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《基于線粒體COI基因部分序列的長(zhǎng)江口蝦虎魚科魚類系統(tǒng)分類》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、第44卷第5期淡水漁業(yè)2014年9月Vol.44No.5FreshwaterFisheriesSep.2014基于線粒體COI基因部分序列的長(zhǎng)江口蝦虎魚科魚類系統(tǒng)分類1，22221，2于亞男，宋超，侯俊利，王妤，莊平(1.南京農(nóng)業(yè)大學(xué)無錫漁業(yè)學(xué)院，江蘇無錫214182;2.中國(guó)水產(chǎn)科學(xué)研究院東海水產(chǎn)研究所，上海200090)摘要:對(duì)采自長(zhǎng)江口的7種蝦虎魚(Gobiidae)19個(gè)個(gè)體的線粒體COI基因進(jìn)行測(cè)序，其他6種蝦虎魚的相應(yīng)序列從Genbank中獲得。序列分析結(jié)果顯示7種蝦虎魚的COI基因部分序列密碼子的第一位堿基的GC堿基含量最
2、恒定，第三位堿基的GC含量最高，平均A+T的含量要高于G+C的含量，與多種魚類的COI基因的堿基特點(diǎn)相似。運(yùn)用MEGA5.0計(jì)算13種蝦虎魚的種間遺傳距離，表明拉氏狼牙蝦虎魚(Oxyurichthytentacularis)與孔蝦虎魚(Chaeturichthysstigmatias)歸屬于近盲蝦虎魚亞科，根據(jù)種間遺傳距離與系統(tǒng)發(fā)育樹的結(jié)構(gòu)特征推測(cè)，觸角溝蝦虎魚和矛尾蝦虎魚可能具有共同的起源。關(guān)鍵詞:蝦虎魚科;線粒體細(xì)胞C亞基(COI);分子系統(tǒng)分類中圖分類號(hào):S917.4文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào):1000-6907-(2014)05-0
3、003-06DOI:10.13721/j.cnki.dsyy.2014.05.001SystemclassificationforGobiidaederivedfromtheYangtzeＲiverbasedonmitochondrialCOIgenepartialsequence1，22221，2YUYa-nan，SONGChao，HOUJun-li，WANGYu，ZHUANGPing(1.WuxiFisheriesCollege，NanjingAgriculturalUniversity，Wuxi214182，Jiangsu，Chi
4、na;2.EastChinaSeaFisheriesＲesearchInstitute，ChineseAcademyofFisherySciences，Shanghai200090，China)Abstract:AtotalofnineteenspecimensofsevenspeciesofGobiidaederivedfromtheYangtzeＲiverweresequencedmito-chondrialCOIgenes．Sequencesfromhomologousregionsofsixotherspeciesofthisf
5、amilyweregatheredfromGenbank．TheresultsshowedthatthemostconstantGCcontentwasinthefirstbaseofcodonandthehighestGCcontentexistedinthethirdbaseofcodon．TheaveragecontentofA+TwashigherthantheaveragecontentofG+C．Thefeaturewassimi-lartomostfishes．ComparingtheCOIgeneofthirteensp
6、eciesofGobiidaewithMEGA5.0，thetaxonomicstatusofOdont-amblyopuslacepediiandTrypauchenvaginawereprovedlegitimately．Thegeneticdistancebetweenspeciesandthestruc-turefeatureofPhylogenytreeindicatedthesameoriginofOxyurichthytentacularisandChaeturichthysstigmatias．Keywords:Gobi
7、idae;cytochromeoxidasesubunitI(COI)gene;molecularsystemclassification蝦虎魚科(Gobiidae)隸屬鱸形目，是中華鱘幼碼基因之一，中度保守，既能保證足夠的變異又易［1］魚索餌洄游的主要餌料生物，以鉤蝦、枝角類、于被通用引物擴(kuò)增，且很少存在插入與缺失，可用［4］橈足類等為食，是水域生態(tài)系統(tǒng)中物質(zhì)循環(huán)和能量于種間及種以上階元的分析。長(zhǎng)江口水域環(huán)境［2］傳遞的重要一環(huán)，在長(zhǎng)江口生態(tài)系統(tǒng)中具有重復(fù)雜多變，分布的蝦虎魚科常見種類有10種左［3］［5］要地位。COI基因是魚類線粒
8、體13個(gè)蛋白質(zhì)編右，以COI基因?qū)ζ溥M(jìn)行系統(tǒng)分類及進(jìn)化關(guān)系收稿日期:2014－02－28;修訂日期:2014－05－21資助項(xiàng)目:長(zhǎng)江水環(huán)境教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室開放課題(YＲWEE201106);公益性行業(yè)(農(nóng)
