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《基于線粒體 COI 基因部分序列的長江口蝦虎魚科魚類系統分類.pdf》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關內容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、第44卷第5期淡水漁業(yè)2014年9月Vo1．44No．5FreshwaterFisheriesSep．2014基于線粒體CO1基因部分序列的長江口蝦虎魚科魚類系統分類于亞男，宋超，侯俊利，王妤，莊平(1．南京農業(yè)大學無錫漁業(yè)學院，江蘇無錫214182；2．中國水產科學研究院東海水產研究所，上海200090)摘要：對采白長江口的7種蝦虎魚(Gobiidae)19個個體的線粒體CO1基因進行測序，其他6種蝦虎魚的相應序列從Genbank中獲得。序列分析結果顯示7種蝦虎魚的COl基因部分序列密碼子的第一位堿
2、基的GC堿基含量最恒定，第三位堿基的GC含量最高，平均A+T的含量要高于G+c的含量，與多種魚類的COl基因的堿基特點相似。運用MEGA5．0計算13種蝦虎魚的種問遺傳距離，表明拉氏狼牙蝦虎魚(Oxyurichthytentacularis)與孔蝦虎魚(Chaeturichthysstigmatias)歸屬于近盲蝦虎魚亞科，根據種間遺傳距離與系統發(fā)育樹的結構特征推測，觸角溝蝦虎魚和矛尾蝦虎魚可能具有共同的起源。關鍵詞：蝦虎魚科；線粒體細胞c亞基(CO1)；分子系統分類中圖分類號：$917．4文獻標識碼
3、：A文章編號：1000—6907一(2014)05-0003-06SystemclassificationforGobiidaederivedfromtheYangtzeRiverbasedonmitochondrialCO1genepartialsequenceYUYa．nan，SONGChao，HOUJun．1．i．，WANGYu，ZHUANGPing，(1．WuxiFisheriesCollege，NanjingAgriculturalUniversity，Wuxi214182，Jiangsu，
4、China；2．EastChinaSeaFisheriesResearchInstitute，ChineseAcademyofFisherySciences，Shanghai200090，China)Abstract：AtotalofnineteenspecimensofsevenspeciesofGobiidaedelvedfromtheYangtzeRiverwerecouectedtose—quencemitoehondriMCOIgenes．Sequencesfromhomologousreg
5、ionsofsixotherspeciesofthisfamilyweregatheredfromGenbank．TheresultsshowedthatthemostconstantGCcontentwasinthefirstbaseofcodonandthehighestGCcontentexistedinthethirdbaseofcodon．TheaveragecontentofA+TwashigherthantheaveragecontentofG+C．Thefeaturewassimila
6、rtomostfishes．ComparingtheCO1geneofthiaeenspeciesofGobiidaewithMEGA5．0，thetaxonomicstatusofOdontamblyopnslacepediiandTrypauchenvaginawereprovedlegitimately．ThegeneticdistancebetweenspeciesandthestructurefeatureofPhylogenytreeindicatedthesameoriginofOxyu
7、richthytentacularisandChaeturichthysstigmatias．Keywords：Gobiidae；cytochromeoxidasesubunitI(CO1)gene；molecularsystemclassification蝦虎魚科(Gobiidae)隸屬鱸形目，是中華鱘幼碼基因之一，中度保守，既能保證足夠的變異又易魚索餌洄游的主要餌料生物，以鉤蝦、枝角類、于被通用引物擴增，且很少存在插人與缺失，可用橈足類等為食，是水域生態(tài)系統中物質循環(huán)和能量于種問及種以上階元的分析
8、。長江口水域環(huán)境傳遞的重要一環(huán)，在長江口生態(tài)系統中具有重復雜多變，分布的蝦虎魚科常見種類有10種左要地位。CO1基因是魚類線粒體13個蛋白質編右，以CO1基因對其進行系統分類及進化關系收稿日期：2014—02—28；修訂日期：2014—05—21資助項目：長江水環(huán)境教育部重點實驗室開放課題(YRWEE201106)；公益性行業(yè)(農業(yè))科研專項(201203065)；長江口中華鱘自然保護區(qū)專項；上海市青草沙水庫l臨近水域生態(tài)修復專項第一作者簡介：于亞男(1
