學(xué)院2015年5月獨(dú)創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明：所呈

2、交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下，獨(dú)立進(jìn)行研究所取得的成果。盡我所知，除文中特別加以標(biāo)注和致謝所列內(nèi)容外，論文中不包含其他個人或集體已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包含為獲得吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)或其它教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我一同工作的同志對本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示了謝意。本學(xué)位論文所有內(nèi)容若有不實(shí)之處，本人愿意承擔(dān)一切相關(guān)法律責(zé)任和后果。學(xué)位論文作者簽名：簽字日期：年月日關(guān)于學(xué)位論文使用授權(quán)的聲明1、本人完全了解吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)有關(guān)保留和使用學(xué)位論文的規(guī)定，即：研究生

3、在校攻讀學(xué)位期間所完成的論文及相關(guān)成果的知識產(chǎn)權(quán)屬吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)所有，并同意將本論文的版權(quán)授權(quán)給吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)，學(xué)校有權(quán)保留送交論文的復(fù)印件和磁盤，允許論文被查閱和借閱，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。2、本人（同意/不同意，務(wù)必打印后填寫）吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)將本論文版權(quán)授權(quán)給不同媒體進(jìn)行電子出版、多媒體出版、網(wǎng)絡(luò)出版以及其他形式出版（涉密學(xué)位論文解密后應(yīng)遵守此協(xié)議）。3、本人聲明畢業(yè)后若發(fā)表在攻讀研究生學(xué)位期間完成的論文及相關(guān)的學(xué)術(shù)成果，必須以吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)作為第一署名單位。學(xué)位論文作

4、者簽名：簽字日期：年月日指導(dǎo)教師簽名：簽字日期：年月日摘要黍稷（PanicummiliaceumL.）又被稱為糜子，早在10000年前就被馴化栽培，作為主要的糧食作物。在我國，黍稷主要分布種植于西北、東北以及華北等地的干旱貧瘠地區(qū)，常用來改善鹽漬地、整治沙漠和開辟荒地，于此同時(shí)因?yàn)槭蝠⑸谳^短又可以利用它作為抗旱救災(zāi)作物。此外，黍稷營養(yǎng)豐富，具有較高的蛋白質(zhì)含量和脂肪含量，氨基酸種類豐富，富含多種微量元素和維生素，長期以來一直是我國北方地區(qū)不可或缺的特色糧食作物。然而迄今為止，國內(nèi)外很少有從分子

5、水平研究黍稷種質(zhì)資源的報(bào)道。本研究利用本實(shí)驗(yàn)室開發(fā)的SSR標(biāo)記對國內(nèi)黍稷主要育成品種及其親本進(jìn)行了遺傳多樣性分析，同時(shí)利用育成品種與野生材料創(chuàng)制遺傳群體，結(jié)合篩選到的SSR標(biāo)記，構(gòu)建黍稷分子遺傳圖譜。本實(shí)驗(yàn)的主要研究結(jié)果如下：1）對來自中國各省收集的黍稷88份黍稷育成品種及其親本進(jìn)行遺傳多樣性分析。從67對SSR引物的擴(kuò)增片段看出黍稷種質(zhì)多樣性呈中等水平。共檢測179個等位基因，平均每個位點(diǎn)的等位基因數(shù)為2.7個。多態(tài)信息含量（PIC）以及預(yù)期雜合度（HE）分別介于0.043到0.729之間（平均

6、0.376）和0.045到0.771（平均0.445）之間。2）UPGMA聚類分析結(jié)果顯示，在遺傳相似值為0.633處將88份材料分成四組。遺傳結(jié)構(gòu)分析表明，在地域和遺傳多樣性之間具有密切的相關(guān)性。這些研究結(jié)果對于黍稷的基因庫遺傳多樣性分析、黍稷的遺傳育種有著重要的價(jià)值。另外，開發(fā)到的黍稷專用SSR標(biāo)記還可有效于黍稷種質(zhì)資源遺傳多樣性和種群結(jié)構(gòu)的評估。3）用于遺傳圖譜構(gòu)建的SSR多態(tài)性篩選結(jié)果顯示：共3506對引物進(jìn)行SSR多態(tài)性篩選，得到有多態(tài)的引物235對，占總數(shù)的6.7%，其中群體一的兩個親

7、本所特有的引物有36對，群體二的兩個親本中特有的引物有98對，兩個群體共有的多態(tài)性引物有111對；引物堿基結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn)選用的3506對引物中有1173個雙堿基重復(fù)SSR和2333個三堿基重復(fù)SSR，篩選到的多態(tài)性引物中，雙堿基重復(fù)有102個，三堿基重復(fù)133個。將這些引物上群體后得到在群體中有多態(tài)的引物150對，其中在群體一中有多態(tài)的有130對，在群體二中有多態(tài)的有101對。I4）黍稷分子遺傳圖譜構(gòu)建結(jié)果顯示：利用winQTLcart軟件得到黍稷連鎖圖譜，其中群體一覆蓋了660.3cM，包含13個

8、連鎖群，連鎖群上最小標(biāo)記間的距離是0.2cM，最大標(biāo)記間的距離為44.7cM，平均兩個標(biāo)記的距離是63.2cM。連鎖群上最多包括20個標(biāo)記，最少包括2個標(biāo)記，平均每條連鎖群上包含4個標(biāo)記。最長連鎖群覆蓋了約126.7cM的長度，而最短的連鎖群只覆蓋24.6cM的長度，平均每個連鎖群長度為50.8cM。群體二覆蓋了251.3cM，包含了3個連鎖群，連鎖群上最小標(biāo)記間的距離是0.7cM，最大標(biāo)記間的距離為46.5cM，平均兩個標(biāo)記的距離是9.3cM。連鎖群上最多包括23個標(biāo)記，最少包括