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《大豆DNA甲基化酶生物信息學(xué)分析》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、中國油料作物學(xué)報(bào)２０１３，３５（２）：２２５－２３０ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌｏｆＯｉｌＣｒｏｐＳｃｉｅｎｃｅｓｄｏｉ：１０．７５０５／ｊ．ｉｓｓｎ．１００７－９０８４．２０１３．０２．０２０大豆ＤＮＡ甲基化酶生物信息學(xué)分析１１２３１方淑梅，梁喜龍，紀(jì)偉波，胡百興，鄭殿峰（１．黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)，黑龍江大慶，１６３３１９；２．黑龍江省牡丹江管理局，黑龍江密山，１５８３０８；３．黑龍江?。福担保稗r(nóng)場(chǎng)，黑龍江雞西，１５８２００）摘要：植物ＤＮＡ甲基化酶對(duì)建立與維持基因組甲基化，調(diào)控基因表達(dá)，確保植物快速應(yīng)對(duì)多種逆境具有重要作用。本研究利用多種生物信息學(xué)網(wǎng)
2、站和軟件初步明確了大豆中四類ＤＮＡ甲基化酶蛋白及相應(yīng)基因序列，并分析了進(jìn)化關(guān)系和基因拷貝數(shù)，確定了基因在染色體上的物理位置及酶蛋白的理化性質(zhì)與亞細(xì)胞定位，同時(shí)揭示了大豆ＤＮＡ甲基化酶蛋白的結(jié)構(gòu)域和組織表達(dá)部位特異性。這些研究結(jié)果有助于全面認(rèn)知大豆ＤＮＡ甲基化酶蛋白的特征對(duì)從遺傳學(xué)上展開深入研究和剖析具有重要的理論指導(dǎo)作用。關(guān)鍵詞：大豆；基因組；ＤＮＡ甲基化酶；進(jìn)化關(guān)系中圖分類號(hào)：Ｓ５２，Ｓ５６５．１０３文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：Ａ文章編號(hào)：１００７－９０８４（２０１３）０２－０２２５－０６ＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓｏｆＤＮＡｍｅｔｈｙｌａｓｅｆｒｏｍ
3、ｓｏｙｂｅａｎ１１２３１ＦＡＮＧＳｈｕ－ｍｅｉ，ＬＩＡＮＧＸｉ－ｌｏｎｇ，ＪＩＷｅｉ－ｂｏ，ＨＵＢａｉ－ｘｉｎｇ，ＺＨＥＮＧＤｉａｎ－ｆｅｎｇ（１．ＨｅｉｌｏｎｇｊｉａｎｇＢａｙｉＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｄａｑｉｎｇ１６３３１９，Ｃｈｉｎａ；２．ＭｕｄａｎｊｉａｎｇＡｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎＢｕｒｅａｕｏｆＨｅｉｌｏｎｇｊｉａｎｇ，Ｍｉｓｈａｎ１５８３０８，Ｃｈｉｎａ；３．８５１０ＦａｒｍｏｆＨｅｉｌｏｎｇｊｉａｎｇ，Ｊｉｘｉ１５８２００，Ｃｈｉｎａ）Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＤＮＡｍｅｔｈｙｌａｓｅｉｎｐｌａｎｔｓｐｌａｙｓａｎｉｍｐ
4、ｏｒｔａｎｔｒｏｌｅｏｎｍａｉｎｔａｉｎｉｎｇｇｅｎｏｍｅＤＮＡｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎ，ｒｅｇｕｌａｔｉｎｇｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎａｎｄｐｒｏｍｐｔｒｅｓｐｏｎｓｅｔｏｖａｒｉｅｄａｄｖｅｒｓｅｃｉｒｃｕｍｓｔａｎｃｅｓ．Ｍａｎｙｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｗｅｂｓｉｔｅｓａｎｄｓｏｆｔｗａｒｅｓｗｅｒｅｅｍｐｌｏｙｅｄｉｎｔｈｉｓｐａｐｅｒ．ＦｏｕｒｋｉｎｄｓｏｆＤＮＡｍｅｔｈｙｌａｓｅｓａｎｄｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇｇｅｎｅｏｒｄｅｒｓｗｅｒｅｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄｐｒｅｌｉｍｉｎａｒｉｌｙｉｎｓｏｙｂｅａｎ．Ｔｈｅｉｒｅｖｏｌｕｔｉｏｎａ
5、ｒｙｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓａｎｄｇｅｎｅｃｏｐｙｎｕｍｂｅｒｓｗｅｒｅａｎａｌｙｚｅｄ．ＴｈｅｌｏｃａｔｉｏｎｓｏｆａｌｌｇｅｎｅｓｏｎｔｈｅｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｓａｎｄｔｈｅｐｈｙｓｉｏｃｈｅｍｉｃａｌｐｒｏｐｅｒｔｙａｎｄｓｕｂｃｅｌｌｕｌａｒｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎｏｆＤＮＡｍｅｔｈｙｌａｓｅｓｗｅｒｅｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ．Ｔｈｅｄｏｍａｉｎｓｏｆｔｈｅｓｅｐｒｏｔｅｉｎｓａｎｄｔｉｓｓｕｅ－ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｗｅｒｅｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ．Ｔｈｅｓｅｒｅｓｕｌｔｓｐｒｏｖｉｅｄａｇｕｉｄｌｉｎｅｉｎｆｕｒｔｈｅｒｕｎｄｅ
6、ｒｓｔａｎｄｉｎｇｔｈｅｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓｏｆｓｏｙｂｅａｎＤＮＡｍｅｔｈｙｌａｓｅｓａｎｄｔｈｅｉｒｇｅｎｅｔｉｃｓ．Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：Ｓｏｙｂｅａｎ；Ｇｅｎｏｍｅ；ＤＮＡｍｅｔｈｙｌａｓｅ；Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ近年來，在全國大豆主產(chǎn)區(qū)和重要商品大豆產(chǎn)逆能力在一定程度上受控于基因組中相關(guān)基因的甲［６～８］地黑龍江省，大豆生產(chǎn)正經(jīng)歷著干旱、低溫和連作綜基化狀態(tài)。然而基因組中相關(guān)基因的甲基化狀合逆境的挑戰(zhàn)，大豆產(chǎn)量與品質(zhì)均受到嚴(yán)重影態(tài)與水平是由植物ＤＮＡ甲基化酶和脫甲基化酶及［１，２］響。這在一定程度上制約著農(nóng)業(yè)生產(chǎn)
7、者種植大這兩類酶的相對(duì)活性決定的。ＤＮＡ脫甲基化酶可豆的積極性，所以深入研究大豆的抗逆機(jī)制，并在此識(shí)別甲基化胞嘧啶，將甲基化胞嘧啶堿基從ＤＮＡ骨基礎(chǔ)上提出有效對(duì)策便成為眾多學(xué)者關(guān)注的焦點(diǎn)。架上移除，完成脫甲基化過程，從而促進(jìn)基因表達(dá)，最新研究表明，植物基因組ＤＮＡ的表達(dá)調(diào)控對(duì)而ＤＮＡ甲基化酶則可將Ｓ－腺苷甲硫氨酸上的甲其快速機(jī)智應(yīng)對(duì)多種逆境，獲取可塑性表型具有重基轉(zhuǎn)移到ＤＮＡ分子中的特定堿基上，進(jìn)行從頭甲基［３，４］要作用。同時(shí)基因組表達(dá)調(diào)控的分子開關(guān)通常化或維持性甲基化來抑制基因表達(dá)。當(dāng)前研究顯［５］與ＤＮＡ甲基化動(dòng)態(tài)修飾密切相關(guān)。所以植物抗示，擬南芥
8、中的ＤＮＡ甲基化酶主要分為四類：收稿日期：２０１２０５０９基金項(xiàng)目：黑龍江省
