細胞內(nèi)蛋白質(zhì)的定位信號序列.doc

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1、細胞內(nèi)蛋白質(zhì)的定位信號序列1.內(nèi)質(zhì)網(wǎng)信號序列(ERsignalsequence)2.駐留信號(retentionsignal):①ER駐留信號(包括KDEL即Lys-Asp-Glu-Leu和HDEI即His-Asp-Glu-Ile兩個4肽信號序列);②ER回收信號(ERretrievalsignal,可溶蛋白的KDEL和ER膜蛋白上的KKXX)3.核輸入信號(nuclearimportsignal):也稱NLS,常含Pro-Lys-Lys-Lys-Lys-Arg-Val4.核輸出信號(nuclearexportsignal):核糖體蛋白上相間排列的疏水性氨基酸5.過氧

2、化物酶體引導信號(peroxisomaltargetingsignal,PTS):C端的SKL即Ser-Lys-Leu6.轉運肽(transitpeptide):即導肽,進入線粒體蛋白的N端的帶正電的氨基酸(Arg)和不帶電的氨基酸(Ser)構成的信號序列一、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)信號肽內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白定位信號總體可以分為返回信號和保持信號。內(nèi)質(zhì)網(wǎng)逃逸的蛋白主要通過COPⅠ有被小泡將其返回內(nèi)質(zhì)網(wǎng),因此區(qū)分保持信號與返回信號一個很重要的手段是研究信號片段與運輸小泡COPⅠ各亞基的相互作用情況。例如在研究甲硫蛋白(TPN)定位信號過程中,Paulsson等通過Co-IP發(fā)現(xiàn)具有“KKXX>”序

3、列的TPN能與COPI相互作用,而C端突變后的GFP-TPN-aa不與COPI發(fā)生相互作用,提示“KKXX>”為TPN定位信號,且該信號通過COPI返回于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。蛋白轉運到高爾基體后會被修飾,人們可以利用不同的糖基程度區(qū)分保持信號與返回信號。例如在酵母[6]中,高爾基復合體有N-寡糖轉移酶(OTase活性,并可將底物蛋白α-1,6-苷露糖基化,被α-1,6-苷露糖基化的蛋白則通過返回信號返回內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。而哺乳動物[7]中運出的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白被N-已酰氨基半乳糖轉移酶(GnT)修飾和十六烷基化,然后被巖藻糖轉移酶修飾,因此可被N-乙酰氨基半乳糖(GalNAc)的親合素識別并著色

4、的蛋白為返回信號介導定位。此外,經(jīng)過高爾基體修飾的蛋白能抵抗內(nèi)切糖苷酶H(endoH)的酶切效應,因此這些蛋白的定位也依賴返回信號。1、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)定位信號如前所述,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白定位信號可分為保持信號和返回信號。保持信號中研究較多的是適用于Ⅱ型內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜蛋白的雙精氨酸信號[<X(2,3)-RR],返回蛋白研究較多的為適用于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔蛋白的“H/KDEL>”信號及適用于Ⅰ型內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜蛋白的雙賴氨酸信號(UUUX>,其中3個U中至少2個為賴氨酸,X為任意氨基酸)。1.1內(nèi)質(zhì)網(wǎng)保持信號雙精氨酸信號[<X(2,3)-RR]最早發(fā)現(xiàn)于組織相容性復合體Ⅱ(MHCⅡ),Zerangue進一步確定

5、了雙精氨酸信號的有效信息,此外該信號一般與雙亮氨酸信號并存,并在復合體的形成及轉運中起調(diào)節(jié)作用。雙精氨酸信號存在于大多數(shù)膜表面功能復合體的亞基(多為Ⅱ型跨膜蛋白)中。如G-蛋白偶聯(lián)γ-氨基異丁酸受體亞基(GABAB1)利用雙精氨酸信號定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng),當GABAB1與GABAB2結合后雙精氨酸信號被掩蓋或被去除,復合體被運出內(nèi)質(zhì)網(wǎng)并在膜表面形成功能復合體。此外TRAM、鉀離子通道亞基Kir1.1等都通過雙精氨酸信號調(diào)節(jié)膜表面功能復合體的運出。既然雙精氨酸信號主要存在于細胞膜表面功能復合體中,必然存在信號失活機制,以調(diào)節(jié)膜表面復合體的量[20]。雙精氨酸信號的失活機制可總結

6、為5種:①與復合體其他亞基形成功能復合體掩蓋雙精氨酸信號,如MHCⅡβ鏈;②通過與14-3-3家族蛋白結合,如ADAM22蛋白;③通過選擇性剪接形成能與信號區(qū)相互作用的PDZ結合結構域,如N-甲基-D-門冬氨酸受體亞基NR1-1(NMDAR)和紅藻氨酸/海藻酸受體(KAR);④通過蛋白激酶A(PKA)和蛋白激酶C(PKC)的磷酸化,如NMDA受體NR1亞基;⑤通過雙亮氨酸信號或溶酶體定位信號抵消雙精氨酸信號。由于COPⅠ在“K(X)KXX>”信號的識別與返回中起重要作用,同時α與β'亞基中的WD40結構域在識別中起重要作用,那么COPⅠ在雙精氨酸信號識別中是否具有作用

7、呢?研究表明COPⅠ復合體在某些帶有雙精氨酸信號蛋白的返回中起一定作用,但是作用并不明顯,且涉及的蛋白數(shù)量有限。Hardt等通過研究雙精氨酸信號蛋白糖基化修飾情況,發(fā)現(xiàn)僅有極少數(shù)的蛋白有糖基化修飾,證明該信號為保持信號而非返回信號。是什么機制將具有雙精氨酸信號的蛋白保留在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中,還有待進一步研究。1.2返回信號逃逸的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白進入運輸小泡并在膜囊結構中被修飾后,能介導其重新運回內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的信號稱為返回信號。1.2.1內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔蛋白的返回信號內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔蛋白返回信號的主要代表是“H/KDEL>”,在哺乳動物中為“KDEL>”,而在酵母中則為“HDEL>”。內(nèi)質(zhì)

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