ssr標(biāo)記在雜交稻純度鑒定中的應(yīng)用

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1、上海農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)2013，29(6)：53—55ActaAgriculturaeShanghai文章編號(hào)：1000．3924(2013)06—053—03SSR標(biāo)記在雜交稻純度鑒定中的應(yīng)用張安寧，王加紅，余新橋，劉國(guó)蘭(上海市農(nóng)業(yè)生物基因中心，上海201106)摘要：利用分布于水稻12條染色體上的600個(gè)SSR標(biāo)記RM1～RM600對(duì)13個(gè)雜交組合的親本進(jìn)行了多態(tài)性分析，篩選出RM3、RM304和RM475組成的一組標(biāo)記，在所有供試組合的親本之間都可以檢測(cè)到多態(tài)性，進(jìn)而用這3個(gè)標(biāo)記鑒定了13個(gè)組合雜交稻種子的純度。關(guān)鍵詞：雜交稻；種子鑒定；純度檢查；SS

2、R標(biāo)記中圖分類(lèi)號(hào)：$511文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼：AApplicationofSSRmarkerstoseedpuritytestofhybridriceZHANGAn—ning，WANGJia-hong，YUXin·qiao，LIUGuo-lan(ShanghaiAgro60Z0gc＆ZGeneCenter，Shanghai201106，China)Abstract：The600SSRmarkersdistributingon12ricechromosomeswereusedtoanalyzethepolymorphismof13ricehybridizedc

3、ombinations’parents，andasetofmarkers-RM3，RM304，RM475-wereselected，bywhichthepolymorphismofallthetestcombinations’parentscouldbedetected．Further，theseedpuritiesofthe13combinationsweretestedbytheabove3markers．Keywords：Hybridrice；Seedidentification；Puritytest；SSRmarker雜交稻種子的生產(chǎn)質(zhì)量取決

4、于組合親本純度與制種過(guò)程中人工去雜等各環(huán)節(jié)的質(zhì)量。種子純度鑒定是種子生產(chǎn)單位最關(guān)注的問(wèn)題。種子純度是衡量雜交稻種質(zhì)量的重要指標(biāo)，純度不合格會(huì)對(duì)作物產(chǎn)量和質(zhì)量產(chǎn)生影響，給農(nóng)業(yè)生產(chǎn)帶來(lái)?yè)p失，致使國(guó)家和農(nóng)民的利益受到損害。低純度的種子是良種推廣、全國(guó)水稻總產(chǎn)提高的潛在障礙。以往對(duì)雜交水稻種子的真?zhèn)魏图兌辱b定通常是在海南進(jìn)行田間種植鑒定I1]，但田問(wèn)種植鑒定周期長(zhǎng)，鑒定費(fèi)用高，難以滿(mǎn)足經(jīng)營(yíng)及生產(chǎn)的需要。隨著生物技術(shù)的不斷發(fā)展，應(yīng)用分子標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行雜交稻真實(shí)性和純度鑒定已逐漸成為越來(lái)越多的雜交稻育種單位的選擇。DNA分子標(biāo)記反映了DNA水平上生物個(gè)體間的遺傳差

5、異，具有數(shù)量豐富、多態(tài)性高、不受環(huán)境影響、檢測(cè)快速等優(yōu)點(diǎn)而逐漸得到應(yīng)用_3“]。由于SSR標(biāo)記在單個(gè)座位上檢測(cè)到的多態(tài)性遠(yuǎn)高于其他幾種分子標(biāo)記，且廣泛、隨機(jī)、均勻地分布于整個(gè)基因組，具共顯性遺傳等特點(diǎn)，能準(zhǔn)確高效地鑒別大量等位基因，因此成為品種鑒定的理想分子標(biāo)記j。經(jīng)多家科研單位和學(xué)者的努力，SSR分子標(biāo)記技術(shù)在雜交水稻種子純度鑒定中已小范圍應(yīng)用于種子純度檢測(cè)實(shí)踐。彭鎖堂等[6選用分布于水稻12條染色體上的26對(duì)引物對(duì)9個(gè)雜交稻組合及其親本進(jìn)行了SSR分析，能夠有效地區(qū)分所有的恢復(fù)系和大部分不育系，并對(duì)雜交稻組合‘汕優(yōu)63’和‘兩優(yōu)培九’進(jìn)行了單粒種

6、子SSR鑒定，所測(cè)純度與田間種植鑒定純度非常接近，認(rèn)為SSR標(biāo)記適合于雜交水稻種子純度鑒定。辛業(yè)蕓等_7應(yīng)用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)5個(gè)超級(jí)雜交稻組合及其9個(gè)親本進(jìn)行了鑒定，找到在雜交稻組合及其親本間具有多態(tài)性的引物，篩選出5對(duì)引物分別作為鑒定上述5個(gè)超級(jí)雜交稻組合的特異引物。收稿日期：2012—08—15基金項(xiàng)目：上海市科技興農(nóng)重點(diǎn)攻關(guān)項(xiàng)目[滬農(nóng)科攻字(2010)第1-1號(hào)]；上海市青年科技啟明星計(jì)劃項(xiàng)目(11QA1405900)；國(guó)家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(863計(jì)劃)項(xiàng)目(2012AA101102)資助作者簡(jiǎn)介：張安寧(i983一)，男，碩士，助理研究

7、員，主要從事水稻育種研究。E·mail：zan@sagc．org．ca*通訊作者，Tel：(021)52230526；Email：lgl@sagc．org．cn54張安寧，等：SSR標(biāo)記在雜交稻純度鑒定中的應(yīng)用本研究應(yīng)用SSR標(biāo)記技術(shù)對(duì)上海市農(nóng)業(yè)生物基因中心的苗頭組合及其親本進(jìn)行了多態(tài)性檢測(cè)，快速鑒定組合純度，為雜交水稻純度簡(jiǎn)便、高效、快速鑒定提供依據(jù)。1材料與方法1．1水稻材料供試材料為上海市農(nóng)業(yè)生物基因中心2010年度小制種的13個(gè)三系雜交稻組合(‘滬旱5A’／‘旱恢3號(hào)，、‘滬旱5A'／‘旱恢31號(hào)，、‘滬旱新1A，／‘旱恢3號(hào)’、‘滬旱7A’

8、／‘旱恢3號(hào)’、‘滬旱7A’／‘旱恢9號(hào)’、‘滬旱7A，／‘旱恢21號(hào)，、‘滬旱7A’／‘旱恢31號(hào)’、‘滬