中國(guó)寄蠅科（雙翅目）DNA條形碼及線粒體全基因組研究

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1、＊？單位代碼：１０１６６碩士學(xué)位論文中國(guó)寄蠅科（雙翅目）ＤＮＡ條形碼及線粒體全基因組研究論文作者：學(xué)科專(zhuān)業(yè)：動(dòng)物學(xué)指導(dǎo)教師：張春田楊定培養(yǎng)單位：生命科學(xué)學(xué)院培養(yǎng)類(lèi)別：全曰制完成時(shí)間：２０１８年５月３１曰沈陽(yáng)師范大學(xué)學(xué)位評(píng)定委員會(huì)全日制研究生?編號(hào)：類(lèi)教育碩士別同等學(xué)力碩士學(xué)位論文題目：中國(guó)寄蠅科（雙翅目）DNA條形碼及線粒體全基因組研究培養(yǎng)單位：生命科學(xué)學(xué)院專(zhuān)業(yè)名稱(chēng)：動(dòng)物學(xué)指導(dǎo)教師：張春田楊定教授研究生：李新.完成時(shí)間：2018年

2、05月16日沈陽(yáng)師范大學(xué)研究生處學(xué)位論文獨(dú)創(chuàng)性聲明本人所呈交的學(xué)位論文是在導(dǎo)師的指導(dǎo)下取得的研究成果。據(jù)我所知，除文中已經(jīng)注明引用的內(nèi)容外，本論文不包含其他個(gè)人己經(jīng)發(fā)表或撰寫(xiě)過(guò)的研宄成果。對(duì)本文的研宄做出重要貢獻(xiàn)的個(gè)人和集體，均己在文中作了明確說(shuō)明并表示了謝意。－－作者簽名：今私日期：２０１８６３ｚ［學(xué)位論文使用授權(quán)聲明本人授權(quán)沈陽(yáng)師范大學(xué)研宄生處，將本人碩士學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索；有權(quán)保留學(xué)位論文并向國(guó)家主管部門(mén)或其指定機(jī)構(gòu)送交論文

3、的電子版和紙質(zhì)版，允許論文被查閱和借閱；有權(quán)可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存、匯編學(xué)位論文。保密的學(xué)位論文在解密后適用本規(guī)定。日期－－作者簽名：２０１８６３：摘要寄蠅科（Tachinidae）昆蟲(chóng)是雙翅目物種多樣性最大的科之一，目前國(guó)際最新分類(lèi)系統(tǒng)記錄世界寄蠅科有4亞科58族1500屬約8500個(gè)有效種，中國(guó)記錄有4亞科42族285屬1253種，占全世界屬、種的19.00%，14.74%。寄蠅科內(nèi)物種多樣性高，外部形態(tài)復(fù)雜性和趨同現(xiàn)象使得寄蠅科昆蟲(chóng)鑒定困難，而且重復(fù)

4、性鑒定工作量巨大。DNA條形碼物種鑒定利用COI前段658bp長(zhǎng)度的標(biāo)準(zhǔn)目的基因進(jìn)行快速的物種鑒定，其原理是假設(shè)物種內(nèi)部遺傳距離差異遠(yuǎn)小于物種間的遺傳差異，依據(jù)遺傳距離的不同進(jìn)行物種的快速區(qū)分。本研究提取了143頭中國(guó)寄蠅科昆蟲(chóng)的核酸序列，經(jīng)PCR實(shí)驗(yàn)和篩選后，最終獲得74形態(tài)種108條序列。使用8種方法（NJ樹(shù)、jMOTU、ABGD、TaxonDNA、bPTP、BarcodingR、GMYC、BLOG）進(jìn)行DNA條形碼技術(shù)在寄蠅科昆蟲(chóng)快速鑒定的適用性研究，并構(gòu)建寄蠅科DNA條形碼數(shù)據(jù)庫(kù)。各DN

5、A條形碼鑒定程序鑒定結(jié)果如下：jMOTU鑒定成功率為94.44%；ABGD為91.67%；SpeciesIdentifier中BestMatch/BestCloseMatch/Cluster為98.03%,94.11%,81.48%；bPTP為79.63%；BarcodingR中的Bayesian、fuzzyId、bpNewTraining分別為96.55%，86.21%，89.66%；GMYC為89.81%；BLOG為73.68%。分析結(jié)果表明：DNA條形碼技術(shù)在寄蠅科中的鑒定成功率高，但在一

6、些物種中存在鑒定模糊的問(wèn)題，仍需要進(jìn)行少量的人工輔助鑒定。從鑒定結(jié)果來(lái)看，TaxonDNA中的BestMatch方法鑒定成功率98.03%為最高，BarcodingR中的Bayesian方法鑒定成功率為96.55%。推薦使用這兩種軟件進(jìn)行寄蠅科DNA條形碼的分析研究和物種快速鑒定，而且前者操作難度更低。構(gòu)建的數(shù)據(jù)庫(kù)很好的鑒定出本實(shí)驗(yàn)涉及的寄蠅科昆蟲(chóng)，說(shuō)明了數(shù)據(jù)庫(kù)的有效性，為日后的研究提供實(shí)踐基礎(chǔ)。測(cè)定并注釋了首個(gè)突顏寄蠅亞科線粒體全基因組代表種圓腹異突顏寄蠅Ectophasiarotundive

7、ntris(Loew,1858)，序列全長(zhǎng)（不含控制區(qū)）為14,843bp，包含37個(gè)基因；構(gòu)建圓腹異突顏寄蠅以及包括麗蠅科的絲光綠蠅Luciliasericata和麻蠅科的肥須麻蠅Sarcophagacrassipalpis作為外群共7種線粒體全基因組數(shù)據(jù)的NJ和ML方法的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，支持寄蠅科Tachinidae和追寄蠅亞科Exoristinae的單系性；突顏寄蠅亞科Phasiinae作為基部分支，與長(zhǎng)足寄蠅亞科和追寄蠅亞科（Dexiinae+Exoristinae）為姊妹群。關(guān)鍵字：COI

8、分子鑒定；遺傳距離閾值；線粒體全基因組；系統(tǒng)發(fā)育IAbstractTachinidaeisoneofthemostspeciesdiversefamiliesinDiptera,thelatestinternationaltaxonomysystemrecordthatthereare4subfamilies,58tribes,1500genera,about8500validspeciesofworld,and4subfamilies,42tribes,285genera,1253specie