擬南芥激活標(biāo)簽突變體庫(kù)的構(gòu)建及突變體表型的分析

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1、農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào)JournalofAgriculturalBiotechnology2008,16(2):292~298·研究論文·擬南芥激活標(biāo)簽突變體庫(kù)的構(gòu)建及突變體表型的分析*1,2**,范喜英211曹冬梅,王云山,康黎芳(1.山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院園藝研究所,太原030031;2.中國(guó)科學(xué)院植物研究所,北京100093)摘要:激活標(biāo)簽技術(shù)(activationtagging)在植物功能基因組學(xué)的研究中具有重要的作用。實(shí)驗(yàn)以擬南芥()為材料,用根癌農(nóng)桿菌()介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化方法,構(gòu)建了一個(gè)含有50000個(gè)獨(dú)立抗Bas

2、ta株系的激活標(biāo)簽突變體庫(kù)。其中有47個(gè)株系有明顯的表型改變,包括花期的改變、株型矮小、葉片形狀改變、葉柄變長(zhǎng)、葉表皮毛消失、育性降低以及恢復(fù)了莖葉處的打折等。并通過(guò)TAILPCR和NestedPCR的方法得到了若干TDNA側(cè)翼序列。結(jié)果顯示突變體含有1~3個(gè)拷貝的TDNA插入,分別插入到擬南芥的1、4和5號(hào)染色體中。關(guān)鍵詞:激活標(biāo)簽技術(shù);擬南芥;表型;TDNA側(cè)翼序列中圖分類號(hào):S188文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A?文章編號(hào):10061304(2008)02029207ConstructionofanActivation

3、TaggingLibraryof?andMutantPhenotypeAnalysis?CAODongmei?1,2**,FANXiying?2,WANGYunshan?1,KANGLifang?1Activationtaggingplaysanimportantroleinplantgenomicsstudy.Inthispaper,anactivationtagginglibrarycontainingindependent50000Bastaresistantlineswasconstructedbym

4、ediatedtransformationwhichusedmutantasmaterials.Amongthesetransformants,47linesshowedobviousphenotypeswhichweredifferent?from?,containinglatefloweringtime,dwarf,changedleafshape,longerleafpetiole,trichomelessleaf,sterilityandnokinkbetweenstem/leaf.SomeTDNAf

5、lankingsequenceswereobtainedbyTailPCRandNestedPCR.ResultsshowedthatthemutantscontainedonetothreeTDNAinsertions,andtheinsertionsdistributedinthefirst,fourthandfifthchromosomeofgenome.?activationtagging??phenotype?TDNAflankingsequence擬南芥()為十字花科容。而突變體已被廣泛的應(yīng)用到正

6、向遺傳學(xué)研究中,(Crucifereae)擬南芥屬一年生草本植物。因其具有基通過(guò)對(duì)突變體的分析可以了解大量未知序列的功因組小、重復(fù)序列少、生長(zhǎng)周期短、易于遺傳轉(zhuǎn)化、生能,目前人們已經(jīng)利用TDNA的插入在擬南芥中物信息學(xué)資源豐富等其它植物無(wú)可比擬的優(yōu)點(diǎn),從建立了大量的突變體群體,早期的TDNA標(biāo)簽是而被科學(xué)家當(dāng)作模式植物,廣泛應(yīng)用于植物生物學(xué)以基因敲除為目的,產(chǎn)生隱性突變,然而對(duì)于具有冗的各個(gè)研究領(lǐng)域。更重要的是,擬南芥基因組的全序余功能的基因家族卻無(wú)能為力,因而產(chǎn)生了激活標(biāo)列物理圖譜已于2000年12月公布(

7、The簽(activationtgging)技術(shù),它能使所插入的標(biāo)簽附GenomeInitiative,2000),是第一個(gè)基因組被全部測(cè)近的基因過(guò)量表達(dá)而產(chǎn)生顯性突變(Hayashi,?序的植物,這一里程碑式的工作必將對(duì)植物生物學(xué)1992),顯性突變的表型可以在T?1代直接觀察到,然的發(fā)展產(chǎn)生重大而深遠(yuǎn)的意義。而對(duì)于顯性致死的突變體則很難保留后代。目前利功能基因組學(xué)是后基因組時(shí)代的重要研究?jī)?nèi)用激活標(biāo)簽系統(tǒng)已成功地分離到許多表型明顯的突*基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.30470169)資助。**通訊作

8、者。Authorforcorrespondence.副研究員,博士,主要從事植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)方面的研究。Email:.收稿日期:20070626接受日期:20071012第2期曹冬梅等:擬南芥激活標(biāo)簽突變體庫(kù)的構(gòu)建及突變體表型的分析293變體,Weigel?(.2000)通過(guò)對(duì)25000個(gè)株系的篩1.2方法選確定了23個(gè)有明顯表型的突變體,其中2個(gè)是在1.2.1

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