機(jī)群管理系統(tǒng)安裝簡述

機(jī)群管理系統(tǒng)安裝簡述

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資源描述:

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1、1機(jī)群結(jié)構(gòu)介紹2.機(jī)群全局用戶機(jī)群的全局用戶管理采用NIS用戶的宿主目錄放在/export/home/username在該目錄下放有用戶的各種配置文件:.bashrc.bash_profile存放用戶的私有數(shù)據(jù)管理員創(chuàng)建新的賬號使用LCMS機(jī)群管理系統(tǒng)在console節(jié)點(diǎn)命令行方式:useradd-d/export/home/usernameusernamepasswdusernamecd/var/yp;make;cp/root/.rhosts/export/home/username在普通計算結(jié)點(diǎn)上yppasswd更改普通的密碼,或通過LCMS修改2.機(jī)群全局用戶用戶環(huán)境變量的設(shè)

2、置用戶私有的環(huán)境變量:用戶主目錄下/export/home/username/.bashrc和.bash_profile文件全局的所有用戶相同的環(huán)境變量:每個節(jié)點(diǎn)/etc/bashrc文件3.登錄到機(jī)群在windows系統(tǒng)下登錄機(jī)群sshconsoleip登錄到節(jié)點(diǎn)console后,可以執(zhí)行命令rshc0101登錄到其它任何節(jié)點(diǎn)。節(jié)點(diǎn)的名稱和IP參考/etc/hosts文件yppasswd修改自己的密碼4.如何運(yùn)行mpi程序mpi并行環(huán)境/export/mpi/mpich:GNU編譯的MPICH-1.2.5需要設(shè)置mpi并行環(huán)境的路徑,例如使用mpichexportPATH=/ex

3、port/mpi/mpich/bin:$PATH4.如何運(yùn)行mpi程序MPICH并行環(huán)境的使用mpicc–ocpicpi.c編輯列表文件hostlistc0101c0102c0103c0104rsh到列表中的最后一個節(jié)點(diǎn)mpirun-machinefilehostlist–np8cpi5.如何使用LJRS作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)使用LJRS系統(tǒng)在管理節(jié)點(diǎn)提交作業(yè),無需登陸到計算結(jié)點(diǎn)使用LJRS提交串行作業(yè)1)在普通用戶下設(shè)置好LJRS的路徑變量2)編寫作業(yè)提交腳本[xyy@c0102lamrun]$catgaussrun.sh#!/bin/bashg98test397.comtest397.o

4、ut!普通的腳本3)qsubgaussrun.sh在提交提交作業(yè)的目錄下會生成gaussrun.sh.e#和gaussrun.sh.o#兩個標(biāo)準(zhǔn)輸出和錯誤輸出文件。#是當(dāng)前作業(yè)號5.如何使用LJRS作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)使用LJRS提交MPICH并行作業(yè)編輯文件腳本run.sh,然后qsubrun.sh#!/bin/bash###Jobname#LJRS-Ntest###Queuename#LJRS-qdpool###Numberofnodes#LJRS-lnodes=9:ppn=2#Thisjob'sworkingdirectorycd$LJRS_O_WORKDIR#Definenumbe

5、rofprocessorsNPROCS=`wc-l<$LJRS_NODEFILE`echoThisjobhasallocated$NPROCSnodes#changec0101tog0101,etc..cat$LJRS_NODEFILE

6、seds/c/g/>temphostlist#RuntheparallelMPIexecutablea.out/export/mpi/mpich/bin/mpirun-v-nolocal-machinefiletemphostlist-np$NPROCSxhpl#deletethetempfilerm-rftemphostlist6.實(shí)現(xiàn)機(jī)群系統(tǒng)并

7、行命令的腳本寫一個并行腳本ido.sh#!/bin/bashforiin`cat$1`doecho”---------------$i----------------------”rsh$i$2done提供hosts列表文件hostsc4c0101c0102c0103c0104第一個參數(shù)$1表示使用哪個hosts列表第二個參數(shù)$2表示要執(zhí)行的命令,如果命令中有空格,用引號””將命令括起來參數(shù)$i表示遍歷hosts列表中的節(jié)點(diǎn)名稱例如我們要察看前四個節(jié)點(diǎn)的/etc/yp.conf文件,使用命令./ido.shhostsc4“cat/etc/yp.conf”./ido.shhostsc

8、4“ps–uroot”./ido.shhostsc4“rcpconsole:/root/file/root”7.機(jī)群上下電順序上電:開機(jī)順序?yàn)閏onsole->計算節(jié)點(diǎn);1)打開機(jī)柜底部電源開關(guān)2)手動按console節(jié)點(diǎn)前面板開關(guān),給console節(jié)點(diǎn)加電3)管理節(jié)點(diǎn)啟動開始引導(dǎo)Linux后,依次給c0101-c0XXX加電(每個節(jié)點(diǎn)計算結(jié)點(diǎn)加電時間隔1、2秒鐘)4)啟動作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)start_ljrs下電:關(guān)機(jī)順序?yàn)橛嬎愎?jié)點(diǎn)->console1)使用LCSM系統(tǒng)給

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