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《番茄ssr標(biāo)記在茄子及其他茄科作物上的通用性分析》由會員上傳分享,免費(fèi)在線閱讀,更多相關(guān)內(nèi)容在學(xué)術(shù)論文-天天文庫。
1、華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報2014,35(4):56-60http:∥xuebao.scau.edu.cnJournalofSouthChinaAgriculturalUniversitydoi:10.7671/j.issn.1001-411X.2014.04.011汪國平,牛玉,汪文毅,等.番茄SSR標(biāo)記在茄子及其他茄科作物上的通用性分析[J].華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報,2014,35(4):56-60.番茄SSR標(biāo)記在茄子及其他茄科作物上的通用性分析11,2134汪國平,牛玉,汪文毅,樂素菊,林鑒榮(1華南農(nóng)業(yè)大學(xué)
2、園藝學(xué)院,廣東廣州510642;2中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶作物品種資源研究所,海南儋州571737;3仲愷農(nóng)業(yè)工程學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院,廣東廣州510225;4廣州市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院,廣東廣州510308)摘要:【目的】利用已完成測序的番茄基因組發(fā)展大量的SSR標(biāo)記,并將這些標(biāo)記轉(zhuǎn)移到茄子及其他茄科作物上,節(jié)省開發(fā)SSR標(biāo)記的成本.【方法】本研究利用近緣物種轉(zhuǎn)移法分析了番茄SSR標(biāo)記在茄子及其他茄科作物上的通用性情況.【結(jié)果和結(jié)論】1046對番茄SSR引物中有887對能在茄子基因組DNA上擴(kuò)增出產(chǎn)物,425對
3、引物擴(kuò)增出的帶型在番茄與茄子間相似程度高,標(biāo)記的通用率為40.6%;EST-SSR比基因組SSR的通用性更好,前者通用率為54.5%,后者為38.9%;414個通用SSR標(biāo)記被電子定位到番茄染色體上,不同染色體來源的標(biāo)記通用率明顯不同;93對引物在2份用于遺傳圖譜構(gòu)建的栽培茄子親本間表現(xiàn)出多態(tài)性;獲得的425對通用引物在馬鈴薯、辣椒、枸杞上通用率分別為96.2%、78.1%、54.1%.關(guān)鍵詞:番茄;茄子;SSR標(biāo)記;通用性;茄科蔬菜中圖分類號:S641.2文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A文章編號:1001-411X(
4、2014)04-0056-05TransferabilityoftomatoSSRmarkerstoeggplantsandotherSolanaceousvegetables11,2134WANGGuoping,NIUYu,WANGWenyi,YUESuju,LINJianrong(1CollegeofHorticulture,SouthChinaAgriculturalUniversity,Guangzhou510642,China;2TropicalCropsGeneticResourcesIn
5、stitute,ChineseAcademyTropicalAgriculturalSciences,Danzhou571737,China;3CollegeofLifeSciences,ZhongkaiUniversityofAgricultureandEngineering,Guangzhou510225,China;4GuangzhouAcademyofAgriculturalSciences,Guangzhou510308,China)Abstract:【Objective】Tomatogen
6、omewassequencedandalargenumberofSSRmarkerscouldbeob-tained.Cross-speciesamplificationoftomatoSSRmarkerswillbeaneconomicmethodtoaddupthenumberofrobustSSRmarkersineggplantandSolanaceousvegetables.【Method】ThisstudytestedalargesetoftomatoSSRmarkersoneggplan
7、tandotherSolanaceousvegetablesbycloserelativespeciestransfermethod.【Resultandconclusion】887outof1046testedtomatoSSRmarkerscouldsuccessfullyamplifyoneggplants,butonly425producedverysimilarbandsontomatoesandeggplants,givingatransferrateof40.6%.EST-SSRmark
8、erswerefoundtobemoretransferablethangenomicSSRmarkers(54.5and38.9%respectively).414transferableSSRmarkersweremappedelectronicallyontotomatogenomeandtheirdistributiononindividualchromosomeshighlyvaried.93SSRmarkersshowedpolymor-收稿