中醫(yī)藥本體工程研究現(xiàn)狀

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1、中醫(yī)藥本體工程研究現(xiàn)狀關(guān)鍵詞：屮醫(yī)藥；本體工程；本體；語義網(wǎng)；綜述DOI：10.3969/j.issn.1005-5304.2013.07.051中圖分類號(hào)：R2-03文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：A文章編號(hào)：1005-5304(2013)07-0110-03本體(Ontology)是針對(duì)領(lǐng)域概念體系的精確規(guī)范，用以指明概念的定義以及概念之間的語義關(guān)系。它能使交互各方對(duì)特定領(lǐng)域內(nèi)共用的概念、詞匯以及概念分類達(dá)成一致,支持知識(shí)的共享和重用,解決系統(tǒng)Z間的互操作問題。近年來，本體工程成為中醫(yī)夯領(lǐng)域廣泛關(guān)注的研究熱點(diǎn)[l]o筆者

2、I韋I繞中醫(yī)藥本體工程，通過查閱近10年相關(guān)文獻(xiàn)，探討中醫(yī)藥本體工程的方法、技術(shù)、覆蓋范圍和應(yīng)用，以期為屮醫(yī)藥本體開發(fā)人員提供參考。1概述中醫(yī)夯學(xué)歷經(jīng)數(shù)千年的發(fā)展，形成了一套完整的知識(shí)體系。中醫(yī)藥信息學(xué)的一個(gè)核心任務(wù)，是實(shí)現(xiàn)中醫(yī)藥知識(shí)體系的數(shù)字化，從而面向中醫(yī)團(tuán)體提供準(zhǔn)確、詳實(shí)的知識(shí)服務(wù)。屮醫(yī)藥知識(shí)資源具冇鮮明的屮國文化特征,包含大量古漢語成分，難以精確描述。現(xiàn)代醫(yī)學(xué)所使用的知識(shí)建模方法并不完全適合于中醫(yī)藥領(lǐng)域。因此，迫切需要提岀創(chuàng)新的知識(shí)建模方法，以支持中醫(yī)夯知識(shí)的數(shù)字化建設(shè)。近年來，學(xué)者們開始嘗試基于

3、領(lǐng)域本體，研制符合中醫(yī)藥領(lǐng)域特點(diǎn)的知識(shí)表達(dá)框架，解決中醫(yī)學(xué)知識(shí)的獲取、分析和推理等問題，包括在國家知識(shí)基礎(chǔ)設(shè)施(NationalKnowledgeInfrastructure,NKI)的建設(shè)過程屮，構(gòu)建了屮醫(yī)領(lǐng)域本體，如屮醫(yī)診斷方法、屮醫(yī)術(shù)語、屮醫(yī)證候、屮醫(yī)脈象、中醫(yī)病機(jī)等30多個(gè)中醫(yī)木體類，用于實(shí)現(xiàn)中醫(yī)學(xué)知識(shí)的獲取、分析和推理［2-3］o尹氏等［4］針對(duì)中醫(yī)藥術(shù)語標(biāo)準(zhǔn)化過程中面臨的問題，使用本體工程方法，研制了中醫(yī)藥學(xué)語言系統(tǒng)(TCMLS)o此外，本體述被用于陰陽理論［5］、五行理論［6］、中醫(yī)診斷［7

4、］、證候?qū)W［8］、基金項(xiàng)目:國家科技重大專項(xiàng)-重大新藥創(chuàng)制(2009ZX09301-005-01)；國家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(2006AA01A122)；第52批中國博士后科學(xué)基金面上項(xiàng)目(2012M520559)；中國中醫(yī)科學(xué)院基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)口主選題項(xiàng)目(zz060303)通訊作者：崔蒙，E-mail：cui@mail.cintcm.ac.cn中藥學(xué)⑼、方劑學(xué)［10］、治則治法［11］、針灸學(xué)［12］、中醫(yī)古籍［13］等領(lǐng)域的知識(shí)建模和知識(shí)獲取。這些研究表明，領(lǐng)域木體為中醫(yī)藥知識(shí)體系的形式化表達(dá)和系統(tǒng)管理

5、提供了一種有效手段。2中醫(yī)約本體工程方法學(xué)研究本體工程多是面向特定領(lǐng)域開展的，其方法在各個(gè)領(lǐng)域中不盡相同。屮醫(yī)藥領(lǐng)域的本體建設(shè)仍處于起步和探索階段，其方法學(xué)體系尚未成熟、亟待完善。日前，國內(nèi)外尚缺乏構(gòu)建中醫(yī)藥領(lǐng)域木體的成熟流程、方法和標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范。中醫(yī)藥領(lǐng)域的知識(shí)體系獨(dú)具特色，極為復(fù)雜。中醫(yī)藥本體建設(shè)必然是一項(xiàng)復(fù)雜的系統(tǒng)工程，涉及中醫(yī)團(tuán)體的廣泛參與和密切協(xié)作。若沒有合適的方法學(xué)作為指導(dǎo)，就難以在不同的本體工程中貫徹一致的設(shè)計(jì)原則，這不利于本體的規(guī)模化和互操作。因此，需要對(duì)中醫(yī)笏本體工程方法學(xué)進(jìn)行深入研究。在方

6、法學(xué)研究屮，學(xué)者們首先提出了一些構(gòu)建屮醫(yī)藥本體的基本原則。如林氏［10］提出對(duì)中醫(yī)藥概念的表達(dá)不必單純強(qiáng)求標(biāo)準(zhǔn)化和一致性，而應(yīng)在本體的啟發(fā)和應(yīng)用上，完整、忠實(shí)、準(zhǔn)確地表達(dá)中醫(yī)藥傳統(tǒng)理論的語義，并做到機(jī)讀、通用、可共享，為實(shí)現(xiàn)中醫(yī)藥資源數(shù)字化奠定基礎(chǔ)。方氏［14］提出，中醫(yī)藥木體的建立必須在深入理解中醫(yī)藥領(lǐng)域知識(shí)的基礎(chǔ)上進(jìn)行。這些原則對(duì)本體工程的實(shí)施都具有指導(dǎo)意義。本體工程方法學(xué)中的一項(xiàng)關(guān)鍵任務(wù)是頂層本體的設(shè)計(jì)。中醫(yī)頂層本體不僅為中醫(yī)本體的構(gòu)建提供了框架，而且有利于實(shí)現(xiàn)中醫(yī)本體同其他領(lǐng)域本體之間的整合，是構(gòu)

7、建完整中醫(yī)本體的基礎(chǔ)。高氏等［15］對(duì)中醫(yī)頂層本體的構(gòu)建做了初步探索，并指出中醫(yī)頂層本體必須包括一般科學(xué)的概念接口、一般生物醫(yī)學(xué)的概念接口和屮醫(yī)的最高層的抽象概念。另外，TCMLS的語義網(wǎng)絡(luò)中包括層次化的語義類型和通用的語義關(guān)系，為TCMLS的構(gòu)建提供了框架，也可被視為一個(gè)頂層本體［16］。TCMLS是在本體論指導(dǎo)下構(gòu)建的大型術(shù)語系統(tǒng)，旨在提供一套計(jì)算機(jī)化的術(shù)語系統(tǒng)，支持中醫(yī)藥數(shù)字資源的系統(tǒng)整合和深度利用，向中醫(yī)團(tuán)體提供開放、智能的知識(shí)服務(wù)［4,16］。方氏［14］提出了一套基于本體構(gòu)建TCMLS的方案，

8、其中涉及木體類及其層次結(jié)構(gòu)、語義系統(tǒng)、概念集合、術(shù)語規(guī)范、通用編碼等諸多方1何，并提出了本體規(guī)范存儲(chǔ)和查詢的方法，以幫助用戶管理和獲取中醫(yī)約信息。曾氏［17］論述了TCMLS的構(gòu)建思路、設(shè)計(jì)原則、架構(gòu)與方法，包括術(shù)語及定義的采集范圍及標(biāo)準(zhǔn)、定義類(Class)和類的層次結(jié)構(gòu)(Hierarchy).語義關(guān)系等。謝氏等［18-19］對(duì)TCMLS的語義網(wǎng)絡(luò)作了深入分析，并將其與一體化醫(yī)學(xué)語言系統(tǒng)(UMLS)的語義網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了比較研究。