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1、核酸的分離與純化核酸的分離主要是指將核酸與蛋白質(zhì)、多糖、脂肪等生物大分子分開(kāi)。在分離核酸時(shí),應(yīng)遵循兩個(gè)原則:一是保證核酸一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性;二是盡量排除其它分子的污染,保證核酸樣品的純度。2021/8/92核酸分離與純化的過(guò)程一般都包括了材料的選擇、核酸的釋放、核酸與其它生物大分子的分離、核酸的純化與鑒定、核酸的濃縮、保存等幾個(gè)主要步驟。每一步驟又可由多種不同的方法單獨(dú)或聯(lián)合實(shí)現(xiàn)。2021/8/93一、材料的選擇臨床常見(jiàn)的標(biāo)本血液、組織及體外培養(yǎng)的細(xì)胞等都可作為提取核酸的原料,具體實(shí)驗(yàn)材料的選擇應(yīng)根據(jù)實(shí)驗(yàn)的目的來(lái)確定。2021/8/94二、核酸的釋放(一)機(jī)械法包括低滲裂解、超聲
2、裂解、微波裂解、凍融裂解和顆粒破碎等物理裂解方法。這些方法用機(jī)械力使細(xì)胞破碎,但機(jī)械力也可引起高分子量線性分子的斷裂,因而不適用于染色體DNA的分離純化。2021/8/95(二)化學(xué)法在一定的pH環(huán)境下,加入表面活性劑或強(qiáng)離子劑使細(xì)胞裂解,蛋白質(zhì)和多糖沉淀,核酸被從細(xì)胞內(nèi)釋放出來(lái)。向緩沖液中加入一些金屬離子螯合劑抑制核酸酶的活性,保護(hù)核酸不被降解。2021/8/96(三)酶法通過(guò)加入溶菌酶或蛋白酶(如蛋白酶K)使細(xì)胞破裂,核酸釋放。蛋白酶還能降解與核酸結(jié)合的蛋白質(zhì),促進(jìn)核酸的分離。溶菌酶能催化細(xì)菌細(xì)胞壁的蛋白多糖N-乙酰葡糖胺和N-乙酰胞壁酸殘基間的β-1,4鍵水解。蛋白酶K能
3、催化水解多種肽鍵,且在65℃及有EDTA、尿素和去垢劑如0.5%SDS或1%TritonX-100存在時(shí)仍保留有酶活性,對(duì)于高分子量核酸的提取有很大的優(yōu)勢(shì)。2021/8/97三、核酸的分離與純化(一)核酸分離純化的基本方法1.酚抽提法細(xì)胞裂解后離心分離含核酸的水相,加入等體積的酚∶氯仿∶異戊醇混合液,混勻后離心分離。蛋白質(zhì)被分配至有機(jī)相,核酸則被留于上層水相。在含核酸的水相中加入醋酸鉀或醋酸鈉,形成核酸鹽,核酸鹽可被一些有機(jī)溶劑沉淀,離心得到的核酸可以用70%乙醇洗滌以除去多余的鹽分,即可獲得一定純度的核酸。2021/8/9102.層析法包括吸附層析、親和層析、離子交換層析等。
4、因分離和純化同步進(jìn)行,并且有商品試劑盒供應(yīng)而被廣泛應(yīng)用于核酸的純化。在一定的離子環(huán)境下,核酸可被選擇性地吸附到硅土、硅膠或玻璃表面而與其他生物分子分離。2021/8/9113.密度梯度離心法雙鏈DNA、單鏈DNA、RNA和蛋白質(zhì)具有不同的密度,因而可經(jīng)密度梯度離心的方法形成不同密度的純樣品區(qū)帶,該法適用于大量核酸樣本的制備。2021/8/912氯化銫-溴化乙錠梯度平衡離心法是純化大量質(zhì)粒DNA的首選方法。氯化銫是核酸密度梯度離心的標(biāo)準(zhǔn)介質(zhì),梯度液中的溴化乙錠與核酸結(jié)合,離心后形成的核酸區(qū)帶經(jīng)紫外燈照射產(chǎn)生熒光而被檢測(cè)。用注射針頭穿刺回收后,通過(guò)透析或乙醇沉淀除去氯化銫而獲得純化
5、的核酸。2021/8/913(二)基因組DNA的分離純化生物體組織細(xì)胞玻棒纏繞法酚抽提法基因組DNA粗品PFGE分離特定的DNA片段AGE分離PAGE分離乙醇沉淀洗滌基因組DNA純品精分離粗分離前處理離子交換層析純化有機(jī)溶劑抽提細(xì)胞裂解蛋白質(zhì)變性沉淀降解DNA釋放甲酰胺解聚法哺乳動(dòng)物基因組DNA分離純化的一般技術(shù)路線1.酚抽提法以含EDTA、SDS及無(wú)DNA酶的RNA酶裂解緩沖液裂解細(xì)胞,經(jīng)蛋白酶K處理后,用pH8.0的Tris飽和酚抽提DNA,重復(fù)抽提至一定純度后,根據(jù)不同需要行透析或沉淀處理,獲得所需的DNA樣品。2021/8/916DNA酚抽提法示意圖一、酚抽提法2021
6、/8/917主要試劑的作用:EDTA:二價(jià)金屬螯合劑,抑制核酸酶;降低細(xì)胞膜的穩(wěn)定性2021/8/918SDS的作用:溶解膜蛋白和脂肪,從而使細(xì)胞膜破裂;溶解核膜和核小體,使其解聚,將核酸釋放出來(lái);對(duì)RNA、DNA酶有抑制作用;與蛋白質(zhì)形成復(fù)合物,使蛋白質(zhì)變性。2021/8/919蛋白酶K:水解蛋白質(zhì)的作用,消化DNA酶和細(xì)胞中的蛋白質(zhì)。蛋白酶K與其他蛋白酶相比,它具有更強(qiáng)的水解能力,而且在SDS、EDTA存在時(shí)仍保持較高活性,可同時(shí)使用。2021/8/920酚可以使蛋白質(zhì)變性沉淀、抑制DNA酶活性。PH8.0的Tris溶液可以使得抽提出的DNA進(jìn)入水相,減少在蛋白質(zhì)層滯留。在
7、酚或酚-氯仿中加入少許的異戊醇,是可以減少實(shí)驗(yàn)中的氣泡的產(chǎn)生,而且利于分相,保持分相的穩(wěn)定性。2021/8/921為什么苯酚要重蒸飽和后才能用于DNA的分離?苯酚在空氣中經(jīng)常被氧化生成醌,它能夠產(chǎn)生自由基,如果直接用于DNA分離,會(huì)使磷酸二酯鍵斷裂,造成DNA降解。氧化苯酚需要經(jīng)過(guò)高溫重蒸以除去氧化物,并用Tris-Hcl飽和酚,并調(diào)節(jié)至中性。使用飽和酚可以減少酚吸收更多的DNA,降低DNA的損失率。2021/8/9222.甲酰胺解聚法細(xì)胞裂解與蛋白質(zhì)水解同酚抽提法相似,但不進(jìn)行酚的抽提,而