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《基于線粒體基因組D-loop區(qū)全序列分析安義瓦灰雞遺傳多樣性及其起源進(jìn)化關(guān)系-論文.pdf》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫(kù)。
1、，參麓_onlines意■嫩■揀燎一麓ystem：http：Hww若w．iabiotechorggy黥嘗囂漿醞l==基于線粒體基因組D．1oop區(qū)全序列分析安義瓦灰雞遺傳多樣性及其起源進(jìn)化關(guān)系高玉時(shí)賈曉旭唐修君唐夢(mèng)君樊艷風(fēng)陸俊賢顧榮葛慶聯(lián)蘇一軍江蘇省家禽科學(xué)研究所揚(yáng)州I225125通訊作者，gaoysl00@sina．COIll摘要本研究旨在探究江西安義瓦灰雞(Gallusgallusdomestiaus)的遺傳多樣性和起源。對(duì)30只安義瓦灰雞線粒體基因組(mitochondrialgenome，mtDNA)D．1oop區(qū)全序列的進(jìn)行PC
2、R擴(kuò)增和測(cè)序(GenBank登錄號(hào)：KP893677～KP893682)，并結(jié)合GenBank中紅色原雞的D1oop區(qū)序列，分析安義瓦灰雞線粒體多態(tài)性及其起源。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，安義瓦灰雞mtDNAD．1oop區(qū)全長(zhǎng)1231～1232bp，核苷酸多樣性)為(O．00613+0．00014)，單倍型多樣性(rid)為(0．837~0．027)。在30只個(gè)體中，共發(fā)現(xiàn)18處單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)，6種單倍型。系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn)，6種單倍型可以分為A、B、C3個(gè)分支，其中C為主要分支，有3種單倍型，A分支有1種倍型，B分支有2種倍型。A和B分支與紅色原雞滇南亞
3、種(Gallusgallusspadiceus)聚為一類(lèi)，C分支與4個(gè)原雞亞種聚為一類(lèi)。研究結(jié)果表明，安義瓦灰雞mtDNAD—loop區(qū)有豐富的多態(tài)性，并且有多個(gè)母系起源，從分子水平上為安義瓦灰雞的遺傳資源保護(hù)和開(kāi)發(fā)利用提供了參考。關(guān)鍵詞安義瓦灰雞，線粒體DNA，D—loop區(qū)，系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，起源TheGeneticDiversityandOriginAnalysisofAnyiTile-likeChickens(Callusgallusdomestiaus)BasedonMitochondrialDNAD—loopSequenceGAO
4、Yu—ShiJIAXiao—XuTANGXiu—JunTANGMeng—JunFANYan—FengLUJun-XianGURongGEQing—LianSUYi—JunJiangsuInstituteofPoultryScience，Yangzhou225125，ChinaCorrespondingauthor．gaoys100@sina．comAbstractThisstudysoughttoassessmitochondrialDNA(mtDNA)diversityandoriginofJiangxiAnyiTile—likeChi
5、ckens(Gallusgallusdomestiaus)．Bloodsampleswerecollectedfrom30chickens．ThecompletesequenceofthemtDNAD-loopwasPCRamplifiedandsubsequentlysequenced(GenbankaccessionNo．KP893677-KP893682．)．DNAsequenceofmtDNAD—loopoffiveredjunglefowlsubspecieswerecollectedfromtheGenBankanduseda
6、sreferencesequences．Theresultsshowedthat，theD-loopregionofAnyiTile—likeChickenswas1231-1232bpinlength．Thenucleotidediversitywas(0．006134-0．00014)，andthehaplotypediversitywasf0．837~0．027)．The6haplotypeswereobservedbasedon18mutantsiteandclusteredintothreeclades(A，B，andC)，of
7、whichcladeCwasdominant．ThreehaplotypesbelongtocladeC，twohaplotypesareincladeB．oneisincladeA．ThecladeAandcladeBwereclusteredwithGallusgallusspadiceus，cladeCwasclusteredwithfoursubspeciesofredjunglefow1．TheseresultsshowahighmitochondrialD．1oopdiversityandindicatemultiplemat
8、ernaloriginsforAnyiTile-likeChickens．Theresults基金項(xiàng)目：國(guó)家自然科學(xué)基金(No．31372277)收稿日期：2014．12．30接受日期：201
