大豆DGAT基因家族的鑒定和表達(dá)分析-論文.pdf

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1、中國(guó)雇c童報(bào)2013，29(12)：55—61ChineseAgriculturalScienceBulletin大豆DGAT基因家族的鑒定和表達(dá)分析劉貴芹，邵群，黃榮峰，馮獻(xiàn)忠(山東省高校系統(tǒng)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室／山東師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院，濟(jì)南250014)摘要：旨在利用生物信息學(xué)方法鑒定大豆DGAT基因，為其功能研究奠定基礎(chǔ)。通過(guò)生物信息學(xué)的方法，在全基因組水平上對(duì)大豆DGAT基因家族進(jìn)行了鑒定和分類(lèi)，并分析了其基因結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域特征、系統(tǒng)發(fā)生及基因表達(dá)方式。結(jié)果表明：大豆中存在10個(gè)DGAT家族基因，分別屬于DGAT

2、I、DGA72、DGA乃亞家族，分布在6條染色體上，其中DGATI亞家族基因主要在莖端分生組織和綠色果莢中表達(dá)；DGAT3亞家族基因主要在根中表達(dá)；而DGAT2亞家族基因表達(dá)范圍最廣，主要在根瘤、葉、花和綠色果莢中表達(dá)。大豆DGAT家族基因在結(jié)構(gòu)及表達(dá)上的差異揭示了其功能的多樣性及大豆脂肪酸代謝的復(fù)雜性，將為研究大豆的脂肪酸代謝途徑提供重要的信息。關(guān)鍵詞：脂肪酸合成；DGAT基因家族；基因結(jié)構(gòu)；基因表達(dá)中圖分類(lèi)號(hào)：$565．1文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A論文編號(hào)：2012．4153CharacterizatiOnandExpressio

3、nAnalysisofDGATGeneFamilyinSoybeanLiuGuiqin，ShaoQun，HuangRongfeng，F(xiàn)engXianzhong(KeyLaboratoryofSyste．~BiologyinUniversitiesofShandonglCollegeofLifeScience,ShandongNormalUniversity，Jinan2500141Abstract：TheaimwastoidentifytheDGATgeneinsoybeanwithbioinformaticsmethod

4、s，andprovidethebasisforstudyingitsfunction．Inthisstudy，DGATfamilygenesofsoybeanwerecharacterizedingenomewide．Theirgenestructuresandsecondarystructuresofproteins，aswellasphylogenyandexpressionpatternwerealsoinvestigated．Phylogeneticanalysischaracterized3classesofDG

5、ATgenesinsoybean，whicharebelongedtoDGAT1，DGAT2andDGAT3,andtheydistributein6chromosomesofsoybeangenome．WholegenomeexpressionanalysisrevealedthatDGAT1subfamilygenesmainlyexpressedinSAMandgreenpodwhileDGAT3subfamilygenesmainlyinroot，DGAT2familygenesbroadlyexpressedin

6、nodule，leaf,flowerandgreenpod．ThedifferenceofDGATgenestructuresandexpressionpatternssuggestedthatthefunctiondiversityandcomplexityoffattyacidmetabolism．Theseresultswillprovideimportantinformationforthefattyacidmetabolismpathwayinsoybean．Keywords：fattyacidsynthesis

7、；DGATgenefamily；genestructure；geneexpression0引言飽和、甘油三酯(TAG)的合成、多不飽和脂肪酸的形植物油脂是植物中最重要的有機(jī)化合物之一，在成、脂質(zhì)體形成等過(guò)程。合成后的植物油脂主要有兩植物生長(zhǎng)、發(fā)育和繁衍過(guò)程中扮演著重要的角色。植個(gè)去向：一是用來(lái)構(gòu)成生物膜的甘油脂和磷脂；另一個(gè)物油脂生物合成包括脂肪酸鏈的合成、終止、釋放、脫是貯藏在種子中即貯藏油脂，常以TAG的形式存在】?；痦?xiàng)目：山東省自然科學(xué)基金項(xiàng)目“大豆突變體庫(kù)的構(gòu)建及農(nóng)藝性狀相關(guān)突變體的篩選”(ZR2011CM020

8、)；濟(jì)南市科技發(fā)展計(jì)劃課題“具抗氧化功能稻米的開(kāi)發(fā)和利用研究”(201102031)。第一作者簡(jiǎn)介：劉貴芹，女，1987年出生，碩士，研究方向?yàn)橹参锇l(fā)育生物學(xué)。通信地址：250014山東省濟(jì)南市文化東路88號(hào)山東師范大學(xué)生命科學(xué)研究中心，Tel：0531-86180792，E．mail：liuguiqi