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《黃鯽群體遺傳結(jié)構(gòu)分析【開(kāi)題報(bào)告】》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線(xiàn)閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫(kù)。
1、畢業(yè)設(shè)計(jì)開(kāi)題報(bào)告生物科學(xué)黃鯽群體遺傳結(jié)構(gòu)分析一、綜述本課題國(guó)內(nèi)外研究動(dòng)態(tài)，說(shuō)明選題的依據(jù)和意義黃鯽是溫、熱帶性魚(yú)類(lèi)，廣泛，分布于太平樣、印度洋的溫帶和熱帶近岸海域及河口處；我國(guó)沿岸都有分布，一年四季都有生產(chǎn)。黃鯽是當(dāng)?shù)販\海各種作業(yè)的主要捕撈對(duì)象，產(chǎn)量不小，資源豐富，有一定的生產(chǎn)經(jīng)濟(jì)價(jià)值。肉味鮮美，十分可口，很受群眾歡迎；若腌制成魚(yú)干用于油炸更有風(fēng)味。微衛(wèi)星(microsatellite)或稱(chēng)簡(jiǎn)單序列重復(fù)(simplesequencerepeats,SSR)是指由1～6個(gè)核苷酸組成的簡(jiǎn)單串聯(lián)重復(fù)DNA序列。微衛(wèi)星在真核生物的基因組中分布廣泛,具有豐富的多態(tài)性,
2、實(shí)驗(yàn)結(jié)果穩(wěn)定可靠。微衛(wèi)星標(biāo)記是基于這些優(yōu)點(diǎn)而發(fā)展起來(lái)的一種DNA分析手段,可以提供分辨率達(dá)1個(gè)堿基對(duì)差異的信息[1]。近年來(lái),微衛(wèi)星標(biāo)記廣泛應(yīng)用于遺傳多樣性分析、遺傳圖譜的構(gòu)建以及系統(tǒng)發(fā)育等方面的研究。由于具有等位基因數(shù)目多、多態(tài)性高、共顯性以及孟德?tīng)栠z傳方式等特點(diǎn)，它作為一種重要的分子標(biāo)記被廣泛應(yīng)用于分子標(biāo)記輔助育種和探討物種的遺傳結(jié)構(gòu)中，因此目前在水產(chǎn)動(dòng)物的分子標(biāo)記研究中首選的就是微衛(wèi)星標(biāo)記。劉云國(guó)等（2005；2006）利用10個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)分析了牙鲆3個(gè)選擇性養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性；王偉等（2004）利用10個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)分析了黃鯽自然和養(yǎng)殖群體的遺傳多樣
3、性。另外劉海金等（2008）利用16個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)分析了牙鲆5個(gè)養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性，探討了各群體的遺傳分化及親緣關(guān)系。本研究首次利用不同地理群體的黃鯽為研究材料，利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析了各個(gè)群體的遺傳多樣性水平，探討了群體間的遺傳分化水平和親緣關(guān)系，以期為后續(xù)的研究工作提供理論依據(jù)。二、研究的基本內(nèi)容，擬解決的主要問(wèn)題：研究的基本內(nèi)容：利用舟山、象山等地的黃鯽作為研究對(duì)象，利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析其遺傳結(jié)構(gòu)和多樣性，檢測(cè)不同群體黃鯽的遺傳多樣性水平。解決的主要問(wèn)題：1.微衛(wèi)星引物的選擇；2.PCR反應(yīng)體系的確定；3.甲酰胺變性劑的變性，冰浴冷卻，經(jīng)6%聚丙烯酰胺凝膠電
4、泳后，銀染顯色。4.甲酰胺變性劑的變性，冰浴冷卻，經(jīng)6%聚丙烯酰胺凝膠電泳后，銀染顯色。三、研究步驟、方法及措施：研究步驟：1.查閱相關(guān)資料,了解有關(guān)黃鯽的基本特征；2.仔細(xì)閱讀研究文獻(xiàn)資料并翻譯相關(guān)英文資料；3.不同地理群體龍頭魚(yú)樣品的采集4.將各群體黃鯽的鰭條剪取后保存于95%的乙醇中。5.黃鯽DNA的提取，引物的選擇，PCR擴(kuò)增6.PCR反應(yīng)結(jié)束后，加入等量的甲酰胺變性劑，95°C變性6min，迅速冰浴冷卻。7.變性產(chǎn)物經(jīng)6%聚丙烯酰胺凝膠電泳后，銀染顯色。8.數(shù)據(jù)整理和分析，撰寫(xiě)畢業(yè)論文；9.上交論文初稿；10.反復(fù)修改論文；11.論文定稿。方法、措
5、施：查閱文獻(xiàn)，參考已知文獻(xiàn)中關(guān)于對(duì)黃鯽不同群體的遺傳多樣性的研究。在老師指導(dǎo)下完成黃鯽樣本的采集；DNA提取參照劉云國(guó)等（2006）的方法進(jìn)行。PCR反應(yīng)結(jié)束后，加入等量的甲酰胺變性劑，95°C變性6min，迅速冰浴冷卻。變性產(chǎn)物經(jīng)6%聚丙烯酰胺凝膠電泳后，銀染顯色。進(jìn)行數(shù)據(jù)分析：對(duì)照PBR322分子量標(biāo)準(zhǔn)確定每個(gè)個(gè)體的基因型，利用POPGENE軟件計(jì)算不同地理群體的平均等位基因數(shù)（A）、平均有效等位基因數(shù)（Ne）、最高等位基因頻率（F）、低頻等位基因數(shù)（L）、基因型數(shù)（G）、觀(guān)測(cè)雜合度（Ho）、期望雜合度（He）。同時(shí)計(jì)算了各群體的遺傳相似指數(shù)（I）、遺傳
6、距離（D）、近交系數(shù)(Fis)、遺傳分化指數(shù)（Fst）和基因流（Nm）。并根據(jù)Botstein等(1980)的分類(lèi)方法計(jì)算位點(diǎn)多態(tài)信息含量（PIC），并進(jìn)行了Hardy-weinberg遺傳偏離指數(shù)（d）的計(jì)算。利用MEGA3.0軟件采用NJ法構(gòu)建不同地理群體的系統(tǒng)樹(shù)。四、參考文獻(xiàn)[1] Pang,Ritland,Carlson,etal.Japanesequailmicro2satellitelociamplifiedwithchickenspecificprimers[J].AnimalGenetics,1999,30:195～199.[2] 國(guó)偉,沈佐
7、銳.微衛(wèi)星DNA標(biāo)記技術(shù)及其在昆蟲(chóng)學(xué)上的應(yīng)用[J].生物技術(shù),2004,14(2):60.[3] 國(guó)偉,沈佐銳.微衛(wèi)星DNA的多態(tài)性及其應(yīng)用[J].生物技術(shù)通訊,2004,15(2):158.[4] 楊效文,張廣學(xué),陳曉峰.棉蚜微衛(wèi)星DNA的克隆及其多態(tài)性檢測(cè)[J].昆蟲(chóng)學(xué)報(bào),2001,44(4):586.[5] 安瑞生,等.微衛(wèi)星DNA在分子遺傳標(biāo)記研究中的應(yīng)用[J].昆蟲(chóng)知識(shí),2002,39(3):561.[6] TAUTZD.HypervariabilityofsimplesequenceasageneralsourceforpolymorphicDN
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