質(zhì)粒dna的提取、純化和電泳檢測(cè)

質(zhì)粒dna的提取、純化和電泳檢測(cè)

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1、質(zhì)粒DNA的提取、純化和電泳檢測(cè)姓名學(xué)號(hào)同組人班級(jí)實(shí)驗(yàn)時(shí)間摘要:質(zhì)粒是細(xì)菌細(xì)胞中與主染色體共存、可自主復(fù)制的一段大多數(shù)呈環(huán)形的DNA,它是基因工程中一種非常重要的載體。質(zhì)粒DNA的提取成為分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室一項(xiàng)最基本的工作。堿變性提取法是一種應(yīng)用最為廣泛的制備質(zhì)粒DNA的方法。電泳是帶電物質(zhì)在電場(chǎng)中向著與其電荷相反的電極移動(dòng)的現(xiàn)象。凝膠電泳可用于分離、鑒定和純化DNA片段,是分子生物學(xué)的核心技術(shù)之一。本次實(shí)驗(yàn)利用堿變法對(duì)E.coliDH5受體菌中質(zhì)粒pUC19的DNA進(jìn)行提取、純化和電泳檢測(cè),旨在學(xué)習(xí)并掌握質(zhì)

2、粒DNA提取的原理、純化及瓊脂糖凝膠電泳技術(shù)。通過此次實(shí)驗(yàn),我們達(dá)到了預(yù)期效果。關(guān)鍵詞:質(zhì)粒DNA、堿變性提取法、質(zhì)粒DNA的純化、DNA凝膠電泳1.引言質(zhì)粒是細(xì)菌細(xì)胞中與主染色體共存、可自主復(fù)制的一段大多數(shù)呈環(huán)形的DNA。細(xì)菌質(zhì)粒的相對(duì)分子質(zhì)量大小從1kb至200kb以上不等。一些質(zhì)粒永遠(yuǎn)獨(dú)立于染色體之外,另外一些質(zhì)粒在一定條件下會(huì)可逆地整合到寄主染色體上,隨著染色體的復(fù)制而復(fù)制,并通過細(xì)胞分裂傳遞到后代。質(zhì)粒在基因工程中質(zhì)粒常被用做基因的載體。目前,已發(fā)現(xiàn)有質(zhì)粒的細(xì)菌有幾百種,已知的絕大多數(shù)的細(xì)菌質(zhì)粒都

3、是閉合環(huán)狀DNA分子(簡(jiǎn)稱cccDNA)。由于質(zhì)粒分子小、便于分離和提取的特點(diǎn),在DNA重組中,質(zhì)?;蚪?jīng)過改造后的質(zhì)??赏ㄟ^連接外源基因構(gòu)成重組體,攜帶目的基因進(jìn)入細(xì)菌、動(dòng)物細(xì)胞或植物體內(nèi)進(jìn)行擴(kuò)增與表達(dá),因此質(zhì)粒是基因工程中一種非常重要的載體。質(zhì)粒特征的分析已被廣泛用于細(xì)菌種屬鑒定、耐藥性、毒力及同源性分析。近年來由于基因芯片技術(shù)的出現(xiàn),質(zhì)?;蛱结樀拈_發(fā)和應(yīng)用也得到了飛速的發(fā)展,所以這就要求我們從宿主細(xì)胞中提取高質(zhì)量的質(zhì)粒DNA。因此,質(zhì)粒DNA的提取成為分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室一項(xiàng)最基本的工作。提取和純化質(zhì)粒D

4、NA的方法很多,目前常用的有:堿裂解/堿變性法、煮沸法、羥基磷灰石柱層析法、EB-氯化銫密度梯度離心法和Wizard法等。其中,堿變性提取法最為經(jīng)典和常用,是一種應(yīng)用最為廣泛的制備質(zhì)粒DNA的方法,是基于染色體DNA與質(zhì)粒DNA的變性與復(fù)性的差異而達(dá)到分離目的,適用于不同量質(zhì)粒DNA的提取。該方法操作簡(jiǎn)單,易于操作,一般實(shí)驗(yàn)室均可進(jìn)行。提取的質(zhì)粒DNA純度高,可直接用于酶切、序列測(cè)定及分析。堿變性提取質(zhì)粒DNA一般包括三個(gè)基本步驟:培養(yǎng)細(xì)菌細(xì)胞以擴(kuò)增質(zhì)粒;收集和裂解細(xì)胞;分離和純化質(zhì)粒DNA。在細(xì)菌細(xì)胞中,

5、染色體DNA以雙螺旋結(jié)構(gòu)存在,質(zhì)粒DNA以共價(jià)閉合環(huán)狀形式存在。細(xì)胞破碎后,染色體DNA和質(zhì)粒DNA均被釋放出來,但是兩者變性與復(fù)性所依賴的溶pH值不同。在pH12.6的堿性條件下,染色體DNA的氫鍵斷裂,雙螺旋結(jié)構(gòu)解開而變性;質(zhì)粒DNA的大部分氫鍵斷裂,但超螺旋共價(jià)閉合環(huán)狀的兩條互補(bǔ)鏈不會(huì)完全分離。當(dāng)用pH值4.8的KAc(或NaAc)高鹽緩沖溶液調(diào)節(jié)堿性溶液至中性時(shí),變性的質(zhì)粒DNA可恢復(fù)原來的共價(jià)閉合環(huán)狀超螺旋結(jié)構(gòu)而溶解于溶液中;但染色體DNA不能復(fù)性,而是與不穩(wěn)定的大分子RNA、蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物

6、等一起形成纏連的、可見的白色絮狀沉淀。這種沉淀通過離心,與復(fù)性的溶于溶液的質(zhì)粒DNA分離。溶于上清液的質(zhì)粒DNA,可用無水乙醇和鹽溶液,使之凝聚而形成沉淀。由于DNA和RNA性質(zhì)類似,乙醇沉淀DNA的同時(shí),也伴隨著RNA沉淀,可利用RNaseA將RNA降解。質(zhì)粒DNA溶液中的RNaseA以及一些可溶性蛋白,可通過酚/氯仿抽提除去,最后獲得純度較高的質(zhì)粒DNA。電泳是帶電物質(zhì)在電場(chǎng)中向著與其電荷相反的電極移動(dòng)的現(xiàn)象。各種生物大分子在一定pH條件下,可以解離成帶電荷的離子,在電場(chǎng)中會(huì)向相反的電極移動(dòng)。凝膠是支持

7、電泳介質(zhì),它具有分子篩效應(yīng)。含有電解液的凝膠在電場(chǎng)中,其中的電離子會(huì)發(fā)生移動(dòng),移動(dòng)的速度可因帶電離子的大小、形態(tài)及電荷量的不同而有差異。利用移動(dòng)速度差異,就可以區(qū)別各種大小不同的分子。因而,凝膠電泳可用于分離、鑒定和純化DNA片段,是分子生物學(xué)的核心技術(shù)之一。凝膠電泳技術(shù)操作簡(jiǎn)單而迅速,分辨率高,分辨范圍極廣。此外,凝膠中DNA的位置可以用低濃度熒光插入染料如EB染色直接觀察到,甚至含量少至20pg的雙鏈DNA在紫外激發(fā)下也能直接檢測(cè)到。溴化乙錠(EB)是一種具扁平分子的核酸染料,可以插入到DNA或RNA分

8、子的堿基之間,并在300nm波長(zhǎng)的紫外光照射下放射出熒光,所以可用來顯現(xiàn)凝膠中的核酸分子。在適當(dāng)?shù)娜旧珬l件下,熒光的強(qiáng)度是同DNA片段的大小(或數(shù)量)成正比。核酸在溶液中由于磷酸基而帶負(fù)電荷,在電場(chǎng)中向正極移動(dòng)。DNA在瓊脂糖凝膠中的電泳遷移速率主要取決于下面六個(gè)因素:(1)樣品DNA分子的大?。弘娪緯r(shí),線性雙螺旋DNA分子是以頭尾位向前遷移的,其遷移速度與分子量(所含堿基)的對(duì)數(shù)值成反比,這是因?yàn)榇蠓肿佑懈蟮?/p>

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