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1、Westernblotting基本原理和實(shí)驗(yàn)步驟為什么要做蛋白質(zhì)印跡實(shí)驗(yàn)?研究一些體外的蛋白質(zhì)分子,尋找目的蛋白是否存在樣品當(dāng)中蛋白質(zhì)的表達(dá)情況,上調(diào)或下調(diào)表達(dá),在不同的樣品中,樣品之間的表達(dá)差異性。目錄1Westernblot基本原理2蛋白免疫印跡的組成3Westernblot一般流程4Westernblot常見問題分析1WesternBlot基本原理WesternBlot采用的是聚丙烯酰胺凝膠電泳,被檢測物是蛋白質(zhì),“探針”是抗體,“顯色”用標(biāo)記的二抗。SDS-PAGE可對(duì)蛋白質(zhì)樣品進(jìn)行分離,轉(zhuǎn)移到固相載體——例如PVDF膜上。固相載體可以吸
2、附蛋白質(zhì),并保持電泳分離的多肽類型及其生物學(xué)活性不變。轉(zhuǎn)移后的PVDF膜就稱為一個(gè)印跡(blot),用蛋白溶液(如5%BSA或脫脂奶粉溶液)處理,封閉PVDF膜上的疏水結(jié)合位點(diǎn)。用目標(biāo)蛋白的抗體(一抗)處理PVDF膜——只有待研究的蛋白質(zhì)才能與一抗特異結(jié)合形成抗原抗體復(fù)合物,這樣清洗除去未結(jié)合的一抗后,只有在目標(biāo)蛋白的位置上結(jié)合著一抗。用一抗處理過的PVDF膜再用標(biāo)記的二抗處理,二抗是指一抗的抗體,如一抗是從鼠中獲得的,則二抗就是抗鼠IgG的抗體。處理后,帶有標(biāo)記的二抗與一抗結(jié)合形成抗體復(fù)合物可以指示一抗的位置,即是待研究的蛋白質(zhì)的位置。2組成蛋
3、白免疫印跡(Westernblotting或Immunoblotting)一般由凝膠電泳、樣品的印跡和免疫學(xué)檢測三個(gè)部分組成。第一步:是做SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳,使待測樣品中的蛋白質(zhì)按分子量大小在凝膠中分成帶。第二步:把凝膠中已分成條帶的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到一種固相支持物上,用得最多的材料是硝酸纖維素膜(NC膜)和PVDF膜,蛋白轉(zhuǎn)移的方法多用電泳轉(zhuǎn)移(轉(zhuǎn)移電泳),它又有半干法和濕法之分,電轉(zhuǎn)移主要方法有垂直的槽式和水平的半干式兩種。第三步:是用自特異性的抗體檢測出已經(jīng)印跡在膜上的所要研究的相應(yīng)抗原。免疫檢測的方法可以是直接的和間接的?,F(xiàn)在多用間接免疫
4、酶標(biāo)的方法,在用特異性的第一抗體雜交結(jié)合后,再用酶標(biāo)的第二抗體(堿性磷酸酶(知AP)或辣根過氧化物酶(HRP)標(biāo)記的抗第一抗體的抗體)雜交結(jié)合,再加酶的底物顯色或者通過膜上的顏色或X光底片上暴光的條帶來道顯示抗原的存在。該技術(shù)被廣泛應(yīng)用于蛋白表達(dá)水平的檢測中。3Westernblot流程圖WesternBlot一般流程1蛋白樣品的制備SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳轉(zhuǎn)膜封閉一抗雜交洗膜二抗雜交洗膜底物顯色蛋白樣品的制備21、細(xì)胞的處理:1、細(xì)胞計(jì)數(shù),取5*10^4/well,500g離心5min。加入200ulPBS混勻,500g離心5min。去掉廢液加
5、入15ulPBS再加入5ul5Xloadingbuffer,100C煮沸10min,冰上放置5min,稍離心。2、分泌蛋白的提取:取15ul細(xì)胞上清,加入5ul5Xloadingbuffer,100C煮沸10min,冰上放置5min,稍離心。3SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳4分離膠濃度與蛋白分離范圍5制膠1)裝好架子,固定好玻璃板。2)注水試漏。3)倒水,甩干,用濾紙吸凈殘留水份。4)按照下面配方配制12%分離膠。一般1.5玻璃板需膠6.5-7ml,1.0玻璃板需膠4.5ml。5)將膠慢慢倒入,防止有氣泡產(chǎn)生。6)在膠上面加入一層蒸餾水,可以將膠里的氣
6、泡壓出、將膠面壓平并防止頂層膠風(fēng)干。7)待分離膠凝集后(至少20度,30min),配制濃縮膠5%。6制膠過程注意事項(xiàng)操作時(shí)要使兩玻璃對(duì)其,以免漏膠加完分離膠后,加水液封時(shí)要很慢,否則膠會(huì)被沖變型。灌膠時(shí)開始可快一些,膠面快到所需高度時(shí)要放慢速度。操作時(shí)膠一定要沿玻璃板流下,這樣膠中才不會(huì)有氣泡。分離膠充分凝固就倒去膠上層水并用吸水紙將水吸干。插梳子時(shí)要使梳子保持水平。7上樣與電泳將制備好的樣品溶解后,把蛋白樣品直接上樣到SDS-PAGE膠加樣孔內(nèi)即可。濃縮膠用70V電壓,當(dāng)樣品至分離膠時(shí),用120V電壓,至溴酚蘭跑到底時(shí)停止電泳。電泳時(shí)常遇到的問
7、題︶條帶呈笑臉狀,原因:凝膠不均勻冷卻,中間冷卻不好。︵條帶呈皺眉狀,可能是由于裝置不合適,特別可能是凝膠和玻璃擋板底部有氣泡,或者兩邊聚合不完全。拖尾:樣品溶解不好。紋理(縱向條紋):樣品中含有不溶性顆粒。條帶偏斜:電極不平衡或者加樣位置偏斜。條帶兩邊擴(kuò)散:加樣量過多。8轉(zhuǎn)膜在電流的作用下,使蛋白質(zhì)從膠轉(zhuǎn)移至固相載體(膜)上。膜的選擇:印跡中常用的固相材料有NC膜、DBM、DDT、尼龍膜、PVDF等。我們選用PVDF(聚偏二氟乙烯),其具有更好的蛋白吸附、物理強(qiáng)度,以及具有更好的化學(xué)兼容性。有兩種規(guī)格:Immobilon-P(0.45
8、um)和Immobilon-PSQ(0.2umforMW<20kDa)。槽式濕轉(zhuǎn)法將凝膠和固相基質(zhì)夾在濾紙中間,浸泡在轉(zhuǎn)移裝置的緩沖液中