豬5羥色胺4受體基因的克隆和表達(dá)規(guī)律的研究

豬5羥色胺4受體基因的克隆和表達(dá)規(guī)律的研究

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1、上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文豬5-羥色胺4受體基因的克隆和表達(dá)規(guī)律的研究姓名:趙威申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)與飼料科學(xué)指導(dǎo)教師:潘玉春20050101上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文中文摘要豬5-羥色胺4受體基因的克隆和表達(dá)規(guī)律研究摘要在現(xiàn)代化的養(yǎng)豬生產(chǎn)中仔豬早期斷奶由于具有提高母豬的生產(chǎn)效力滿足仔豬生長(zhǎng)的營(yíng)養(yǎng)需要降低飼養(yǎng)成本等優(yōu)點(diǎn)而得到廣泛的推廣和應(yīng)用但是由此引發(fā)的以應(yīng)激性腹瀉為主要特征的仔豬斷奶應(yīng)激性綜合癥同時(shí)也給仔豬生長(zhǎng)和養(yǎng)豬生產(chǎn)都帶來(lái)了巨大的負(fù)面影響目前對(duì)斷奶應(yīng)激的研究更多地集中在提高營(yíng)養(yǎng)水平改善環(huán)境條件和飼養(yǎng)管理以及應(yīng)激疾病的病理學(xué)方面對(duì)應(yīng)激性腹瀉產(chǎn)生的分子機(jī)

2、理及相關(guān)基因的研究很少5-羥色胺4受體5-HT4R是G-蛋白偶聯(lián)受體超家族的成員廣泛分布在胃腸道系統(tǒng)中參與調(diào)節(jié)胃腸道的運(yùn)動(dòng)吸收和分泌是引起應(yīng)激性腹瀉的重要調(diào)控因子本文通過(guò)對(duì)豬5-HT4R基因的克隆蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)功能的分析組織表達(dá)規(guī)律的檢測(cè)旨在從分子水平了解仔豬斷奶應(yīng)激的產(chǎn)生機(jī)理進(jìn)而推動(dòng)豬的抗病育種同時(shí)為以豬為動(dòng)物模型進(jìn)行人類疾病的研究提供基礎(chǔ)研究資料本研究以杜長(zhǎng)大三元雜交商品仔豬為試驗(yàn)材料運(yùn)用生物信息-1-上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文中文摘要學(xué)和候選基因研究的方法克隆了豬5-HT4R基因序列并對(duì)其蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)功能組織表達(dá)規(guī)律進(jìn)行了研究具體內(nèi)容與結(jié)果如下1利用同源克隆方法首次

3、克隆得到了豬5-HT4R基因全長(zhǎng)編碼序列CDS該基因包含一個(gè)長(zhǎng)1209bp的開放閱讀框編碼402個(gè)氨基酸的豬5-HT4R蛋白同源性比較分析發(fā)現(xiàn)所獲CDS序列和所編碼的氨基酸序列與人鼠狗等5種動(dòng)物5-HT4R基因CDS和氨基酸序列具有高度的同源性可以確定其屬于5-HT4R家族進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)所獲氨基酸的C末端結(jié)構(gòu)與其它物種的5-HT4R基因b亞型的結(jié)構(gòu)相一致因此可以確定該基因?yàn)樨i的5-HT4R基因b亞型2應(yīng)用生物信息學(xué)的方法預(yù)測(cè)豬5-HT4R蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能結(jié)果表明豬5-HT4R是一種膜受體蛋白屬于G蛋白偶聯(lián)受體超家族包含一個(gè)GPCR結(jié)構(gòu)域包括4個(gè)胞外域7個(gè)跨膜域和

4、4個(gè)胞內(nèi)域分別有95161146個(gè)氨基酸殘基其中跨膜域的氨基酸序列具有高度保守性而胞內(nèi)域的C末端結(jié)構(gòu)存在很大的變異豬與人和其他哺乳動(dòng)物的5-HT4R具有相似的氨基酸結(jié)構(gòu)和功能所不同的是豬5-HT4R第二胞外環(huán)結(jié)構(gòu)域中插入一個(gè)編碼14個(gè)氨基酸的外顯子基于人和動(dòng)物5-HT4R氨基酸序列繪制的進(jìn)化樹顯示豬與人和鼠等物種的5-HT4R蛋白親緣關(guān)系都相對(duì)較近-2-上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文中文摘要3利用半定量RT-PCR和實(shí)時(shí)熒光定量PCR兩種方法檢測(cè)豬5-HT4R基因在不同組織中的表達(dá)規(guī)律結(jié)果發(fā)現(xiàn)其廣泛表達(dá)于不同組織中但不同組織內(nèi)的表達(dá)量卻存在差異其中較高地表達(dá)于腦組織和腸

5、組織中中等程度表達(dá)于心脾肺腎和胃較低表達(dá)于肌肉和肝臟中這一結(jié)果同人和哺乳動(dòng)物的基本一致關(guān)鍵詞:豬5-HT4受體RT-PCR實(shí)時(shí)熒光定量PCR斷奶應(yīng)激應(yīng)激性腹瀉表達(dá)規(guī)律生物信息學(xué)-3-上海交通大學(xué)碩士學(xué)位論文英文摘要STUDIESONCLONINGANDEXPRESSIONOF5-HT4RECEPTORGENEINPIGABSTRACTInmodernpigindustry,pigletsearlyweanhasbeenbroadlyappliedforitscharacteristicsthatpromotingthebreedingefficiencyofsow

6、s,meetingthenutritionalneedofpigletsandreducingthefeedingcosts.WhereasitcouldalsocauseEarlyWeanedStress(EWS),especiallystressdiarrhea,whichresultsinthenegativeeffectsonthepigletsgrowthandthepigsfeeding.RecentlythemostlyresearchesabouttheEWShavefocusedonnutritionandenvironment,suchasim

7、provingthenutritionallevelsofpiglets,promotingtheconditionofbreedingroomandfeedingmanagement.Someresearchershavestudiedthepathologyofstressdiseases,buttherewerefewreportsaboutthemolecularmechanismsandthestressdiarrhearelatedgenes.5-HT4receptors,whichbelongtothesuperfamilyofG-proteinco

8、upled

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