資源描述：
《大豆GST基因家族全基因組篩選、分類和表達(dá)-論文.pdf》由會(huì)員上傳分享，免費(fèi)在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、分子植物育種，2013年，第11卷，第5期，第465—475頁MolecularPlantBreeding，2013，Vo1．11，No．5，465—475研究論文ResearchArticle大豆GST基因家族全基因組篩選、分類和表達(dá)江董麗1才華端木慧子朱延明：1塔里木大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院，阿拉爾，843300；2東北農(nóng)業(yè)大學(xué)生物工程基因重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，哈爾濱，150030通訊作者，ymzhu2001@neau．edu．ca摘要利用生物信息學(xué)手段，結(jié)合公共大豆基因組數(shù)據(jù)庫和大豆發(fā)育表達(dá)芯片數(shù)據(jù)獲得大豆GST家族基因序列、蛋白序列和染色體位置等信息并
2、進(jìn)一步對(duì)基因的組織表達(dá)等進(jìn)行分析。結(jié)果顯示大豆中含94個(gè)GST家族基因，根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育分析將這些GST基因分成5個(gè)亞家族；定位分析表明，94個(gè)GST基因分布于大豆的16條染色體上。表達(dá)分析結(jié)果表明，14個(gè)不同發(fā)育階段，大多成員至少在一個(gè)組織中表達(dá)，11差異表達(dá)的基因中有7在根中表達(dá)，另外4在其它部位優(yōu)勢表達(dá)，基因表達(dá)具有一定特異性。本研究為進(jìn)一步研究GST家族的功能及其抗逆利用提供基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞GST家族，全基因組篩選，分類分析，差異表達(dá)基因Genome—WideFilter，ClassificationandExpressionAnalysis
3、ofGSTGeneFamilyinSoybeanJiangDongliCaiHuaDuanmuHuiziZhuYanming’1CollegeofLifeSciences，TarimUniversity，Alar，843300；2KeyLaboratoryofArgriculturalBiologicalFunctionalGene，NortheastAgriculturalUni·versity，Harbin，150030Correspondingauthor，ymzhu2OOl@neau．edu．caDOI：10．3969／mpb．011
4、．000465AbstractBasedonbioinformaticmethods，soybeangenomedatabaseandexpressionmicroarraydata，soybeanGSTgenesfamilywereidentifiedinthisstudy．Andtheirgenesequences，proteinsequencesandchromosomelocationwereobtained．Allofninty-fourGSTgenesfromsoybeanwereclassifiedinto5subfamilie
5、saccordingtophylogeneticrelationship．Andtheyweredistributedon16chromosomes．Basedonthesoybeandevelopmentalexpressiondatabase，theexpressionpattemoftheGSTgenefamilyatdiferentdevelopmentorgansandstageswasanalyzed．Elevendiferentiallyexpressedgeneswerefotmd，andsevenofthemwerehigh
6、lyexpressedinrootateachdevelopmentalstagebymicroarray．Theywerediferentiallyexpressedindiferenttissuesanddevelopmentalstages．Theseresultsarehelpfulfortheirfunctionalanalysisandusingforcropanti-stressimprovement．KeywordsGSTfamily，Genome-widescreening，Classifyanalysis，Diferent
7、iallyexpressedgene谷胱甘肽S一轉(zhuǎn)移酶(GSTs)是一類普遍存在的的輔酶(R．x)上建立一個(gè)極性的s一谷胱甘肽反應(yīng)產(chǎn)酶，這類酶用于催化谷胱甘肽與毒性生物異源物質(zhì)物(R-SG)。谷胱甘肽S一轉(zhuǎn)移酶是一個(gè)龐大而多樣的或氧化產(chǎn)物結(jié)合，從而促進(jìn)此類物質(zhì)的代謝、區(qū)域化基因家族，根據(jù)氨基酸序列相似性將其分為tau、phi、隔離或清除(WilceandParker，1994；王臻昱等，2012)。zeta、theta、lambda和DHARf谷胱甘肽依賴的抗壞血經(jīng)典的反應(yīng)模式為，GSTs催化谷胱甘肽(一谷氨酰一酸還原酶)6個(gè)亞類，其中tau
8、和phi兩類GST在植物半胱氨酰一甘氨酸：GSH)轉(zhuǎn)移到含有活性親電中心中含量最為豐富(Dixoneta1．，2002；Jaineta1．，2010)。收稿日期：2
