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《肥尾和瘦尾羊全基因組選擇信號(hào)檢測(cè)》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、級(jí):論文編號(hào):中囯農(nóng)業(yè)科學(xué)院肥尾和瘦尾羊全基因組選擇信號(hào)檢測(cè)Genome-wideDetectionofSelectionSignaturesbetweenFat-tailedandThin-tailedSheepPopulations碩士研究生：劉真指導(dǎo)教師：魏彩虹副研究員申請(qǐng)學(xué)位類別：農(nóng)業(yè)推廣碩士專業(yè)領(lǐng)域名稱：養(yǎng)殖培養(yǎng)單位：北京畜牧獸醫(yī)研究所研宄生院2015年5月Secrecy:No.ChineseAcademyofAgriculturalSciencesDissertationGenome-wideDetectionofSelection
2、SignaturesbetweenFat-tailedandThin-tailedSheepPopulationsM.S.Candidate：ZhenLiuSupervisor：ViceProf.CaihongWeiDegree：MasterofAgriculturalExtensionSpecialty:AnimalmolecularbreedingMay2015獨(dú)創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的論文是我個(gè)人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。盡我所知，除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包含
3、為獲得中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院或其它教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我一同工作的同志對(duì)本研究所做的任何貢獻(xiàn)均已在論文中作了明確的說明并表示了謝意。研究生簽名：時(shí)間：年月日關(guān)于論文使用授權(quán)的聲明本人完全了解中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，即：中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院有權(quán)保留送交論文的復(fù)印件和磁盤，允許論文被查閱和借閱，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。同意中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院可以用不同方式在不同媒體上發(fā)表、傳播學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容。研究生簽名：時(shí)間：年月日導(dǎo)師簽名：時(shí)間：年月日中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文評(píng)閱人、答辯委員會(huì)簽名表論文
4、題目不同尾型綿羊（蒙古羊和藏羊）全基因組選擇信號(hào)檢測(cè)論文作者劉真專業(yè)領(lǐng)域養(yǎng)殖研究方向動(dòng)物遺傳育種北京畜牧獸醫(yī)研究指導(dǎo)教師魏彩虹培養(yǎng)單位（研究所、中心）所姓名職稱單位專業(yè)簽名評(píng)閱人答辯主席答辯委員會(huì)議記錄（秘書）論文答辯時(shí)間地點(diǎn)摘要選擇信號(hào)是生物在人工或自然選擇過程中，由于選擇作用在基因組上留下的選擇印跡，通常情況下表現(xiàn)為染色體長(zhǎng)范圍的連鎖不平衡或者遺傳多態(tài)性的降低。為研究不同尾型綿羊群體遺傳分化程度，檢測(cè)全基因組選擇信號(hào)，以挖掘與不同尾型綿羊重要性狀相關(guān)的候選基因。本研究基于蒙古羊（短脂尾）和藏羊（瘦尾）群體的IlluminaOvineSNP5
5、0K芯片分型數(shù)據(jù)，借助遺傳分化系數(shù)FST法進(jìn)行群體間選擇信號(hào)檢測(cè)分析，應(yīng)用生物信息學(xué)方法分析尋找選擇信號(hào)區(qū)域內(nèi)的重要基因，并對(duì)其中與脂肪代謝相關(guān)的基因PPARG、PDGFD在呼倫貝爾羊（大尾和小尾品系；肥尾）與藏羊（瘦尾）尾脂進(jìn)行mRNA相對(duì)表達(dá)量研究。結(jié)果如下：（1）465個(gè)SNPs受選擇，通過基因注釋找到448個(gè)候選基因，GO功能富集分析表明這些基因主要富集在發(fā)育過程、細(xì)胞形態(tài)建成、大分子分解代謝等條目；并在這些候選基因中篩選出50個(gè)與脂類代謝相關(guān)的基因，GO功能富集分析發(fā)現(xiàn)這些基因主要富集在脂類生物合成過程、磷脂代謝、脂質(zhì)結(jié)合等條目，此外
6、發(fā)現(xiàn)4個(gè)基因（PPARG、RXRG、SLC27A2和ACSL6）富集到PPAR信號(hào)通路。PPARG和PDGFD作為候選基因參與了脂肪代謝過程，可能與尾脂形成有重要關(guān)系。（2）對(duì)脂肪代謝合成相關(guān)重點(diǎn)候選基因PPARG和PDGFD進(jìn)行尾脂組織相對(duì)表達(dá)量研究表明：肥瘦尾之間，呼倫貝爾羊（大尾和小尾品系）PPARG和PDGFD基因表達(dá)量均顯著高于藏羊（P<0.01），而大小肥尾之間，呼倫貝爾羊大尾品系PPARG基因表達(dá)量顯著高于小尾品系（P<0.05），PDGFD基因表達(dá)量則無明顯差異。本研究采用FST法有效檢測(cè)到受選擇的基因，其中部分基因與綿羊重要性
7、狀相關(guān)，并通過相對(duì)定量實(shí)驗(yàn)證明PPARG和PDGFD基因與尾部脂肪沉積密切相關(guān)，可以作為尾型選育的候選基因，為綿羊育種及改良提供重要有益參考。關(guān)鍵詞：全基因組,群體分化指數(shù)（FST）,選擇信號(hào),脂肪沉積,候選基因IAbstractSelectionsignaturesaretheselectivefootprintsacrosstheorganismgenomeduetotheeffectofselectionintheprocessofartificialselectionornaturalselection,whichdisplayedth
8、elongrangelinkagedisequilibriuminchromosomeorgeneticdiversityreduction.This
