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1、學士學位論文嶧城主栽石榴品種ISSR分子標記引物篩選姓名學號:1指導(dǎo)教師:系別:專業(yè):完成日期:學院學士學位論文作者聲明本人聲明:本人呈交的學位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下取得的研究成果。對前人及其他人員對本文的啟發(fā)和貢獻已在論文中作出了明確的聲明,并表示了謝意。論文中除了特別加以標注和致謝的地方外,不包含其他人和其它機構(gòu)已經(jīng)發(fā)表或者撰寫過的研究成果。本人同意學校根據(jù)《中華人民共和國學位條例暫行實施辦法》等有關(guān)規(guī)定保留本人學位論文并向國家有關(guān)部門或資料庫送交論文或者電子版,允許論文被查閱和借閱;本人授權(quán)棗莊學院可以將本人學位論文的全部或者
2、部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進行檢索,可以采用影印、縮印或者其它復(fù)制手段和匯編學位論文(保密論文在解密后應(yīng)遵守此規(guī)定)。作者簽名:日期:年月日摘要本研究以嶧城萬畝石榴園的石榴幼葉為材料,采用CTAB法提取石榴基因組DNA。利用電泳和紫外分光光度法分析其完整性、純度及濃度.利用ISSR標記技術(shù)對42個石榴品種遺傳關(guān)系進行了分析。篩選出多態(tài)性高的UBC811ISSR引物,共擴增出29條DNA條帶,其中多態(tài)性帶7條,多態(tài)性百分率為21.12%,特異條帶1條?!娟P(guān)鍵詞】石榴;ISSR;種質(zhì)資源;遺傳多樣性;親緣關(guān)系A(chǔ)bstract目錄第1章引言1
3、1.1ISSSR分子標記11.2本研究的目的與意義4第2章材料與儀器62.1材料62.2試劑72.3儀器設(shè)備8第3章實驗方法93.1CTAB法提取DNA93.2DNA濃度和純度測定方法103.2.1DNA質(zhì)量檢驗方法103.2.2DNA的濃度和純度測定方法103.3PCR擴增反應(yīng)103.4電泳與成像113.5數(shù)據(jù)獲取與分析11第4章結(jié)果與分析124.1石榴基因組DNA?的提取結(jié)果分析124.1.1DNA完整性分析及兩種提取方法的比較124.1.2DNA純度和濃度測定結(jié)果134.2ISSR擴增結(jié)果第5章結(jié)論與討論185.1討論185.
4、2結(jié)論18參考文獻19致謝22石榴葉中DNA提取和RAPD體系中引物的篩選第1章引言石榴(PunicagranatumL.)為石榴科石榴屬落葉灌木或小喬木,又名若榴、丹若、天漿、金罌、狂花等。石榴原產(chǎn)伊朗、阿富汗等中亞一帶,從西漢張騫出使西域?qū)⑼苛职彩褚胛覈?,至今已有超過2000年的栽培歷史[1],經(jīng)長期天然雜交及基因突變,以及采用實生、分株、嫁接等多種繁殖方法,使其產(chǎn)生了復(fù)雜多樣的品種和類型,據(jù)不完全統(tǒng)計,我國現(xiàn)有石榴品種資源約200多個,分布南北各地20多個省區(qū)。各地研究者對石榴種質(zhì)資源進行調(diào)查研究時,大多都局限于某一地區(qū),
5、各自從不同的角度對石榴進行了種下分類,導(dǎo)致品種混雜、同種異名、同名異種的現(xiàn)象出現(xiàn)[2],長期以來,給準確進行品種資源鑒定和利用帶來了困難。我們究旨在利用ISSR標記技術(shù),對石榴的遺傳多樣性與親緣關(guān)系進行分析,以期為石榴種下分類提供分子依據(jù),為更有效地保護石榴資源及選育新品種提供遺傳信息。1.1ISSR分子標記ISSR(inter-simplesequencesrepeats)即簡單序列重復(fù)區(qū)間標記法,是由Zietkiewicz等1994[7]年提出的一種DNA標記技術(shù),該技術(shù)檢測的是2個相近SSR之間的一段短DNA序列上的多態(tài)性.在
6、SSR的3’端或5’端加錨1~4個嘌呤或嘧啶堿基,并以此作為引物,通常為16~18個堿基序列,對兩側(cè)具有反向排列的SSR之間的一段DNA序列進行擴增,然后進行電泳、染色,根據(jù)譜帶的有無及相對位置,來分析不同樣品間ISSR標記的多態(tài)性.由于ISSR引物堿基數(shù)量多,退火溫度高,可重復(fù)性好,非特異性擴增少,真核生物富含SSR序列且變異最快,故ISSR擴增出的條帶多且多態(tài)性要比RAPD,SSR,RFLP等更加豐富.ISSR為顯性標記,符合孟德爾遺傳規(guī)律,并且無需克隆、制備探針、分子雜交等工作,具有簡便迅速、高效、實驗成本低等優(yōu)點.因此,IS
7、SR技術(shù)現(xiàn)已在遺傳多樣性[8]、親緣關(guān)系分析[9]、遺傳作圖[10]、品種鑒定[11]、進化[12]等研究方面被廣泛應(yīng)用.ISSR被認為是研究種群遺傳多樣性的一種非常有效的分子標記手段[13-17]19石榴葉中DNA提取和RAPD體系中引物的篩選1.2本研究的目的與意義棗莊是我國的主要石榴產(chǎn)區(qū)之一,栽培面積達1.6萬公頃,具有48多個種,被譽為“冠世榴園”。近年廣泛開展了種質(zhì)資源的調(diào)查、收集、保存和良種選育工作,并在此基礎(chǔ)上,對嶧城石榴的種、變種、品種的劃分、評價、利用等問題進行了分析研究[6]。但由于長期的引種和選擇,已很難從植物
8、的外部形態(tài)上來確定品種的來源和品種間的親緣關(guān)系,存在著同名異種或同種異名的問題[8],這給準確進行品種資源鑒定和利用帶來了困難。近年來,ISSR技術(shù)在石榴品種鑒定中得到了廣泛的應(yīng)用,但該技術(shù)對反應(yīng)條件要求十分嚴格,不同材料需要的引物不