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《檉柳SSR標(biāo)記開發(fā)及群體遺傳結(jié)構(gòu)分析》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、摘要本文采用微衛(wèi)星(EST-SSR)分子標(biāo)記技術(shù)，研究了6個檉柳(Tamarixchinensis)群體的遺傳多樣性，揭示其群體遺傳結(jié)構(gòu)，并在遺傳多樣性研究的基礎(chǔ)上，探討檉柳種質(zhì)資源的保存方法．主要結(jié)果如下：‘從來源于檉柳科的22713條EST序列中，檢索出包含SSR的EST序列546條。其中含二核苷酸重復(fù)單元和三核苷酸重復(fù)單元的SSR—ESTs分別為(30．9％)和(31．6％)。共會成75條設(shè)計引物用于檉柳的擴增，結(jié)果40對引物得到清晰的擴增條帶，其中17對引物表現(xiàn)明顯的多態(tài)性．為檉柳的遺傳學(xué)研究提供一些高效的分子標(biāo)記。17對SS
2、R引物在6個群體中共擴增出的等位基因(彳)平均有7．1765個，有效等位基因數(shù)(Ne)平均為4．7267個，平均期望雜合度(He)為0．4713，Nei多樣性指數(shù)(由)為O．4560，Shannon多樣性指數(shù)(D平均為1．7760。6個群體遺傳多樣性高低順序為：山東昌邑群體>山東河口群體>山東利津群體>山東墾利群體>內(nèi)蒙達(dá)茂群體>遼寧盤錦群體。6個群體中，前5個群體遺傳多樣性差別不大，只有遼寧雙臺群體明顯較低，這可能是由于該群體為當(dāng)?shù)仄鹪吹娜斯ち钟嘘P(guān)。6個群體的變異主要存在于群體內(nèi)，僅有8．04％的變異(Fst----O．0804)存
3、在于群體問，而GST平均為0．0539，群體的遺傳分化水平在林木中屬中等水平．研究發(fā)現(xiàn)了一些特異的等位基因僅在某一個群體中出現(xiàn)，在某種程度反映了群體間的分化；其中引物Estssr-15等位基因豐富，一對引物就能分別將內(nèi)蒙達(dá)茂群體和遼寧雙臺群體與起源山東的群體區(qū)分開來．群體平均觀察雜合度(肪)為0．5364，明顯高于期望雜合度(／／e=0．4835)，表明群體中雜合子過量，經(jīng)檢驗顯著顯著偏離Hardy—weinberg平衡，這可能與采樣時選擇表型優(yōu)良的單株有一定關(guān)系．針對遺傳變異主要存在于群體內(nèi)，群體間差異與地理距離呈正相關(guān)的特點，在進
4、行遺傳多樣性保護時，應(yīng)充分重視對于大群體內(nèi)不同類型個體的保存，重點要放在自然分布中心地區(qū)的群體．同時隨著地理距離的增大，應(yīng)在不同區(qū)域收集資源進行異地保存．在利用方面，一方面充分利用種內(nèi)變異，同時應(yīng)通過種間雜交等方式創(chuàng)造變異加以利用。關(guān)鍵詞：檉柳天然群體遺傳結(jié)構(gòu)EST-SSR引物開發(fā)StudyondevelopofEST-SSRprimerandG}eneticstructureofTamarixchinensisAbstractInthispapergeneticdiversityandpopulationgeneticstructu
5、reof6naturalpopulationsofTamarixchinensis，werestudiedbymeansofsimplesequencerepeatsDNA(EST-SSRlmarkers．Basedontheresearchofpopulationgeneticstructurestrategies，theconservationofthesegermplasmresourcesofT．chinensiswerealsodiscussed．Themainresultsarehighlightedinthefollow
6、ing：546simplesequencerepeats(SSRs)from22713Zchinensisexpressedsequencetags(ESTs)wereidentifiedandcharacterized．Dinueleotiderepeatsandtrinucleotiderepeatsaccountedfor30．9％and31．6％ofthetotalEST．SS黜．respectively．75ofthesepotentialEST-SSRswereselectedforprimerdesign．Ofthese
7、75primerpairs，40weremonomorphic17wereCO-dominantandpolymorphiconaverage，(A)were7．1765，(Ne)were4．7267，(He)waso．4713，(h)waso．4560，(I)was1．7760．Accordingtothegeneticdiversityoffilialgenerationstands。therankingamongthemwastheCYpopulation>theHKpopulation>theLJpopulation>theK
8、Lpopulation>theDMpopulation>theSTpopulation．ThedifferenceofGeneticdiversityaresmallamongthefirstfivepopulation
