(管控一體化)2006年第22卷第3-3期文章編號(hào):1008-0570(2006)03—3—0124—03構(gòu)架Linux環(huán)境下基于MPICH的工作站機(jī)群ConstructCOWBasedonMP">
構(gòu)架Linux環(huán)境下基于MPICH的工作站機(jī)群

構(gòu)架Linux環(huán)境下基于MPICH的工作站機(jī)群

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1、萬(wàn)方數(shù)據(jù)網(wǎng)絡(luò)與通信中文核心期刊《微計(jì)算機(jī)信息>(管控一體化)2006年第22卷第3-3期文章編號(hào):1008-0570(2006)03—3—0124—03構(gòu)架Linux環(huán)境下基于MPICH的工作站機(jī)群ConstructCOWBasedonMPICHinLinuxEnvironment(1.重慶工學(xué)院;2.武漢中國(guó)地質(zhì)大學(xué))洪雄1戴光明2冷春霞2Hong,XiongDai,GuangmingLeng,Chunxia摘要:本文詳細(xì)地介紹了在Hnux環(huán)境下如何構(gòu)架基于MPICH的工作站機(jī)群,給出了具體的步驟和基本配置過(guò)程。最后采用并行求和算法、矩陣相乘并行算法和Multiset

2、s并行歸并算法在該機(jī)群上進(jìn)行實(shí)驗(yàn)測(cè)試。測(cè)試結(jié)果表明,該機(jī)群并行計(jì)算環(huán)境運(yùn)行正常、穩(wěn)定,該機(jī)群比在windows2000環(huán)境下的并行效率高1.12%。關(guān)鍵詞:并行計(jì)算;工作站機(jī)II¥;MPICH中圖分類號(hào):TP316文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:AAbstract:InLinuxenvironment,howtoconstructClusterofWorkstationsbasedonMPICHisintroducedinthispaper.Itprovidesthedetailsofthebasicconfiguration.FinallyweusetheCOWtotestthepara

3、llelsumalgorithm,matrixmultipleparallelalgorithmandparallelmerger-taxisalgorithmformultisets.TestingresultsshowthattheCOWworksstablyandnormally.Thisparallelefficien—cy(1.12%)isproducedinLinuxhigherthanWindows2000.Keywords:ParallelComputing;ClusterofWorkstations;MPICH1引言隨著超大規(guī)模集成電路(VLSI)和I

4、ntemet網(wǎng)絡(luò)技術(shù)的快速發(fā)展,基于網(wǎng)絡(luò)的工作站機(jī)群COW(ClusterofWorkstations)成為當(dāng)今并行計(jì)算的主流技術(shù)。并行計(jì)算(ParallelComputing).簡(jiǎn)單地說(shuō),就是在并行計(jì)算機(jī)上所作的計(jì)算。并行計(jì)算就是平常所說(shuō)的高性能計(jì)算(HighPerformanceComputing)、超級(jí)計(jì)算(SuperComputing)。隨著計(jì)算機(jī)和計(jì)算方法的飛速發(fā)展,并行計(jì)算機(jī)系統(tǒng)及其相關(guān)技術(shù)也發(fā)展得越來(lái)越成熟。世界各國(guó)紛紛投人大量的人力、物力、財(cái)力研究和發(fā)展并行計(jì)算.如美國(guó)的HPCC計(jì)劃、ASCI計(jì)劃等。1997年6月.由Intel公司和Sandia國(guó)家實(shí)驗(yàn)

5、室聯(lián)合研制的MPP(MassivelyParallelProcessors)系統(tǒng)ASCIOptionRed,世界上第一臺(tái)萬(wàn)億次高端并行機(jī)誕生了.于是各國(guó)的超級(jí)計(jì)算機(jī)紛紛崛起。目前,由日本宇宙開發(fā)事業(yè)團(tuán)、日本原子能研究所及海洋科學(xué)技術(shù)中心于2003年3月15日向新聞界公開了將于3月底正式啟動(dòng)的”地球模擬器”。地球模擬器配備有5120個(gè)處理器,理論峰值運(yùn)算性能可達(dá)40太拉FLOPS(浮點(diǎn)演算/秒)。是一臺(tái)處理能力驚人的超級(jí)計(jì)算機(jī)。其性能可與10萬(wàn)。20萬(wàn)臺(tái)個(gè)人電腦相匹敵。工作站性能的迅速提高和價(jià)格日益下降以及高速網(wǎng)絡(luò)產(chǎn)品的陸續(xù)問(wèn)世,使得這種新型的并行計(jì)算系統(tǒng)COW應(yīng)運(yùn)而生。

6、該系統(tǒng)將一群工作站用某種結(jié)構(gòu)的網(wǎng)絡(luò)互連起來(lái),充分利用各工作站的資源,統(tǒng)一調(diào)洪雄:助教本文得到湖北省自然科學(xué)基金(2003ABA045)的資助度、協(xié)調(diào)處理,以實(shí)現(xiàn)高效并行運(yùn)算。和對(duì)稱多處理機(jī)SMP和大規(guī)模并行機(jī)MPP相比,COW在實(shí)用上具有一些明顯的優(yōu)點(diǎn),如投資風(fēng)險(xiǎn)小、編程方便、系統(tǒng)結(jié)構(gòu)靈活、性能/價(jià)格比高、能充分利用分散的計(jì)算資源和可擴(kuò)充性好等。對(duì)于一般的用戶,通過(guò)一個(gè)普通的局域網(wǎng)就可以搭建一個(gè)工作站機(jī)群。工作站機(jī)群變得如此吸引人,是因?yàn)閷?shí)驗(yàn)表明,它能夠高效地執(zhí)行一些并行任務(wù),而且它們不受政策與經(jīng)濟(jì)條件的限制。工作站機(jī)群可以由那些在晚上或周末”空閑”的PC機(jī)或工作站組成

7、。事實(shí)上,由臺(tái)式計(jì)算機(jī)構(gòu)成這樣的系統(tǒng)無(wú)需任何額外的投資。2系統(tǒng)結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)介工作站機(jī)群的構(gòu)建實(shí)際上就是局域網(wǎng)的構(gòu)建,只是由于使用目的不同,在拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)、服務(wù)模式以及相應(yīng)的軟件平臺(tái)的配置上與LAN有所不同。本文構(gòu)建的工作站機(jī)群由四個(gè)節(jié)點(diǎn)機(jī)通過(guò)互連網(wǎng)絡(luò)連接而成,構(gòu)成一個(gè)對(duì)等模式的100BASE—TX以太局域網(wǎng).如圖1所示。Node(i)為節(jié)點(diǎn)機(jī)的名字.其中互連網(wǎng)絡(luò)采用實(shí)達(dá)16端口10/lOOMbpsHub連接.4臺(tái)節(jié)點(diǎn)機(jī)采用聯(lián)想啟天4000P4處理器,CPU1.5G,內(nèi)存為256MB。系統(tǒng)的軟件環(huán)境為RedHatLinux9.0,并行運(yùn)行環(huán)境為MPI

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