資源描述:
《微衛(wèi)星和線粒體控制區(qū)序列分析哲羅野生群體的遺傳多樣性》由會員上傳分享,免費在線閱讀,更多相關內容在學術論文-天天文庫。
1、學校代碼:10264研究生學號:M090101045上海海洋大學碩士學位論文題目:微衛(wèi)星和線粒體控制區(qū)序列分析哲羅野生群體的遺傳多樣性英文題目:AnalysisofGeneticDiversityonSeveralWildStocksofTaimen(Huchotaimen)byMicrosatelliteMarkersandtheControlRegionofMitochondrialDNA專業(yè):水產養(yǎng)殖研究方向:水產動物遺傳與生態(tài)姓名:劉博指導教師:尹家勝二O一二年四月五日上海海洋大學學位論文原創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明:我恪守學術道德,崇尚嚴謹學風。所呈交的學位論文,是本人在導師的指
2、導下,獨立進行研究工作所取得的成果。除文中已經明確注明和引用的內容外,本論文不包含任何其他個人或集體已經發(fā)表或撰寫過的作品及成果的內容。論文為本人親自撰寫,我對所寫的內容負責,并完全意識到本聲明的法律結果由本人承擔。學位論文作者簽名:日期:年月日上海海洋大學學位論文版權使用授權書學位論文作者完全了解學校有關保留、使用學位論文的規(guī)定,同意學校保留并向國家有關部門或機構送交論文的復印件和電子版,允許論文被查閱或借閱。本人授權上海海洋大學可以將本學位論文的全部或部分內容編入有關數(shù)據庫進行檢索,可以采用影印、縮印或掃描等復制手段保存和匯編本學位論文。保密□,在年解密后適用本版權書。本學位論文
3、屬于不保密□學位論文作者簽名:指導教師簽名:日期:年月日日期:年月日上海海洋大學碩士學位論文微衛(wèi)星和線粒體控制區(qū)序列分析哲羅野生群體的遺傳多樣性摘要哲羅魚(Huchotaimen)屬鮭形目(Samoniformes)、鮭科(Salmonidea)、哲羅魚屬(Hucho),是一種大型的珍稀冷水魚類,也是一種優(yōu)良的淡水養(yǎng)殖品種。本研究利用微衛(wèi)星分子標記和D-LOOP區(qū)序列分析技術研究了黑龍江流域幾個哲羅魚野生群體的遺傳多樣性,主要包括以下研究內容:利用20對微衛(wèi)星標記對9個野生哲羅魚群體進行了分析。結果表明:9個哲羅魚群體的觀測雜合度在0.0994-0.8882之間,期望雜合度在0.20
4、05-0.8759之間,PIC指數(shù)在0.3432-0.5261之間,其中呼瑪河群體的遺傳多樣性較低。群體間的Fst在0.0246-0.2333(P<0.0001)之間,Nm在0.8216-9.9292之間,群體間遺傳分化較明顯,基因交流少;各群體間的遷移率不一致,遷入率與遷出率不對稱,有大群體向小群體遷移的趨勢;群體的同胞系比例在27.78%-90.91%之間,說明近交壓力較大,可能經歷過遺傳瓶頸或存在這樣的風險;AMOVA分析表明群體間各基因座遺傳分化系數(shù)的均值為0.1081;聚類分析和遺傳組成分析結果均顯示呼瑪河群體與烏蘇里江群體聚為一支,黑龍江中上游群體聚為一支。通過設計特異性
5、引物,采用PCR技術對10個野生哲羅魚群體共42個個體的mtDNAD-loop區(qū)序列進行擴增,測序得到的序列進行比對,發(fā)現(xiàn)該42個序列長度變異較小,選取共555bp序列進行比對分析。采用MEGA(version4.0)和DnaSP(version4.0)軟件對序列進行分析,結果顯示:42條哲羅魚線粒體D-LOOP序列中,A、T、G、C堿基的含量平均為30.2%,31.3%,15.8%和22.7%,和已報道的其他魚類的D-LOOP堿基組成類似。42個個體表現(xiàn)為28種單倍型,包括28個多態(tài)位點,單倍型多樣性指數(shù)在0.733-1.000之間,核苷酸多樣性指數(shù)(PI)在0.00156-0.0
6、1444之間。各群體的遺傳多樣性高低差別較大,其中根河群體(GH)具有較高的遺傳多樣性而虎頭江(HT)、抓吉(ZJ)、海青(HQ)、呼瑪(HM)四個江段的群體遺傳多樣性較低。42個個體的聚類分析也表明,即便是地理位置較近的群體間的基因交流也偏少,群體之間具有比較明顯的遺傳分化。I上海海洋大學碩士學位論文以上結果表明哲羅魚資源量的減少已經影響了群體間的基因交流,應該在杜絕對哲羅魚資源破壞性捕撈的同時加強群體間基因交流,并且利用遺傳多樣性較高的群體進行人工繁殖和增殖放流來提高各野生群體的遺傳多樣性,以期達到全面保護野生哲羅魚種質資源的目的。關鍵詞:哲羅魚,野生群體,微衛(wèi)星標記,D-LOO
7、P序列,遺傳多樣性II上海海洋大學碩士學位論文AnalysisofGeneticDiversityonSeveralWildStocksofTaimen(Huchotaimen)byMicrosatelliteMarkersAndtheControlRegionofMitochondrialDNAABSTRACTHuchotaimenwhichbelongstoSamoniformes,Salmonidea,Huchogenusisalargecoldwa