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1、第31章氨基酸及其重要衍生物的生物合成一、概論(一)氨的來源(二)碳骨架的來源(三)生物固氮紅色為固氮菌類菌體,藍(lán)色為類菌體周膜,黃色和綠色為被感染細(xì)胞的細(xì)胞核。硝酸鹽同化酶結(jié)構(gòu)域的序列構(gòu)成硝酸鹽和亞硝酸鹽還原酶的輔基:(a)硝酸鹽還原酶的鉬輔因子,鉬的載體為喋啉衍生物。(b)是卟啉的衍生物,羧基可以作為氫離子的供體,將亞硝酸鹽還原為銨鹽。從固氮酶發(fā)現(xiàn)的兩種金屬串:(a)P-串,2個(gè)Fe4S3串共用第四個(gè)硫,并以二硫鍵與蛋白質(zhì)相連。(b)FeMo輔因子,這一新的Fe-S復(fù)合物含有1個(gè)Mo,7個(gè)Fe和9個(gè)S,通過Mo和Fe與蛋白質(zhì)相連。打破3個(gè)共價(jià)鍵需要大
2、量的能量固氮酶催化的反應(yīng)a.固氮酶還原酶(鐵蛋白)的帶狀圖解,左側(cè)為ATP結(jié)合部位,右側(cè)為Fe4S4結(jié)合部位。b.固氮酶還原酶與固氮酶αβ二聚體形成的復(fù)合物,固氮酶還原酶(綠色和黃色)的Fe4S4中心靠近固氮酶αβ二聚體(紅色和藍(lán)色),P-串和FeMo輔因子位于其中。(四)固氮反應(yīng)的調(diào)控(五)固氮的基因表達(dá)調(diào)控1.自身固氮克氏桿菌的固氮基因研究的較深入,其固氮基因群除固氮酶基因nifHDK外,nifE,nifN,nifB和nifQ與FeMoco的加工或裝配有關(guān),nifS及nifU的產(chǎn)物參與FeMoco的加工和裝配,nifM的產(chǎn)物參與FeMoco的加工成熟
3、,nifF和nifJ的產(chǎn)物與固氮酶系的電子傳遞有關(guān),nifLA是調(diào)控基因。2.共生固氮根瘤菌的結(jié)瘤基因nodA,B,C是細(xì)胞分裂和宿主根毛彎曲所必需的,核苷酸序列較保守,nodEF,nodG,nodH或nodLMN參與宿主的選擇,與根毛彎曲的位置,細(xì)胞分裂的效率和持久性有關(guān)。固氮基因分為nif基因和fix基因兩群,前者與克氏桿菌的固氮基因相似,后者的功能有待進(jìn)一步研究。豆科植物的早期結(jié)瘤素基因與根瘤的早期形成有關(guān),晚期結(jié)瘤素基因表達(dá)多種酶和一些功能不清的結(jié)瘤素。(六)生物固氮的基因工程1.使非豆科植物轉(zhuǎn)變?yōu)楣痰魑?1)將豆科植物的結(jié)瘤基因?qū)肫渌魑铮?/p>
4、使其能夠感染固氮菌。(2)改變根瘤菌的遺傳結(jié)構(gòu),使其能夠感染其它作物。(3)將固氮基因?qū)敕嵌箍浦参铩S捎诠痰笍?fù)合體對(duì)氧的抑制作用十分敏感,消耗大量的ATP,這一領(lǐng)域還有不少問題要研究解決。2.提高現(xiàn)有固氮作物的固氮能力(1)將固氮效率高的根瘤菌固氮基因族導(dǎo)入結(jié)瘤能力強(qiáng)的根瘤菌中。(2)將外源共生基因?qū)敫鼍?,提高其結(jié)瘤能力或固氮能力。(3)培育抗藥的根瘤菌。二.氨基酸的生物合成L-谷氨酸的生物合成L-谷氨酰胺的生物合成(一)谷氨酸族氨基酸的生物合成:L-谷氨酸,L-谷氨酰胺,L-脯氨酸細(xì)菌谷氨酰胺合成酶的結(jié)構(gòu):(a)十二聚體由兩個(gè)六聚體組成。(b
5、)谷氨酰胺合成酶的分子結(jié)構(gòu)。谷氨酰胺合成酶的共價(jià)修飾,12個(gè)單體可以被逐步腺苷酸化而失活。循環(huán)串聯(lián)系統(tǒng)調(diào)控谷氨酰胺合成酶的共價(jià)修飾谷氨酰胺合成酶的反饋抑制別購調(diào)控L-脯氨酸的生物合成細(xì)菌合成鳥氨酸的途徑氨基移換酶的作用機(jī)制氨甲酰磷酸合成酶?,即NH3-依賴的線粒體CPS同工酶的作用機(jī)制。鳥氨酸經(jīng)過尿素循環(huán)生成瓜氨酸和精氨酸蕈類和眼蟲L-賴氨酸的生物合成途徑高檸檬酸順-高烏頭酸高異檸檬酸α-酮己二酸α-氨基己二酸6-腺苷基α-氨基己酸α-氨基己酸-δ-半醛酵母氨酸(二)天冬氨酸族的生物合成:L-天冬氨酸,L-天冬酰胺,L-甲硫氨酸,L-蘇氨酸L-天冬氨酸的
6、生物合成L-天冬酰胺的生物合成L-甲硫氨酸,L-蘇氨酸和L-賴氨酸的生物合成途徑胱硫醚琥珀酰二氨基庚二酸琥珀酰-2-氨基6酮庚二酸六氫吡啶-2,6-二羧酸二氫吡啶-二羧酸消旋二氨基庚二酸二氨基庚二酸由甲硫氨酸合成的S-腺苷甲硫氨酸(SAM)是多胺轉(zhuǎn)移反應(yīng)和多胺合成反應(yīng)的甲基供體腐胺(丁二胺)亞精胺(三)丙酮酸族的生物合成:L-丙氨酸;L-纈氨酸、L-亮氨酸;L-纈氨酸、L-異亮氨酸的生物合成L-亮氨酸的生物合成(四)絲氨酸族的生物合成:L-絲氨酸、L-甘氨酸、L-半胱氨酸的生物合成及固硫作用L-絲氨酸的生物合成異丙基蘋果酸α-酮異己酸L-甘氨酸的生物合成
7、L-半胱氨酸的生物合成硫的同化和產(chǎn)硫化合物的生物合成(五)苯丙氨酸、酪氨酸及色氨酸的生物合成芳香族化合物由分枝酸轉(zhuǎn)化而成對(duì)氨基苯甲酸鄰氨基苯甲酸對(duì)羥基苯甲酸預(yù)苯酸質(zhì)體醌木質(zhì)素分支酸的生物合成2-酮-3脫氧7-磷酸庚酮糖酸5-脫氧奎尼酸5-脫氧莽草酸莽草酸3-稀丙基莽草酸分支酸苯丙氨酸、酪氨酸及色氨酸的生物合成預(yù)苯酸鄰氨基苯甲酸N-(5′-磷酸核糖)-氨基苯甲酸稀醇式L-(O-羧基苯氨酸)-L-脫氧核酮糖-5-磷酸吲哚-3-甘油磷酸由苯丙氨酸生成酪氨酸的途徑色氨酸合成酶是通道多酶復(fù)合體的一個(gè)典型的例子。組氨酸的生物合成5′-磷酸核糖-4-酰胺-5-氨基咪唑
8、核苷酸N1-5′-磷酸核酮糖亞氨甲基-5-氨基咪唑羧酰核苷酸N1-5′-磷酸核酮