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《PCR實驗室設計》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關內容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、1PCR實驗室平面布局PCR擴增檢驗實驗室原則上分為四個單獨的工作區(qū)域:試劑貯存和準備區(qū)、標本制備區(qū)、擴增反應混合物配制和擴增區(qū)、擴增產物分析區(qū)。為避免交叉污染,進入各個工作區(qū)域必須嚴格遵循單一方向進行,即只能從試劑貯存和準備區(qū)→標本制備區(qū)→擴增反應混合物配制和擴增區(qū)→擴增產物分析區(qū)。各實驗區(qū)之間的試劑及樣品傳遞應通過傳遞窗進行。PCR實驗室平面布置示意圖如圖1所示圖1擴增產物分析區(qū)試劑貯存和準備區(qū)標本制備區(qū)擴增反應混合物配制和擴增區(qū)緩沖區(qū)傳遞窗2實驗室空調通風系統(tǒng)設計及壓力控制PCR實驗室并沒有嚴格的凈化要求,但是為避免各個實驗區(qū)域間交叉污染的可能性,宜采用全送全排的氣流組織形式。同時,
2、要嚴格控制送、排風的比例以保證各實驗區(qū)的壓力要求。2.1試劑貯存和準備區(qū)該實驗區(qū)主要進行的操作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應混合液的制備。試劑和用于樣品制作的材料應直接運送至該區(qū),不得經過其他區(qū)域。試劑原材料必須貯存在本區(qū)內,并在本區(qū)內制備成所需的貯存試劑。對與氣流壓力的控制,本區(qū)并沒有嚴格的要求。2.2標本制備區(qū)該區(qū)域主要進行的操作為樣本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應管和測定DNA的合成。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為正壓,以避免從鄰近區(qū)進入本區(qū)的氣溶膠污染。另外,由于在加樣操作中可能會發(fā)生氣溶膠所致的污染,所以應避免在本區(qū)內不必要的走動。2.3
3、擴增反應混合物配制和擴增區(qū)該區(qū)域主要進行的操作為DNA擴增。此外,已制備的DNA模板(來自樣本制備區(qū))的加入和主反應混合液(來自試劑貯存和制備區(qū))制備成反應混合液等也可在本區(qū)內進行。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為負壓,以避免氣溶膠從本區(qū)漏出。為避免氣溶膠所致的污染,應盡量減少在本區(qū)內的不必要的走動。個別操作如加樣等應在超凈臺內進行。2.4擴增產物分析區(qū)該區(qū)域主要進行的操作為擴增片段的測定。本區(qū)是最主要的擴增產物污染來源,因此對本區(qū)的壓力梯度的要求為:相對于鄰近區(qū)域為負壓,以避免擴增產物從本區(qū)擴散至其它區(qū)域。3污染的預防與控制PCR實驗室設計的核心問題是如何避免污染。在實際工作中,常
4、見的有以下幾種污染類型:擴增產物的污染;天然基因組DNA的污染;試劑的污染以及標本間的污染。由于一旦發(fā)生污染,實驗就必須停止,直到找到污染源為止,而且實驗結果必須作廢,需重新進行實驗。所以發(fā)生污染后再圍繞實驗室來尋找污染源不但耗時而且繁瑣,浪費人力物力。因此要避免污染,首先應是預防,而不是排除。3.1工作區(qū)域的嚴格劃分(1)各個實驗區(qū)域設置合理;(2)各個實驗區(qū)域要有明顯的標記(如醒目的門牌或不同的地面顏色等),以避免各個不同實驗區(qū)域設備物品、試劑等發(fā)生混淆。3.2合理的系統(tǒng)設置(1)合理的空調通風系統(tǒng)設置,盡量采用全送全排的空調系統(tǒng);(2)嚴格的氣流壓力控制,保證不同的實驗區(qū)內不同的壓力
5、要求。3.3規(guī)范的操作(1)擴增檢驗實驗室的技術人員必須進行上崗培訓,經培訓合格后才能從事臨床基因擴增檢驗的工作;(2)在實驗操作過程中,操作者必須戴手套,并經常更換。此外,操作中使用一次性帽子也是一個有效地防止污染的措施;(3)清潔工作及時、正確。實驗工作結束后,必須立即對本區(qū)進行清潔。除常規(guī)的消毒液體對表面進行擦拭消毒或紫外線燈的照射消毒外,對一些實驗設備還應進行高壓消毒處理。3.4嚴格的管理(1)嚴格控制進出實驗室的人員。與實驗無關的人員不得隨意進出實驗室,有條件的情況下要設置獨立的通道和進出整個實驗區(qū)的門;(2)盡量減少在實驗區(qū)內不必要的走動以減少交叉污染的可能性。(3)擴增產物分
6、析區(qū)是最主要的擴增產物污染來源,廢液不能在實驗室中傾倒,必須經消毒液浸泡消毒后在遠離實驗室的地方棄掉,用過的吸頭等一次性材料也應經消毒液浸泡消毒后統(tǒng)一處理,如焚燒等;(4)擴增產物分析區(qū)可能會用到某些可致基因突變和有毒物質,應特別注意實驗人員的安全防護。3.5完備的實驗室配套設施完備的實驗室配套設施是保證實驗工作的必要條件,應根據(jù)各個實驗室實驗內容的不同配備相應的設備和儀器,如超凈工作臺、離心機、加樣器等。