利用ssr分子標(biāo)記進(jìn)行棉花品種鑒定的研究

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1、棉花學(xué)報CottonScience2014袁26淵6冤院483~491利用SSR分子標(biāo)記進(jìn)行棉花品種鑒定的研究1,23*222313*張小娟袁陸徐忠袁何團(tuán)結(jié)袁路曦結(jié)袁鄭曙峰袁倪金龍袁張冰清袁楊劍波淵1.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)袁合肥230031曰2.安徽省農(nóng)科院棉花研究所袁安慶246003曰3.安徽省農(nóng)科院水稻研究所袁合肥230031冤摘要院利用均勻分布于棉花26條染色體上的39對SSR核心引物對16個不同來源的棉花品種樣品進(jìn)行區(qū)別與鑒定實驗袁探討了棉花品種鑒定的取樣方案和位點異同判讀方法遙通過比較不同取樣量樣品包含的遺傳信息袁確定了基本的取樣量袁并將樣品間位點異同類型分為相同位點堯疑似相同位點

2、和差異位點遙據(jù)此對16個品種進(jìn)行位點異同性分析袁結(jié)果表明同一品種的不同樣品間差異位點數(shù)均在0~2間袁而不同品種間的差異位點數(shù)介于5~25遙結(jié)合品種間差異位點的閾值分析袁研究認(rèn)為當(dāng)兩樣品間差異位點數(shù)>2時袁即判定為不同品種曰當(dāng)差異位點數(shù)臆2時袁即判定為近似或極近似品種遙關(guān)鍵詞院棉花曰品種鑒定曰SSR分析曰帶型差異中圖分類號院S562.02文獻(xiàn)標(biāo)志碼院A文章編號院1002-7807淵2014)06-0483-091,23*22231ZhangXiaojuan,LuXuzhong,HeTuanjie,LuXijie,ZhengShufeng,NiJinlong,ZhangBingqing,

3、3*YangJianbo(1.230031,;2.,246003,;3.230031,)Toassessthesamplingmodeandsitedeterminationmethodsforidentifyingcottonvarieties,39pairsofSSRprimersdistributedevenlyonthe26chromosomesofcottonwerescreenedin16cottonvarieties,andshowedhighpolymorphismandgoodrepeatability.Thebasicsamplingamountwasdeterm

4、inedbycomparingthegeneticinformationofdifferentsamplingmodes.Thesiteswereclassifiedintothreetypes:thesamelocus,thesuspectedsamelocus,andthediscrepantlocus,accordingtothesimilaritiesanddifferencesofsites.Thesimilaritiesanddifferencesofsitesinthe16varietieswereanalyzedusingtheabovescheme.Theresul

5、tsshowedthatthenumberofdiscrepantlociforthesamevarietywasbetween0and2,andthenumberfordifferentvarietiesrangedfrom5to25.Basedontheanalysisofthediscrepantlocusthresholdbetweendifferentvarieties,samplescanbedeterminedtobedifferentwhenthenumberofdiscrepantlociismorethan2,andsimilarwhentherearefewer

6、than2discrepantloci.cotton;varietyidentification;SSRanalysis;discrepantpatterns學(xué)報頁腳[6]棉花是關(guān)系國計民生的重要經(jīng)濟(jì)作物袁優(yōu)良定的需求袁因此袁生產(chǎn)和市場迫切需要一種科學(xué)[1-2]品種是保證其優(yōu)質(zhì)堯高產(chǎn)特性的關(guān)鍵遙目前生有效的品種鑒定方法遙產(chǎn)上應(yīng)用的品種類型主要有常規(guī)棉堯雜交棉堯轉(zhuǎn)DNA分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展袁促進(jìn)了品種鑒定[3]基因抗蟲棉等遙近年來袁種子市場的快速發(fā)展袁技術(shù)的進(jìn)步遙RAPD淵Randomamplifiedpolymor-促進(jìn)了育種主體和經(jīng)營主體的多元化袁品種野套phicDNA冤堯AFLP淵

7、Amplifiedfragmentlength[4]牌冶堯野冒牌冶的現(xiàn)象也隨之出現(xiàn)袁品種權(quán)糾紛也polymorphism冤堯SSR淵Simplesequencerepeats冤等[5][7]日漸增多袁僅依靠形態(tài)學(xué)鑒定難以滿足品種鑒分子標(biāo)記相繼被用于品種鑒定袁其中SSR標(biāo)記收稿日期院2014-03-17作者簡介院張小娟(1986-),女,碩士研究生,zhangxiaojuanah@163.com曰*通訊作者,yjian-bo@263.net;luxuzhon

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