我國部分黃牛品種線粒體D-loop區(qū)遺傳多樣性與起源分化

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1、篷HEREDITAS(Beijing)2009年2月,31(2):160—168ISSN0253-9772WWW.chinagene.ca研究報告DoI:10.3724,sP.J.1005.2009.00160我國部分黃牛品種線粒體D-loop區(qū)遺傳多樣性與起源分化張桂香,鄭友民,王志剛,韓旭,賈善剛,陳宏1.全國畜牧總站,北京100125;2.西北農林科技大學動物科技學院,楊凌712100摘要:為了解我國地方黃牛品種線粒體DNA的遺傳變異情況,文章測定了16個地方黃牛品種206個個體線粒體D—loop區(qū)的全序列,共檢測到10

2、1個變異位點;99種單倍型,其中73種是普通牛單倍型,26種是瘤牛單倍型;平均核苷酸差異為22.6920,單倍型多樣度為0.9320,核苷酸多樣度為0.0227,表明我國黃牛品種遺傳多樣性非常豐富。構建的NJ進化樹顯示16個品種來源于兩大母系:普通牛和瘤牛;構建的Network圖表明73種普通牛單倍型可以分為3大單倍型群;26種瘤牛單倍型分為5種單倍型群,推測我國瘤牛在遷移過程中,至少經歷了4次群體擴張事件通過分析比較地方黃牛品種與內羅門牛共有的H3單倍型,發(fā)現其中只有16%的序列與內羅門牛的H3單倍型非常相似,其余84%的序

3、列均發(fā)生了烏嘌呤變異,推測這些變異很可能是我國瘤牛固有的變異。關鍵詞:黃牛;D—loop區(qū);遺傳多樣性;起源;分化GeneticdOiversityandorilginofmitochondariaDNAD-hlOOpregRi1oOnofsomeChineseindigenouscattlebreedsZHANGGui—Xiang,ZHENGYou—Min,WANGZhi—Gang,HANXu,JIAShan—Gang,CHENHong1.NationalAnimalHusbandryService,BeOing100125

4、,China;2.CollegeofAnimalScienceandTechnology,NorthwestA&FUniversity.Yangling712100.ChinaAbstract:111ecompleteD—loopregionofmitochondrialDNAfrom206individualsin16ChineseindigenouscattlebreedswassequencedandanalyzedtodetectvariabilityofD—loopregionofmitochondriaDNAfor

5、thosebreeds.There—suitsshowedasfollows:101variationsand99haplotypeswerefound,inwhich73haplotypeswereofBostaurusandtheother26haplotypeswereofBosindicus,andtheaveragenumberofnucleotidedifferenceswas22.6920,haplotypediversitywas0.9320,andnucleotidediversitywas0.0227,in

6、dicatinghighgeneticdiversityinChineseindigenouscattlebreeds.Ac-cordingtotheNJphylogenetictree.16cattlebreedsweredividedintotwoclades.BOStaurusandBosindicus.BasedontheNetworkgraphics,the73haplotypesofBostauruswereclassifiedinto3groupsandthe26haplotypesofBosindicuswer

7、eclassifiedinto5groups.ItwasinferredthatcattlebreedsofBosndicusinChinahadexperiencedatleast4populationex—pansionsduringtheirmovement.Therewasonly16%ofH3haplotypesequnencessimilartothesequenceofNellore,and84%ofthosesequnenceshadpurineCvariationinChineseindigenouscatt

8、lebreedsthroughtheanalysisontheircommon收稿日期:2008—05—05;修回13期:2008—07—13基金項目:農業(yè)部中國地方牛品種遺傳距離測定項目(編號:農財發(fā)12002]9號)資助作者簡介:張桂香(1972一),女,博士,研究方向:

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