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1、核酸的分離純化技術(shù)核酸(nucleicacid)是遺傳信息的攜帶者,是基因表達(dá)的物質(zhì)基礎(chǔ)。無(wú)論是進(jìn)行核酸結(jié)構(gòu)還是功能研究,首先需要對(duì)核酸進(jìn)行分離和純化。核酸樣品質(zhì)量將直接關(guān)系到實(shí)驗(yàn)的成敗。概述一、核酸分離、純化原則(一)保持核酸分子一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性1.意義:遺傳信息全部?jī)?chǔ)存在一級(jí)結(jié)構(gòu)之中,核酸的—級(jí)結(jié)構(gòu)還決定其高級(jí)結(jié)構(gòu)的形式以及和其他生物大分子結(jié)合的方式。2.實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,應(yīng)注意以下條件及要求:1)減少化學(xué)因素對(duì)核酸的降解:pH4-102)減少物理因素對(duì)核酸的機(jī)械剪切力:0-4?C強(qiáng)烈振蕩、攪拌,細(xì)胞突置于低滲液中,細(xì)胞裂解,反復(fù)凍貯等造成的機(jī)械剪切力等條件都能明顯破壞大分子量的
2、線性DNA分子,對(duì)于分子量小的環(huán)狀質(zhì)粒DNA及RNA分子,威脅相對(duì)小一些;另外如高溫加熱,除高溫本身對(duì)核酸分子中的化學(xué)鍵的破壞作用外,還可能因煮沸帶來(lái)液體剪切力,因此核酸提取常常在0~4℃的條件下進(jìn)行。(一)保持核酸分子一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性3)抑制DNase或RNase的活性:所用器械和一些試劑需高溫滅菌,提取緩沖液中需加核酸酶抑制劑。4)簡(jiǎn)化步驟,縮短時(shí)間,減少破壞。(一)保持核酸分子一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性3.DNA酶抑制劑(1)金屬離子螯合劑:DNA酶需要金屬二價(jià)離子Mg2+、Ca2+的激活,因此使用金屬二價(jià)離子螯合劑,可抑制DNA酶活性。如EDTA、檸檬酸鹽絡(luò)合Mg2+、Ca2+等
3、離子。(2)陰離于型表面活性劑:如SDS,該試劑除對(duì)核酸酶有抑制作用外,還能使蛋白質(zhì)變性,并與變性蛋白結(jié)合成帶負(fù)電荷的復(fù)合物,該復(fù)合物在高鹽溶液中沉淀。(一)保持核酸分子一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性4.RNA酶(RNAase)抑制劑RNAase分布廣泛,極易污染樣品,而且耐高溫、耐酸、耐堿,不易失活,所以生物降解是RNA提取過(guò)程中的主要危害因素。(1)皂土(bentonite)作用機(jī)制:皂土帶負(fù)電荷,能吸附RNase,使其失活。(一)保持核酸分子一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性(2)DEPC(二乙基焦碳酸鹽)(C2H5OCOOCOOC2H5)粘性液體,很強(qiáng)的核酸酶抑制劑。作用機(jī)制:與蛋白質(zhì)中His結(jié)合使蛋
4、白變性。使用注意:DEPC也能破壞單鏈核酸中大部分腺嘌呤環(huán)。但濃度比使蛋白質(zhì)變性的濃度大100~1000倍。容易降解,保存在4℃或液氮中;提RNA時(shí),0.1%DEPC浸泡器皿37℃2h。劇毒。(一)保持核酸分子一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性4.RNA酶(RNAase)抑制劑(3)肝素(4)復(fù)合硅酸鹽(Macaloid)(5)RNase阻抑蛋白(RNasin)(6)氧釩核糖核苷復(fù)合物(Vanadyl-RibonucleosideComplex,VRC)4.RNA酶(RNAase)抑制劑(一)保持核酸分子一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性一、核酸分離、純化原則(二)盡量排除其它分子的污染,保證核酸樣品的純度純化的
5、核酸樣品不應(yīng)存在對(duì)酶有抑制作用的有機(jī)溶劑或過(guò)高濃度的金屬離子,蛋白質(zhì)、脂類、多糖分子的污染應(yīng)降低到最低程度;無(wú)其它核酸分子的污染,如提DNA分子時(shí),應(yīng)去除RNA分子。破碎組織細(xì)胞提取純化I.材料與方法的選擇II.破碎細(xì)胞或包膜-核酸的釋放III.核酸分離、純化IV.核酸的濃縮、沉淀、洗滌,并去除雜質(zhì)V.核酸的鑒定與保存二、分離提取核酸的主要步驟臨床常見(jiàn)的標(biāo)本有血液、尿液、唾液、組織及體外培養(yǎng)的細(xì)胞等都可作為提取核酸的原料,具體實(shí)驗(yàn)材料的選擇應(yīng)根據(jù)實(shí)驗(yàn)的目的來(lái)確定。不同的研究目的對(duì)核酸的完整性、純度、產(chǎn)量及濃度有不同的要求。需考慮制備核酸所需的時(shí)間與成本:簡(jiǎn)便快速、安全、經(jīng)濟(jì);應(yīng)
6、選擇安全的試劑與制備方案:完整性、產(chǎn)量、純度和濃度符合實(shí)驗(yàn)要求。(一)材料與方法的選擇臨床常見(jiàn)的標(biāo)本有血液、尿液、唾液、組織及體外培養(yǎng)的細(xì)胞等都可作為提取核酸的原料,具體實(shí)驗(yàn)材料的選擇應(yīng)根據(jù)實(shí)驗(yàn)的目的來(lái)確定。不同的研究目的對(duì)核酸的完整性、純度、產(chǎn)量及濃度有不同的要求。需考慮制備核酸所需的時(shí)間與成本:簡(jiǎn)便快速、安全、經(jīng)濟(jì);應(yīng)選擇安全的試劑與制備方案:完整性、產(chǎn)量、純度和濃度符合實(shí)驗(yàn)要求。(一)材料與方法的選擇DNA和RNA均位于細(xì)胞內(nèi)(病毒除外),因此核酸分離與純化的第一步即是裂解細(xì)胞、釋放核酸。(二)細(xì)胞的破碎——核酸的釋放破碎細(xì)胞的方法有三種:①機(jī)械方法:超聲波處理法、研磨法
7、、勻漿法;②化學(xué)試劑法:用SDS處理細(xì)胞,SDS可溶解細(xì)胞膜、核膜,去除脂質(zhì)和蛋白質(zhì),并使組織蛋白與DNA分離;③酶解法:加入溶菌酶或蛋白酶,都可使細(xì)胞膜破裂,核酸釋放。蛋白酶還能降解與核酸結(jié)合的蛋白質(zhì),促進(jìn)核酸分離。(二)細(xì)胞的破碎——核酸的釋放注意:1.細(xì)胞破碎方法中機(jī)械剪切法不能用于基因組DNA的提??;2.非機(jī)械法常用化學(xué)試劑或酶細(xì)胞溶解法。(二)細(xì)胞的破碎——核酸的釋放細(xì)胞裂解物是含核酸分子的復(fù)雜混合物,核酸分子本身可能仍與蛋白質(zhì)結(jié)合在一起。核酸與蛋白質(zhì)的結(jié)合力主要是正負(fù)靜電吸力(核