茄子SmWOX13基因的克隆、亞細(xì)胞定位及序列分析.pdf

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1、第33卷第2期上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)科學(xué)版)Vo1.33No.22015年4月JOURNALOFSHANGHAIJIAOTONGUNIVERSITY(AGRICUITURALSCIENCE)Apr.2015文章編號(hào):1671—9964(2015)02~0001—08DOI:10.3969/J.ISSN.1671—9964.2015.02.001Cloning,SubcellularLocalizationandSequenceAnalysisofUSCHEL—RelatedHomeobox13-LikeG

2、ene(SmWOX13)inEggplant(Solanummelongena)HANHong—qiang。LUYang,ZHOUZi—lu,LIUXin—yu,CHENHuo—ying(SchoolofAgricultureandBiology,ShanghaiJiaotongUniversity,Shanghai200240,China)Abstract:WUSCHEL—relatedhomeoboxgenesencodetheconservedtranscriptfactorfamilywhichp

3、laysasIgnificantroleinplantdevelopment.Inthisstudy,SmWOX13geneof1233bpeDNAincluding834bpcodingsequencewasclonedineggplant.Deducedaminoacidssequencewasusedtoanalyzetheconservatlonindifferentspeciesandtogeneratethe3Dstructure.Genestructurewasanalyzedbasedon

4、thegenomlcsequence,SubcellularlocalizationofthefusedSmWOX13一GFPproteindemonstratedthattheSmWOX13waslocatedincellnucleus.ThephylogenetictreeshowedSmWOX13belongstothegroupOftomatoWOX8geneandArabidopsisWOX13gene.AlltheresultsdemonstratedthatSmWOX13mightplaya

5、nimportantroleincontrollingthefruitshapeaspreviouslyreportedintomatoandArabidopsis.Keywords:SmWOX13;genecloning;subcellularlocalization;genestructure;phylogeny;eggplant茄子SmWOX13基因的克隆、亞細(xì)胞定位及序列分析韓洪強(qiáng),劉楊,周子路,劉新宇,陳火英(上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院,上海200240)摘要:WUSCHEL—relatedho

6、meobox基因編碼保守的轉(zhuǎn)錄因子家族在植物發(fā)育中起著非常重要的作用。本文從茄子中克隆了SmWOX13基因,該基因cDNA序列全長(zhǎng)1233bp,包含834bp編碼序列。推導(dǎo)氨基酸序列用于分析該基因的保守性及生成3D結(jié)構(gòu)。擴(kuò)增獲得的基因組序列被用于該基因結(jié)構(gòu)的分析。SmWOX13與GFP融合蛋白的亞細(xì)胞定位結(jié)果表明該蛋白被定位于細(xì)胞核。系統(tǒng)發(fā)生樹顯示茄子SmWOX13基因與番茄WOX8和擬南芥WOX13屬于同一個(gè)分支。綜上結(jié)果可表明茄子SrnWOX13基因可能與之前報(bào)道的番茄和擬南芥WOX基因類似,參與了果

7、實(shí)形狀的控制。關(guān)鍵詞:SmWOX13;基因克隆;亞細(xì)胞定位;基因結(jié)構(gòu);系統(tǒng)發(fā)生樹;茄子中圖分類號(hào):$641.1文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:AHomeobox(HB)transcriptionfactorsareapproximate60aminoacidsL一引.HBtranscriptionencodedbyhomeoboxgenes,whichcontainaclassicfactorsarefunctionallyessentialtoregulateeukaryoteDNAbindingdomain(termed

8、homeodomain)withdevelopment,whichisexemplifiedbytheprototypic收稿日期:2014—04—14基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金青年基金項(xiàng)目(31301770);國(guó)家星火(2O12GA68。0O3);上海農(nóng)委項(xiàng)目(滬農(nóng)科種字(2013)第5號(hào))作者簡(jiǎn)介:韓洪強(qiáng)(1983一),男,博士,研究方向:園藝植物生物技術(shù),E-mail:han一1983—119@163.com;陳火英(1

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