菜豆種質資源的issr分析及特異性標記的篩選

菜豆種質資源的issr分析及特異性標記的篩選

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1、吉林農業(yè)科學2014,39(2):28-32,50JournalofJilinAgriculturalSciences文章編號:1003-8701(2014)02-0028-05菜豆種質資源的ISSR分析及特異性標記的篩選楊晶,張金鵬,張曉旭,毛偉東,張廣臣*(吉林農業(yè)大學園藝學院,長春130118)摘要:采用ISSR分子標記技術對吉林省各科研院所近年審定和主栽的36份菜豆種質的遺傳多樣性進行研究。從100個引物中篩選出可擴增出清晰穩(wěn)定條帶、重復性好的20個引物對36個菜豆品種的基因組DNA進行PCR擴增。采用NTSYS

2、pc2.10軟件計算遺傳相似系數(shù),利用UPGMA方法進行聚類分析。結果表明:20個引物共擴增出87條帶,其中多態(tài)性譜帶76條,多態(tài)性比率為87.36%,多態(tài)性較高。36個品種間遺傳相似系數(shù)在0.65~0.89之間。利用UPGMA法可將供試菜豆分為4大類,聚類結果顯示,菜豆種質資源間的親緣關系與來源地的相關性較為緊密,20號菜豆與其他品種的遺傳距離相對較遠。引物840為20號品種的特異性標記,在1100bp處多出一條譜帶;引物861為27號品種的特異性標記,在1000bp處有一條譜帶缺失;引物846為31號品種的特異性標記

3、,在1050bp處有一條譜帶缺失。3個引物針對20、27、31號品種的特異性標記可將3個品種快速從所有供試的36個菜豆品種中鑒別出來。關鍵詞:菜豆;ISSR;親緣關系;遺傳多樣性中圖分類號:S643.1文獻標識碼:AAnalysisofCommonBeanGermplasmsUsingISSRandScreeningofSpecificMarkersYANGJing,ZHANGJing-peng,ZHANGXiao-xu,MAOWei-dong,ZHANGGuang-chen*(CollegeofHorticulture

4、,JilinAgriculturalUniversity,Changchun130118,China)Abstract:ISSRmarkerwasusedtoidentifythegeneticdiversityandrelationshipof36commonbeancultivarscollectedfromthescientificresearchinstitutesinJilinProvince.20primerswerescreenedoutfromthe100ISSRprimers.Thegeneticsim

5、ilaritycoefficientswerecalculatedwithNTSYSpc2.10andtheclusteranalysiswasconductedbyUPGMA.Theresultsshowedthat87DNAfragmentswereamplifiedbyPCR,a-mongwhich76oneswerepolymorphicandthepolymorphismfrequencywas87.36%.Theresultsshowedthattherewasrelativelyhighgeneticdiv

6、ersityamongtheaccessions.Thevaluesofgeneticsimilaritycoefficientsamongtheaccessionswerebetween0.65and0.89.The36commonbeanaccessionsweredividedintofourgroupsbyUPGMA,theclusteranalysisconductedwithUPGMAshowedthattheclusteringresultswerecloselycorrelatedwiththesourc

7、eofcommonbeanandthegeneticdistancebetweencultivarNo.20andothercultivarswasrelativelyremote.ThespecificmakersofcultivarNo.20basedonprimer840amplifiedanextrabandin1100bp,thespecificmakersofcultivarNo.27basedonprimer861amplifiedanabsentbandin1000bp,andthespecificmak

8、ersofcultivarNo.30basedonprimer846amplifiedanabsentbandin1050bp.3specificmakerscouldquicklyidentifycultivarno.20,No.27andNo.31fromallthe36commonbeanvarieties.K

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