資源描述：
《捷蜥蜴線粒體基因組及有鱗目系統(tǒng)發(fā)育研究》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、捷蜥蜴線粒體基因組及有鱗目系統(tǒng)發(fā)育研究專業(yè)名稱：生物化學(xué)與分子生物學(xué)申請(qǐng)人：陶春榮指導(dǎo)教師：秦新民教授論文答辯委員會(huì)拂遺遮委員：雨荻-1飄殤。j—I、吣／VC／^、、盞魚聾刻聾壅前男’IIIIIIIIIII)HI)1)))b1))lHlll))lI捷蜥蜴線粒體基因組及有鱗目系統(tǒng)發(fā)育研究Y2585078研究生：陶春榮年級(jí)：2011級(jí)導(dǎo)師：秦新民教授學(xué)科專業(yè)：生物化學(xué)與分子生物學(xué)研究方向：分子系統(tǒng)學(xué)摘要捷蜥蜴(Lacertaagilis)隸屬于爬行綱(Reptilia)、有鱗目(Squamata)、蜥蜴科(Lacertidae)動(dòng)物，廣泛分布在歐、亞、非洲，國內(nèi)主要分
2、布于新疆。該物種已經(jīng)被收錄到《國家保護(hù)的有益的或者有重要經(jīng)濟(jì)、科學(xué)研究價(jià)值的陸生野生動(dòng)物名錄》。本文利用PCR和長片段PCR方法對(duì)捷蜥蜴線粒體基因組全序列及其核基因c．mos序列進(jìn)行了擴(kuò)增和測序。從GenBank中下載39個(gè)有鱗目物種的線粒體16SrRNA和核基因c．mos序列，以奧利諾科鱷(Crocodylusintermedius)和非洲侏儒鱷(偽據(jù)D腸em螂tetraspis)為外群，以16SrRNA基因序列及16SrRNA+c-mos基因聯(lián)合序列為分子標(biāo)記，并且運(yùn)用軟件MrBayes3．0b4和PAUP4．0分別使用貝葉斯推斷法和最大似然法構(gòu)建了有鱗目的B
3、I(BayesianInference，BI)和ML(MaximumLikelihood，ML)系統(tǒng)發(fā)育樹。所得主要內(nèi)容和結(jié)論如下：1．捷蜥蜴線粒體基因組全長17，090bp，包括13個(gè)編碼蛋白基因(ATP6，ATP8，COI—III，NDl．6，ND4L，Cytb)、22個(gè)tRNA基因、2個(gè)核糖體rRNA基因(16SrRNA和12SrRNA基因)以及1個(gè)主要的非編碼控制區(qū)(D．Loop控制區(qū))。另外，其輕鏈復(fù)制起始點(diǎn)fOL)可形成莖環(huán)(stem．100p)結(jié)構(gòu)。每個(gè)基因都沒有出現(xiàn)基因重排的現(xiàn)象，而且它們?cè)谖恢蒙?、順序上和方向上都與大多數(shù)報(bào)道過的有鱗目的多數(shù)物種相
4、同。捷蜥蜴線粒體基因組堿基組成具有明顯的A+T偏向性，總A+T含量所占百分比為60．3％，明顯比G+C含量高。另外，捷蜥蜴線粒體基因組堿基表現(xiàn)出負(fù)GC偏斜值(。0．330)及正AT偏斜值(0．038)。2。捷蜥蜴線粒體基因組13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因中，NDl以ATT為起始密碼子，COI、COII、ND63個(gè)基因以GTG為起始密碼子，其余都以ATG為起始密碼子。NDl、ATP8、ND4L、ND5、ND6、C燦6個(gè)基因以完全的吖蚺行使終止密碼子功能，COI和ND2則分別以AGG和TAG為終止密碼子，ATP6以不完全的TA作為終止密碼子，COII、COrn、ND3、ND44
5、個(gè)基因的終止密碼子為不完全T。3．捷蜥蜴線粒體基因組的22個(gè)tRNA基因中，除tRNAs叮(AGY)缺失T臂，其余21個(gè)tRNA基因的二級(jí)結(jié)構(gòu)均呈典型的三葉草結(jié)構(gòu)。4．捷蜥蜴的非編碼D．100p區(qū)域位于tRNA．Pro基因和tRNA．Phe基因之間，長度是1,688bv，A+T含量為65．9％，高于捷蜥蜴線粒體基因組全序列A+T含量的平均水平。在捷蜥蜴的非編碼區(qū)存在一些特殊序列：5’端有3個(gè)終止相關(guān)序列：TASl：5t．ACATn汀CCⅡ訂T．3’，TAS2：5’．ACATAATACATA．3’，TAS3：5’．ACATAAlTACAl隊(duì)．3’，3’端也有3個(gè)的保
6、守序列：CSB．1：5’．ATTGTCTTAATGCTTGGTAGAC觸漁．3’，CSB．2：：5’．CAAACCCCCCTACCCCC-3’，CSB-3：5’-TCGCCAACCCCTAAACGA．3’。5．基于39個(gè)物種(不包括外群)16SrRNA基因和16SrRNA+c．mos基因兩個(gè)數(shù)據(jù)集分別構(gòu)建了有鱗目的BI和ML系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果表明：得到的4棵系統(tǒng)發(fā)育樹拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)基本一致，6個(gè)亞目都表現(xiàn)出良好的單系性，鬣蜥亞目與蛇蜥亞目形成姐妹支后，與壁虎亞目聚為一支：然后與蛇亞目相聚；接著再與蚓蜥亞目和蜥蜴亞目相聚。6個(gè)亞目的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系為：(((((鬣蜥亞目+蛇蜥亞
7、目)+壁虎亞目)+蛇亞目)+蚓蜥亞目)+蜥蜴亞目)。除了短頭蚓蜥科外，其余各科在4棵系統(tǒng)發(fā)育樹中均表現(xiàn)為單系性，與形態(tài)分類結(jié)果相符。關(guān)鍵詞：捷蜥蜴；有鱗目；線粒體基因組；核基因；分子系統(tǒng)學(xué)IITheCompleteMitogenomeofLacertaagilisandthePhylogeneticAnalysisofSquamataMasterCandidate：TaoChun-RongMajor：BiochemistryandMolecularBiologyGrade：201Supervisor：Qinxin-MinResearchdirection：Mole
8、cular
