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1、第51卷第1期湖北農(nóng)業(yè)科學(xué)V0】.51No.12012年1月HubeiAgriculturalSciencesJan.,2012豌豆基因組SSR標(biāo)記在蠶豆中的通用性分析侯萬(wàn)偉,劉玉皎(青海省農(nóng)林科學(xué)院,西寧810016)摘要:分析了21對(duì)豌豆(Pisumsativum)~Lt,.因組SSR引物在10個(gè)蠶豆(Vicia0)品種中的通用性。結(jié)果表明,豌豆基因組SSR引物在蠶豆中的通用性達(dá)38.10%,有效引物在蠶豆品種中的多態(tài)性比例為100%。關(guān)鍵詞:豌豆(Pisumsativum);蠶豆(Viciafa6a);SSR;通用性中圖分類號(hào):$643文獻(xiàn)
2、標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào):0439—8114(2012)01—0185—03TransferabilityofPeaSSRMarkersinHorsebeanHOUWan-wei,LIUYu-jiao(QinghaiAcademyofAgriculture&Forestry,Xining810016,China)Abstract:Transferabilityof21pairsofSSRmarkersofpea(Pisumsativum)inhorsebean(Vieia口)wastested.Resultsshowedthatthetransfera
3、bilityrateofpeaSSRinhorsebeanwas38.10%,andpolymorphismrateofeffectiveSSRinhorse—beanwas100%.Keywords:pea(Pisumsativum);horsebean(Viciafaba);SSR;transferability簡(jiǎn)單序列重復(fù)(Simplesequencerepeats,SSR),1材料與方法是一類由1~6個(gè)堿基組成的基序(motif)串聯(lián)重復(fù)而成的DNA序列。它在真核生物的基因組中廣泛1.1試驗(yàn)材料存在,其基序兩端的序列多是相對(duì)保守的單拷貝序
4、供試蠶豆品種為:青海9號(hào)、青海1l號(hào)、青海列l(wèi)1]。與其他分子標(biāo)記相比,SSR標(biāo)記具有數(shù)量豐12號(hào)、馬牙、陵西一寸、法D、透心綠、雙“0”、湟飼、富、等位基因變異多、共顯性遺傳、重復(fù)性強(qiáng)和對(duì)基130。使用ZONG等_l7報(bào)道的2l對(duì)豌豆SSR引物因組有很好的覆蓋性等特點(diǎn),已被廣泛應(yīng)用于基因(表1).由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合定位、品種鑒定、圖譜構(gòu)建、種子純度檢測(cè)及遺傳多成。樣性分析等[2-6]。SSR引物的獲得可以通過(guò)3條途徑:1.2DNA提取與SSR分析一是在公共的序列數(shù)據(jù)庫(kù)(GenBank)里尋找微衛(wèi)星1.2.1蠶豆基因組DNA提取
5、取蠶豆幼嫩葉片約序列:二是基因組文庫(kù)的篩選;三是從近緣物種中1g,加液氮研磨至粉末狀,加入裝有0.8mLDNA提獲得已設(shè)計(jì)好的引物對(duì)l7]。為了降低SSR引物的開(kāi)取緩沖液[100mmol/LTris(pH8.0)+150mmol/L發(fā)成本,近年來(lái)很多學(xué)者對(duì)SSR引物在不同種、屬EDTA(pH8.O)+2.1mol/LNaCl+2%CTAB+2%PVP]物種間的通用性進(jìn)行了深入研究[8-161。本研究對(duì)21的1.5mL離心管中,65℃水浴45min后加入等體對(duì)豌豆(P/su,nsativum)基因組SSR引物在蠶豆中積氯仿/異戊醇(體積比為24:1
6、)混勻,12000r/min的通用性和多態(tài)性進(jìn)行初步研究,以快速找出可用離心10min,將上清液轉(zhuǎn)入另一離心管中,加入等于蠶豆(Viciafaba)遺傳多樣性分析、分子標(biāo)記輔助體積無(wú)水乙醇。冰上靜置20min,10000r/min離心育種等研究的分子標(biāo)記。5min,棄上清,用75%乙醇清洗沉淀3次,風(fēng)干后加收稿時(shí)間:2011-05~13基金項(xiàng)目:現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)(CARS一09);青海高原作物種質(zhì)資源創(chuàng)新與利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)基金:青海省高?!?35高層次人才培養(yǎng)工程”專項(xiàng)作者簡(jiǎn)介:侯萬(wàn)偉(1982_),男,青海湟源人,助理研究員,
7、碩士,主要從事作物遺傳育種研究,(電話)1373468568O(電子信箱)h0uWanwei333@163.corn;通訊作者,劉玉皎,研究員,主要從事蠶豆遺傳育種研究,(電子信箱)lyujiao2000@yahoo.com.ca。186湖北農(nóng)業(yè)科學(xué)2012正PBl4F25GAGTGAGCTrrI.I’AGCTrGCAGCCTPBl4LG—VIIPB14R22TGCTTGAGAACAGTGACTCGCAPSAA18F22CTGTAGACCAAGCCCAAAAGATPSAA18LG—II.LG—VPSAA18R22TGAGACACT兀TGACAAG
8、GAGGPSAA175F22TrGAAGGAACACAATCAGCGACPSAA175LG—III.U:一VPSAA175R22TGCG