番茄黃化曲葉病毒基因間區(qū)缺失突變體在北京的發(fā)現(xiàn)與證實(shí)

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1、園藝學(xué)報(bào),2015,42(8):1591–1598.ActaHorticulturaeSinicadoi:10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0058;http://www.ahs.ac.cn1591番茄黃化曲葉病毒基因間區(qū)缺失突變體在北京的發(fā)現(xiàn)與證實(shí)1,*1,2,*22232,**趙宇楠,程曉龍,趙萍萍,陳亞萍,蘆佳,李常保,姚磊12(沈陽工業(yè)大學(xué)電氣工程學(xué)院,沈陽110870;北京市農(nóng)林科學(xué)院農(nóng)業(yè)生物技術(shù)研究中心,農(nóng)業(yè)基因資源與生物技3術(shù)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京100097;北京市農(nóng)林科學(xué)院蔬菜研究中心,北京100097)摘要:在北京發(fā)現(xiàn)兩種致病性有差異的番茄

2、黃化曲葉病毒(Tomatoyellowleafcurlvirus,TYLCV)毒株,得到兩個(gè)不同的TYLCV分離物BJ03和BJ04,并對它們進(jìn)行了全長擴(kuò)增測序。TYLCV-BJ03全長為2781bp,TYLCV-BJ04全長為2740bp。進(jìn)化樹分析顯示,這兩個(gè)毒株分別屬于以色列株系TYLCV-IL進(jìn)化分支下中國的兩個(gè)不同亞群。二者核酸序列的同源性為99.15%,主要差異在基因間區(qū)(intergenicregion,IR)。BJ04比BJ03的IR區(qū)在互補(bǔ)鏈方向TATA-box與保守的9核苷酸序列之間缺失41個(gè)堿基。通過針對缺失片段設(shè)計(jì)的特異引物驗(yàn)證,進(jìn)一步證實(shí)了TYLCV的IR區(qū)缺失

3、突變體的存在。在對溫室中不同發(fā)病番茄樣本的檢測中,同時(shí)檢測到被兩種毒株單獨(dú)侵染和復(fù)合侵染的植株。關(guān)鍵詞:番茄;番茄黃化曲葉病毒;基因間區(qū);序列缺失中圖分類號:S641.2文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A文章編號:0513-353X(2015)08-1591-08IdentificateIntergenicRegionDeletionofTomatoyellowleafcurlvirusIsolatedfromBeijing1,*1,2,*2223ZHAOYu-nan,CHENGXiao-long,ZHAOPing-ping,CHENYa-ping,LUJia,LIChang-bao,2,**andYAOL

4、ei12(SchoolofElectricalEngineering,ShenyangUniversityofTechnology,Shenyang110870,China;BeijingAgro-BiotechnologyResearchCenter,BeijingAcademyofAgricultureandForestry,BeijingKeyLaboratoryofAgricultural3GeneticResourcesandBiotechnology,Beijing100097,China;BeijingVegetableResearchCenter,BeijingAcade

5、myofAgricultureandForestry,Beijing100097,China)Abstract:TwodistinctpathogenicityTomatoyellowleafcurlvirusisolatesfromthegreenhouseofBeijingwereobserved,termedBJ03andBJ04respectively.ThefulllonggenomicsequencesofthesetwoTYLCVisolatesweresequenced;TYLCV-BJ03is2781bp,andTYLCV-BJ04is2740bp.Themolecul

6、eevolutionrevealsthatthesetwoisolatesbelongtotwodifferentChinesegroupofarecentevolutionbranchofIsraelstrainTYLCY-IL.Theyshared99.15%ntidentity.Themaindifferencebetweenthesetwoisolatesistheintergenicregion(IR).TheBJ04isolatecontaineda41-ntdeletionintheintergenicregionbetween收稿日期:2015–05–27;修回日期:20

7、15–07–30基金項(xiàng)目:北京市農(nóng)林科學(xué)院科技創(chuàng)新能力建設(shè)專項(xiàng)(KJCX20140202);北京市科技計(jì)劃項(xiàng)目(D151100004515003);國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31471881)*對本文同等貢獻(xiàn)**通信作者Authorforcorrespondence(E-mail:yaolei@baafs.net.cn)ZhaoYu-nan,ChengXiao-long,ZhaoPing-ping,ChenYa-ping,LuJia,L

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