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《Genemapper 微衛(wèi)星分析中文操作指南》由會員上傳分享，免費在線閱讀，更多相關(guān)內(nèi)容在行業(yè)資料-天天文庫。
1、GeneMapper軟件微衛(wèi)星分析中文簡易操作手冊設(shè)定微衛(wèi)星分析方法：1.登錄軟件2.創(chuàng)建分析所需kit、panel和marker等參數(shù)；3.創(chuàng)建新文件，導(dǎo)入數(shù)據(jù)；4.設(shè)置分析參數(shù)；5.執(zhí)行初始分析；5.創(chuàng)建Bin以及BinSet；微衛(wèi)星分析流程：分析并檢查結(jié)果：1.編輯分析方法；2.分析數(shù)據(jù)；3.查看結(jié)果；打印并導(dǎo)出數(shù)據(jù)（可選）：1.打印結(jié)果；2.導(dǎo)出結(jié)果。軟件術(shù)語介紹：術(shù)語定義AnalysisParameters軟件中分析樣品所使用的特定設(shè)置；用于計算片段大小和基因型，這些特定設(shè)置包括analysismethod,sizestandard和panelbin在
2、marker內(nèi)設(shè)定等位基因的片段大小和顏色binset等位基因特定實驗條件下一組binmarker微衛(wèi)星標(biāo)記，通過位點名稱、片段大小、熒光標(biāo)記和重復(fù)長度進(jìn)行設(shè)定panelMarker組合kitpanel組合一．設(shè)定微衛(wèi)星分析方法：1.登錄GeneMapper軟件：1.1選擇開始--AllPrograms--AppliedBiosystems--GeneMapper--GeneMapper；或雙擊桌面快捷方式打開軟件；1.2登錄GeneMapper軟件：用戶名默認(rèn)為gm，在Passwprd中輸入密碼，點擊OK進(jìn)入GeneMapper軟件2創(chuàng)建分析所需kit、pan
3、el和marker等參數(shù):2.1點擊軟件上方工具欄Tools，選擇PanelManager；2.2在PanelManager對話框中，選中1PanelManager，點擊2新建Kit；于NewKit對話框中依次輸入Kit名稱，Kit類型，并點擊OK保存設(shè)置；2.3在PanelManager對話框中，選中1STRKIT，點擊2新建Panel；3中輸入Panel名稱；2.4選中1STRpanel，點擊2新建Marker，在3位置依次輸入MarkerName(Marker名稱)，DyeColor(熒光標(biāo)記種類)，MinSize，MaxSize(片段最小值和最大值)，M
4、arkerRepeat(重復(fù)次數(shù))；2.5重復(fù)2.4步驟，完成所有Marker設(shè)置，點擊OK保存；3.創(chuàng)建新文件，導(dǎo)入數(shù)據(jù)：3.1點擊1新建文件夾，在2ProjectType中文件夾類型選擇Microsatellite，點擊OK；3.2導(dǎo)入數(shù)據(jù)：點擊1AddSamplesToProject添加數(shù)據(jù)，在彈出的對話框中選擇待分析數(shù)據(jù)，通過3AddToList添加到右邊的面板中，點擊4Add完成數(shù)據(jù)添加；4.設(shè)置分析參數(shù)：4.1完成數(shù)據(jù)添加后，在1位置，AnalysisMethod中選擇NewAnalysisMethod新建分析方法；在彈出的對話框中選擇分析類型2Mi
5、crosatellite，點擊OK確認(rèn)；4.2設(shè)置分析參數(shù)：在AnalysisMethodEditor中，點擊1General，填寫2Name（分析方法名稱）；之后點擊3Allele，在將4BinSet選擇none；其它參數(shù)為軟件默認(rèn)，不需要修改；點擊OK確認(rèn)；4.3選定好之前設(shè)定的分析方法，在后續(xù)的欄目中設(shè)定Panel和SizeStandard（分子量內(nèi)標(biāo)）；4.4完成分析參數(shù)設(shè)定后，選中AnalysisMethod，Panel和SizeStandard欄目，點擊1File，選擇2FillDown；此時，AnalysisMethod，Panel和SizeSta
6、ndard欄目會使用之前選定的分析參數(shù)；也可以使用鼠標(biāo)分別選擇；4.5保存分析文件：點擊File，選擇SaveProject，輸入文件夾名稱：5.執(zhí)行初始分析：5.1點擊分析按鈕1，分析數(shù)據(jù)：5.2在1Genotypes中查看初步分析結(jié)果，或通過2DisplayPlots選項查看樣品分型圖：5.3在樣品分型圖界面中，PlotSetting選擇MicrosatelliteDefault；通過軟件上方的快捷按鈕編輯數(shù)據(jù)顯示方式：6創(chuàng)建BinSet：6.1打開Tools—PanelManager，選中1STRKit，點擊2新建BinSet，在彈出的NewBinSet對
7、話框3中輸入BinSet名稱：6.2添加參考數(shù)據(jù)：6.2.1確保1BinSet已選擇新建的BinSet，選中2STRPanel，此時會顯示出之前新建的每個Marker，點擊3AddReferenceData添加參考數(shù)據(jù)；6.2.3在AddMicrosatelliteReferenceData對話框中，選擇1參考數(shù)據(jù)，通過2AddToList添加至右面的面板中，點擊3Add，完成添加：6.3生成BinSet：完成參考數(shù)據(jù)添加后，點擊1AutoBin，之后使用軟件默認(rèn)參數(shù)，點擊2OK，自動生成BinSet：6.4編輯BinSet：分別選中每個Marker1查看其對應(yīng)
8、的Bin，選中2Bin，
